| Predicted mutation | ||||||
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| JC | 1 | 686,834 | +ATT | intergenic (+68477/‑9749) | unknown → / → unknown | tRNA‑Arg‑ACG/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
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CCTTCCTCCAGAACCGTATAATTCATCCCAATGTGGCCAAGCGCACCGCTCAATATATACACCACCAATAACAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTATTCTCCCTGTAAGATAATTA > 1/686601‑687081 | tcctccagaaccgtataattcatcccaatgtggccaagcgcaccgctcaatatatacaccaccaataacagtaatacatttattatttgacataattaagactcagatatgtttgatagatacttgaacttgtccttcaataatactttctacaatagctatatatttatgaccgttctccatgcaagtgaggagttgtggaagtacaatccctcccgctctatcatcattATTTTTg < 1:617898‑M2/7‑1 (MQ=255) 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1:88206‑M2/7‑1 (MQ=255) attaagactcagatatgtttgatagatacttgaacttgtccttcaataatactttctacaatagctatatatttatgaccgttctccatgcaagtgaggagttgtggaagtacaatccctcccgctctatcatcattATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGt > 1:754718‑M2/138‑251 (MQ=255) gatatgtttgatagatacttgaacttgtccttcaataatactttctacaatagctatatatttatgaccgttctccatgcaagtgaggagttgtggaagtacaatccctcccgctctatcatcattATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTgta > 1:342596‑M2/127‑251 (MQ=255) tacttgaacttgtccttcaataatactttctacaatagctatatatttatgaccgttctccatgcaagtgaggagttgtggaagtacaatccctcccgctctatcatcattATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACatgatg > 1:846706‑M2/112‑251 (MQ=255) 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ctctatcatcattATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTATTCTccc < 1:612873‑M2/237‑1 (MQ=255) ctatcatcattATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTAt < 1:544376‑M2/231‑1 (MQ=255) atcatcattATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCg < 1:775155‑M2/214‑1 (MQ=255) atcattATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTATTCTCCCTGTAAGAt < 1:448769‑M2/245‑1 (MQ=255) atcattATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTATTCTCCCTGTAAGAt < 1:375185‑M2/245‑1 (MQ=255) atcattATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTCAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTATTCTCCCTGTAAGAt < 1:391189‑M2/245‑1 (MQ=255) atTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTATTCTCCCTGTAAGATAatta > 1:238046/1‑250 (MQ=255) | CCTTCCTCCAGAACCGTATAATTCATCCCAATGTGGCCAAGCGCACCGCTCAATATATACACCACCAATAACAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTATTCTCCCTGTAAGATAATTA > 1/686601‑687081 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |