| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1038626 = | 77 (0.860) | 4 (0.050) | 4/444 | 8.2 | 4.6% | intergenic (‑35492/+14309) | unknown/unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Lys‑TTT |
| ? | 1 | 1039069 = | 90 (1.030) | intergenic (‑35935/+13866) | unknown/unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Lys‑TTT | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AACAGAGTCCGTCCTCATCACAGTGTTGCTCAGGGATAACATATTGAGCAGTAAAATTCTGTTGCCCAGAAGAGAGGAGTGCGGATAAGGTAAAATGATTTTTGGGAACAAAGTTTTGAATTTCTCTATCTCGATTGACAACTAAAGCAAGGGTAGGACTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCTAATAATTCCCGGGCGATGGTTTCACCTTCACGATCAATATCGGTTGCAATGATGACGGATTGTGCTTTTTTAATGAGTTTGATGACAGTAT > 1/1038379‑1038870 | aaCAGAGTCCGTCCTCATCACAGTGTTGCTCAGGGATAACATATTGAGCAGTAAAATTCTGTTGCCCAGAAGAGAGGAGTGCGGATAAGGTAAAATGATTTTTGGGAACAAAGTTTTGAATTTCTCTATCTCGATTGACAACTAAAGCAAGGGTAGGACTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAg > 1:366016/1‑250 (MQ=255)aaCAGAGTCCGTCCTCATCACAGTGTTGCTCAGGGATAACATATTGAGCAGTAAAATTCTGTTGCCCAGAAGAGAGGAGTGCGGATAAGGTAAAATGATTTTTGGGAACAAAGTTTTGAATTTCTCTATCTCGATTGACAACTAAAGCAAGGGTAGGACTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAg > 1:657825/1‑250 (MQ=255) agTCCGTCCTCATCACAGTGTTGCTCAGGGATAACATATTGAGCAGTAAAATTCTGTTGCCCAGAAGAGAGGAGTGCGGATAAGGTAAAATGATTTTTGGGAACAAAGTTTTGAATTTCTCTATCTCGATTGACAACTAAAGCAAGGGTAGGACTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAAt > 1:428099/1‑250 (MQ=255) tccgtccTCATCACAGTGTTGCTCAGGGATAACATATTGAGCAGTAAAATTCTGTTGCCCAGAAGAGAGGAGTGCGGATAAGGTAAAATGATTTTTGGGAACAAAGTTTTGAATTTCTCTATCTCGATTGACAACTAAAGCAAGGGTAGGACTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATc < 1:293398/249‑1 (MQ=255) cgtccTCATCACAGTGTTGCTCAGGGATAACATATTGAGCAGTAAAATTCTGTTGCCCAGAAGAGAGGAGTGCGGATAAGGTAAAATGATTTTTGGGAACAAAGTTTTGAATTTCTCTATCTCGATTGACAACTAAAGCAAGGGTAGGACTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGcc < 1:825121/251‑1 (MQ=255) gtccTCATCACAGTGTTGCTCAGGGATAACATATTGAGCAGTAAAATTCTGTTGCCCAGAAGAGAGGAGTGCGGATAAGGTAAAATGATTTTTGGGAACAAAGTTTTGAATTTCTCTATCTCGATTGACAACTAAAGCAAGGGTAGGACTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGcc > 1:196787/1‑250 (MQ=255) gtccTCATCACAGTGTTGCTCAGGGATAACATATTGAGCAGTAAAATTCTGTTGCCCAGAAGAGAGGAGTGCGGATAAGGTAAAATGATTTTTGGGAACAAAGTTTTGAATTTCTCTATCTCGATTGACAACTAAAGCAAGGGTAGGACTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGcc > 1:625194/1‑250 (MQ=255) 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aaaTTCTGTTGCCCAGAAGAGAGGAGTGCGGATAAGGTAAAATGATTTTTGGGAACAAAGTTTTGAATTTCTCTATCTCGATTGACAACTAAAGCAAGGGTAGGACTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATg < 1:514900/251‑1 (MQ=255) aaaTTCTGTTGCCCAGAAGAGAGGAGTGCGGATAAGGTAAAATGATTTTTGGGAACAAAGTTTTGAATTTCTCTATCTCGATTGACAACTAAAGCAAGGGTAGGACTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATg < 1:597599/251‑1 (MQ=255) aaTTCTGTTGCCCAGAAGAGAGGAGTGCGGATAAGGTAAAATGATTTTTGGGAACAAAGTTTTGAATTTCTCTATCTCGATTGACAACTAAAGCAAGGGTAGGACTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGa < 1:575183/251‑1 (MQ=255) 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tAGGACTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCtaa < 1:59206/250‑1 (MQ=255) gACTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCtaataa < 1:499824/250‑1 (MQ=255) aCTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCTAATAAtt > 1:734418/1‑251 (MQ=255) cTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCTAATAAtt > 1:663334/1‑250 (MQ=255) cTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCTAATAAtt > 1:526404/1‑250 (MQ=255) tttGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCTAATAATTcc < 1:425137/251‑1 (MQ=255) tttGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCTAATAATTcc < 1:341326/251‑1 (MQ=255) cGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAAtaaggctaaggc > 1:333991/1‑161 (MQ=255) aaaGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCTAATAATTCCCGGGCGATGGTTTCAcc < 1:837534/250‑1 (MQ=255) aaaGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCTAATAATTCCCGGGCGATGGTTTCAcc < 1:796880/250‑1 (MQ=255) aaaGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCTAATAATTCCCGGGCGATGGTTTCACCt < 1:522754/251‑1 (MQ=255) gCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACgg < 1:816461/105‑1 (MQ=255) gCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCTAATAATTcc > 1:849238/1‑223 (MQ=255) ttGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCTAATAATTCCCGGGCGATGGTTTCACCTTCACGATCAatat > 1:267289/1‑251 (MQ=255) gttgttgAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAAcc > 1:311998/1‑162 (MQ=255) gAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCTAATAATTCCCGGGCGATGGTTTCACCTTCACGATCAATATCGGTTGCAATGATGACg > 1:22853/1‑251 (MQ=255) cAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCTAATAATTCCCGGGCGATGGTTTCACCTTCACGATCAATATCGGTTGCAATGATGACGGATtg < 1:755927/249‑1 (MQ=255) gTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGc < 1:196437/137‑1 (MQ=255) gTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCtaataa > 1:87352/1‑188 (MQ=255) aaaTAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCTAATAATTCCCGGGCGATGGTTTCACCTTCACGATCAATATCGGTTGCAATGATGACGGATTGTGCttttt < 1:651682/251‑1 (MQ=255) aCCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCTAATAATTCCCGGGCGATGGTTTCACCTTCACGATCAATATCGGTTGCAATGATGACGGATTGTGCTTTTTTAATg < 1:59417/251‑1 (MQ=255) aCCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCTAATAATTCCCGGGCGATGGTTTCACCTTCACGATCAATATCGGTTGCAATGATGACGGATTGTGCTTTTTTAATg < 1:139012/251‑1 (MQ=255) ccAATGAGCCAATCCGCCTGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCTAATAATTCCCGGGCGATGGTTTCACCTTCACGATCAATATCGGTTGCAATGATGACGGATTGTGCTTTTTTAATGAGTTTGATGACAGTAt < 1:437219/250‑1 (MQ=255) | AACAGAGTCCGTCCTCATCACAGTGTTGCTCAGGGATAACATATTGAGCAGTAAAATTCTGTTGCCCAGAAGAGAGGAGTGCGGATAAGGTAAAATGATTTTTGGGAACAAAGTTTTGAATTTCTCTATCTCGATTGACAACTAAAGCAAGGGTAGGACTTTGCACCCGTCCCACTGAAAGCGGCTTGCCTTGGTAACCTTGTTGTTGAGCCAGCAAGGTAAATAACCGGGAAAAATTCATGCCAATGAGCCAATCCGCCCGACTACGCCCTAATCCGGCATAATATAACGGTAAGGTTTCATGATTAGGTTTCAATAAGGCTAAGGCTTTACGAATACTGACATCATCCAATGCCGATAACCAGAGGCGCTGGATCCCGCCTTTAAATCCGGCTAACTCTAATAATTCCCGGGCGATGGTTTCACCTTCACGATCAATATCGGTTGCAATGATGACGGATTGTGCTTTTTTAATGAGTTTGATGACAGTAT > 1/1038379‑1038870 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |