| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1166874 | 127 (1.120) | 3 (0.030) | 3/402 | 8.8 | 2.6% | intergenic (+27744/+226437) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| ? | 1 | = 1166924 | 112 (1.100) | intergenic (+27794/+226387) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
GGCACGTTTTTCTAAGGCGTGCCTTTCATCCAAAAAGTGCGGTCACAAAAAACGACGTTTTTTTAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATTTTCCCACGTGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTAATTTCATCCTATTTAGGCACAAAACTCATGCTTCG‑ACTAATTCTTCGACAAGCTCAGGAACCGTCTCAGCAACCGTTTTTTACATTTGCTACATAGTGCCGGTGTTTTTTGACATGAAAAACGTTGTGAAAAAGGACCGCACTTTTTTCCAACCTAATGCTGCAAGGTCTCAAAAATCTTTTCTGCCAGGGCTTTTGATATGCCGGGGACGGAGGCGATTTCGTCGAGGGTGGCATTTTTGACGCCTTGCAAGCCGCCGAGGTATTTGAGCAGGGCTTGGCGGCGTTTGG > 1/1166675‑1167172 | ggCACGTTTTTCTAAGGCGTGCCTTTCATCCAAAAAGTGCGGTCACAAAAAACGACGTTTTTTTAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATTTTCCCACGTGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTAATTTCATCCTATTTAGGCACAAAACTCATGCTTCG‑ACTAAtt > 1:551030/1‑250 (MQ=255) tttttCTAAGGCGTGCCTTTCATCCAAAAAGTGCGGTCACAAAAAACGACGTTTTTTTAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATTTTCCCACGTGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTAATTTCATCCTATTTAGGCACAAAACTCATGCTTCG‑ACTAATTCTTCGAc < 1:690844/251‑1 (MQ=255) tttttCTAAGGCGTGCCTTTCATCCAAAAAGTGCGGTCACAAAAAACGACGTTTTTTTAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATTTTCCCACGAGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTAATTTCATCCTATTTAGGCACAAAACTCATGCTTCG‑ACTAATTCTTCGa > 1:571007/1‑250 (MQ=255) tttCTAAGGCGTGCCTTTCATCCAAAAAGTGCGGTCACAAAAAACGACGTTTTTTTAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATTTTCCCACGTGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTAATTTCATCCTATTTAGGCACAAAACTCATGCTTCG‑ACTAATTCTTCGACaa > 1:636426/1‑251 (MQ=255) 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acgacgTTTTTTTAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATCTTCCCACGTGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTAATTTCATCCTATTTAGGCACAAAACTCATGCTTCG‑ACTAATTCTTCGACAAGCTCAGGAACCGTCTCAGCAACCGTTTTTTACATTTGCTACAt < 1:163257/251‑1 (MQ=255) acgTTTTTTTAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATTTTCCCACGTGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTAATTTCATCCTATTTAGGCACAAAACTCATGCTTCG‑ACTAATTCTTCGACAAGCTCAGGAACCGTCTCAGCAACCGTTTTTTACATTTGCTACATAg < 1:132989/250‑1 (MQ=255) tttttttAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATTTTCCCACGTGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTAATTTCATCCTATTTAGGCTCAAAACTCATGCTTCG‑ACTAATTCTTCGACAAGCTCAGGAACCGTCTCAGCAACCGTTTTTTACATTTGCTACATAGTGc < 1:675617/250‑1 (MQ=255) tttttttAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATTTTCCCACGTGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTAATTTCATCCTATTTAGGCACAAAACTCATGCTTCG‑ACTAATTCTTCGACAAGCTCAGGAACCGTCTCAGCAACCGTTTTTTACATTTGCTACATAGTGc < 1:605826/250‑1 (MQ=255) tttttttAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATTTTCCCACGTGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTAATTTCATCCTATTTAGGCACAAAACTCATGCTTCG‑ACTAATTCTTCGACAAGCTCAGGAACCGTCTCAGCAACCGTTTTTTACATTTGCTACATAGTGc < 1:607440/250‑1 (MQ=255) ttttttAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATTTTCCCACGTGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTAATTTCATCCTATTTAGGCACAAAACTCATGCTTCG‑ACTAATTCTTCGACAAGCTCAGGAACCGtctc > 1:34823/1‑217 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |