| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1038626 = | 77 (0.860) | 4 (0.050) | 4/444 | 8.2 | 4.6% | intergenic (‑35492/+14309) | unknown/unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Lys‑TTT |
| ? | 1 | 1039069 = | 90 (1.030) | intergenic (‑35935/+13866) | unknown/unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Lys‑TTT | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GTTGCAATGATGACGGATTGTGCTTTTTTAATGAGTTTGATGACAGTATTGAACTGCTTCTTCGTTTCTTTCTTGGGTGCCAGTTGCCATTGTCCCGGAATAATTGGTAAGGTTTCCAAGGACCATTTTTTCCATTCCGGCTGATATTCCTCCGGATCTAATTGCTCCACCAGATGTCCAATTCCCCAGGTGACGACGGTTTGTCCGTCCGGGGTTGCAAGGCAACCGTCACCACGTTGGTTGGCTCCTAATACTTTGGCAATGTCATTTCCCTGAGAAGGTTTTTCACAAAGATAGAGTTTCATTTTTTACCTCGCTTAAACGCATTCCAGAGAATTCAGCCAATCCGGACAAACACTAATTCGGATAAACTGCATATTAAGATCCCAGCCATAGTTATATACATTCATAGAGCTTATTGTGTTGCCAGGTAAGGTAAATTCGGGTTTCTCCTTAAATCCATATACCTCACCTGTCGGTTGTGTCGCAATATAATT > 1/1038822‑1039318 | gTTGCAATGATGACGGATTGTGCTTTTTTAATGAGTTTGATGACAGTATTGAACTGCTTCTTCGTTTCTTTCTTGGGTGCCAGTTGCCATTGTCCCGGAATAATTGGTAAGGTTTCCAAGGACCATTTTTTCCATTCCGGCTGATATTCCTCCGGATCTAATTGCTCCACCAGATGTCCAATTCCCCAGGTGACGACGGTTTGTCCGTCCGGGGTTGCAAGGCAACCGTCACCACGTTGGTTGGCTCCTaa > 1:139354/1‑251 (MQ=255) cAATGATGACGGATTGTGCTTTTTTAATGAGTTTGATGACAGTATTGAACTGCTTCTTCGTTTCTTTCTTGGGTGCCAGTTGCCATTGTCCCGGAATAATTGGTAAGGTTTCCAAGGACCATTTTTTCCATTCCGGCTGATATTCCTCCGGATCTAATTGCTCCACCAGATGTCCAATTCCCCAGGTGACGACGGTTTGTCCGTCCGGGGTTGCAAGGCAACCGTCACCACGTTGGTTGGCTCCTAATa > 1:682098/1‑249 (MQ=255) cAATGATGACGGATTGTGCTTTTTTAATGAGTTTGATGACAGTATTGAACTGCTTCTTCGTTTCTTTCTTGGGTGCCAGTTGCCATTGTCCCGGAATAATTGGTAAGGTTTCCAAGGACCATTTTTTCCATTCCGGCTGATATTCCTCCGGATCTAATTGCTCCACCAGATGTCCAATTCCCCAGGTGACGACGGTTTGTCCGTCCGGGGTTGCAAGGCAACCGTCACCACGTTGGTTGGCTCCTAATAc < 1:494314/250‑1 (MQ=255) cAATGATGACGGATTGTGCTTTTTTAATGAGTTTGATGACAGTATTGAACTGCTTCTTCGTTTCTTTCTTGGGTGCCAGTTGCCATTGTCCCGGAATAATTGGTAAGGTTTCCAAGGACCATTTTTTCCATTCCGGCTGATATTCCTCCGGATCTAATTGCTCCACCAGATGTCCAATTCCCCAGGTGACGACGGTTTGTCCGTCCGGGGTTGCAAGGCAACCGTCACCACGTTGGTTGGCTCCTAATAc < 1:779175/250‑1 (MQ=255) cAATGATGACGGATTGTGCTTTTTTAATGAGTTTGATGACAGTATTGAACTGCTTCTTCGTTTCTTTCTTGGGTGCCAGTTGCCATTGTCCCGGAATAATTGGTAAGGTTTCCAAGGACCATTTTTTCCATTCCGGCTGATATTCCTCCGGATCTAATTGCTCCACCAGATGTCCAATTCCCCAGGTGACGACGGTTTGTCCGTCCGGGGTTGCAAGGCAACCGTCACCACGTTGGTTGGCTCCTAATAc < 1:720957/250‑1 (MQ=255) cAATGATGACGGATTGTGCTTTTTTAATGAGTTTGATGACAGTATTGAACTGCTTCTTCGTTTCTTTCTTGGGTGCCAGTTGCCATTGTCCCGGAATAATTGGTAAGGTTTCCAAGGACCATTTTTTCCATTCCGGCTGATATTCCTCCGGATCTAATTGCTCCACCAGATGTCCAATTCCCCAGGTGACGACGGTTTGTCCGTCCGGGGTTGCAAGGCAACCGTCACCACGTTGGTTGGCTCCTAATACt < 1:450943/251‑1 (MQ=255) cAATGATGACGGATTGTGCTTTTTTAATGAGTTTGATGACAGTATTGAACTGCTTCTTCGTTTCTTTCTTGGGTGCCAGTTGCCATTGTCCCGGAATAATTGGTAAGGTTTCCAAGGACCATTTTTTCCATTCCGGCTGATATTCCTCCGGATCTAATTGCTCCACCAGATGTCCAATTCCCCAGGTGACGACGGTTTGTCCGTCCGGGGTTGCAAGGCAACCGTCACCACGTTGGTTGGCTCCTAATACt < 1:180674/251‑1 (MQ=255) atgaCGGATTGTGCTTTTTTAATGAGTTTGATGACAGTATTGAACTGCTTCTTCGTTTCTTTCTTGGGTGCCAGTTGCCATTGTCCCGGAATAATTGGTAAGGTTTCCAAGGACCATTTTTTCCATTCCGGCTGATATTCCTCCGGATCTAATTGCTCCACCAGATGTCCAATTCCCCAGGTGACGACGGTTTGTCCGTCCGGGGTTGCAAGGCAACCGTCACCACGTTGGTTGGCTCCTAATACTTTGGc < 1:646394/251‑1 (MQ=255) ggATTGTGCTTTTTTAATGAGTTTGATGACAGTATTGAACTGCTTCTTCGTTTCTTTCTTGGGTGCCAGTTGCCATTGTCCCGGAATAATTGGTAAGGTTTCCAAGGACCATTTTTTCCATTCCGGCTGATATTCCTCCGGATCTAATTGCTCCACCAGATGTCCAATTCCCCAGGTGACGACGGTTTGTCCGTCCGGGGTTGCAAGGCAACCGTCACCACGTTGGTTGGCTCCTAATACTTTGGCAATGt > 1:748336/1‑251 (MQ=255) gATTGTGCTTTTTTAATGAGTTTGATGACAGTATTGAACTGCTTCTTCGTTTCTTTCTTGGGTGCCAGTTGCCATTGTCCCGGAATAATTGGTAAGGTTTCCAAGGACCATTTTTTCCATTCCGGCTGATATTCCTCCGGATCTAATTGCTCCACCAGATGTCCAATTCCCCAGGTGACGACGGTTTGTCCGTCCGGGGTTGCAAGGCAACCGTCACCACGTTGGTTGGCTCCTAATACTTTGGCAATGt > 1:11132/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |