| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
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| ? | 1 | = 1166924 | 112 (1.100) | intergenic (+27794/+226387) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
ACCAAAGAAGTGATTTCACGTTAAGGGGAGCGAATCTTATTAAAATATCGGCACGTTTTTCTAAGGCGTGCCTTTCATCCAAAAAGTGCGGTCACAAAAAACGACGTTTTTTTAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATTTTCCCACGTGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTAATTTCATCCTATTTAGGCACAAAACTCATGCTTCG‑ACTAATTCTTCGACAAGCTCAGGAACCGTCTCAGCAACCGTTTTTTACATTTGCTACATAGTGCCGGTGTTTTTTGACATGAAAAACGTTGTGAAAAAGGACCGCACTTTTTTCCAACCTAATGCTGCAAGGTCTCAAAAATCTTTTCTGCCAGGGCTTTTGATATGCCGGGGACGGAGGCGATTTCGTCGAGGGTGGCATTTTTGA > 1/1166626‑1167124 | aCCAAAGAAGTGATTTCACGTTAAGGGGAGCGAATCTTATTAAAATATCGGCACGTTTTTCTAAGGCGTGCCTTTCATCCAAAAAGTGCGGTCACAAAAAACGACGTTTTTTTAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATTTTCCCACGTGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGa < 1:1007258/251‑1 (MQ=255) ccAAAGAAGTGATTTCACGTTAAGGGGAGCGAATCTTATTAAAATATCGGCACGTTTTTCTAAGGCGTGCCTTTCATCCAAAAAGTGCGGTCACAAAAAACGACGTTTTTTTAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATTTTCCCACGTGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGAt > 1:191726/1‑251 (MQ=255) ccAAAGAAGTGATTTCACGTTAAGGGGAGCGAATCTTATTAAAATATCGGCACGTTTTTCTAAGGCGTGCCTTTCATCCAAAAAGTGCGGTCACAAAAAACGACGTTTTTTTAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATTTTCCCACGTGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGAt > 1:482107/1‑251 (MQ=255) gaagTGATTTCACGTTAAGGGGAGCGAATCTTATTAAAATATCGGCACGTTTTTCTAAGGCGTGCCTTTCATCCAAAAAGTGCGGTCACAAAAAACGACGTTTTTTTAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATTTTCCCACGTGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTa > 1:612852/1‑251 (MQ=255) aagTGATTTCACGTTAAGGGGAGCGAATCTTATTAAAATATCGGCACGTTTTTCTAAGGCGTGCCTTTCATCCAAAAAGTGCGGTCACAAAAAACGACGTTTTTTTAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATTTTCCCACGTGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTaa < 1:91674/251‑1 (MQ=255) tGATTTCACGTTAAGGGGAGCGAATCTTATTAAAATATCGGCACGTTTTTCTAAGGCGTGCCTTTCATCCAAAAAGTGCGGTCACAAAAAACGACGTTTTTTTAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATTTTCCCACGTGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTAAttt < 1:259224/251‑1 (MQ=255) tGATTTCACGTTAAGGGGAGCGAATCTTATTAAAATATCGGCACGTTTTTCTAAGGCGTGCCTTTCATCCAAAAAGTGCGGTCACAAAAAACGACGTTTTTTTAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATTTTCCCACGTGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTAAttt < 1:254429/251‑1 (MQ=255) 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1:563489/1‑159 (MQ=255) tCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTAATTTCATCCTATTTAGGCACAAAACTCATGCTTCG‑ACTAATTCTTCGACAAGCTCAGGAACCGTCTCAGCAACCGTTTTTTACATTTGCTACATAGTGCCGGTGTTTTTTGACATGAAAAACGTTGTGAAAAAGGACCGCACTTTTTTCCAACCTAATGCTGCAAGGTCTCaaa < 1:292749/239‑1 (MQ=255) tCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTAATTTCATCCTATTTAGGCACAAAACTCATGCTTCG‑ACTAATTCTTCGACAAGCTCAGGAACCGTCTCAGCAACCGTTTTTTACATTTGCTACATAGTGCCGGTGTTTTTTGACATGAAAAACGTTGTGAAAAAGGACCGCACTTTTTTCCAACCTAATGCTGCAAGGTCTCAAAAATCTTTTCTg > 1:840879/1‑250 (MQ=255) aTTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTAATTTCATCCTATTTAGGCACAAAACTCATGCTTCG‑ACTAATTCTTCGACAAGCTCAGGAACCGTCTCAGCAACCGTTTTTTACATTTGCTACATAGTGCCGGTGTTTTTTGACATGAAAAACGTTGTGAAAAAGGACCGCACTTTTTTCCAACCTAATGCTGCAAGGTCTCAAAAATCTTTTCTGCCAggg > 1:852731/1‑251 (MQ=255) 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ggATGAGTAATTTCATCCTATTTAGGCACAAAACTCATGCTTCG‑ACTAATTCTTCGACAAGCTCAGGAACCGTCTCAGCAACCGTTTTTTACATTTGCTACATAGTGCCGGTGTTTTTTGACATGAAAAACGTTGTGAAAAAGGACCGCACTTTTTTCCAACCTAATGCTGCAAGGTCTCAAAAATCTTTTCTGCCAGGGCTTTTGATATGCCGGGGACGGAGGCGATTTCGTCGAGGGTGGCATTTTTGa > 1:1070443/1‑251 (MQ=255) | ACCAAAGAAGTGATTTCACGTTAAGGGGAGCGAATCTTATTAAAATATCGGCACGTTTTTCTAAGGCGTGCCTTTCATCCAAAAAGTGCGGTCACAAAAAACGACGTTTTTTTAACGTTGGCTTTGCCAACGGCCCCGTTAGGGGTGAACAAACGAGAGATCGAGTTTGTGAATAATTTTCCCACGTGTTTTTCACTATTGTGTAGCTGTTGCACAAAGATGAAATTACGGTTCCTGAGCTTGTCGAAGGATGAGTAATTTCATCCTATTTAGGCACAAAACTCATGCTTCG‑ACTAATTCTTCGACAAGCTCAGGAACCGTCTCAGCAACCGTTTTTTACATTTGCTACATAGTGCCGGTGTTTTTTGACATGAAAAACGTTGTGAAAAAGGACCGCACTTTTTTCCAACCTAATGCTGCAAGGTCTCAAAAATCTTTTCTGCCAGGGCTTTTGATATGCCGGGGACGGAGGCGATTTCGTCGAGGGTGGCATTTTTGA > 1/1166626‑1167124 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |