| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 686,834 | +ATT | intergenic (+68477/‑9749) | unknown → / → unknown | tRNA‑Arg‑ACG/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 686831 | 0 (0.000) | 65 (0.750) +ATT |
52/418 | 0.4 | 100% | intergenic (+68474/‑9752) | unknown/unknown | tRNA‑Arg‑ACG/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 686832 = | 0 (0.000) | intergenic (+68475/‑9751) | unknown/unknown | tRNA‑Arg‑ACG/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA | |||||
TCCTCCAGAACCGTATAATTCATCCCAATGTGGCCAAGCGCACCGCTCAATATATACACCACCAATAACAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTATTCTCCCTGTAAGATAAT > 1/686604‑687079 | tcctccAGAACCGTATAATTCATCCCAATGTGGCCAAGCGCACCGCTCAATATATACACCACCAATAACAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttg < 1:617898‑M1/238‑11 (MQ=255) gTATAATTCATCCCAATGTGGCCAAGCGCACCGCTCAATATATACACCACCAATAACAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatcc > 1:650926‑M1/1‑216 (MQ=255) gTATAATTCATCCCAATGTGGCCAAGCGCACCGCTCAATATATACACCACCAATAACAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaat > 1:765811‑M1/1‑216 (MQ=255) gCTCAATATATACACCACCAATAACAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgat > 1:503724‑M1/1‑184 (MQ=255) atatatACACCACCAATAACAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaat > 1:42961‑M1/1‑179 (MQ=255) atatatACACCACCAATAACAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaat < 1:636372‑M1/210‑32 (MQ=255) tataCACCACCAATAACAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataag < 1:40088‑M1/251‑76 (MQ=255) ataCACCACCAATAACAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagt < 1:1251‑M1/251‑77 (MQ=255) ataCACCACCAATAACAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagt > 1:629838‑M1/1‑175 (MQ=255) ccaATAACAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagcttt > 1:21604‑M1/1‑167 (MQ=255) ccaATAACAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagcttt > 1:399282‑M1/1‑167 (MQ=255) aaCAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatag < 1:12451‑M1/251‑90 (MQ=255) gTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCatt < 1:88453‑M1/161‑4 (MQ=255) aCATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctat > 1:451380‑M1/1‑153 (MQ=255) aCATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagct > 1:660994‑M1/1‑153 (MQ=255) cATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttg > 1:513894‑M1/1‑152 (MQ=255) cATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttg < 1:692350‑M1/191‑40 (MQ=255) attTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgata < 1:292668‑M1/251‑108 (MQ=255) aTAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattg < 1:655641‑M1/251‑115 (MQ=255) tAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattga > 1:368155‑M1/1‑136 (MQ=255) aaTTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttg < 1:88206‑M1/145‑11 (MQ=255) aTTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagt > 1:754718‑M1/1‑134 (MQ=255) gATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgta > 1:342596‑M1/1‑123 (MQ=255) taCTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatg > 1:671293‑M1/1‑108 (MQ=255) taCTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatg > 1:846706‑M1/1‑108 (MQ=255) taCTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgat < 1:230963‑M1/250‑143 (MQ=255) aCTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatga > 1:785954‑M1/1‑107 (MQ=255) aCTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatc > 1:630946‑M1/1‑107 (MQ=255) ccTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacc < 1:748463‑M1/251‑157 (MQ=255) cAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattg < 1:280452‑M1/205‑115 (MQ=255) ataataCTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctcctt > 1:359410‑M1/1‑89 (MQ=255) ttCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacc > 1:294899‑M1/1‑81 (MQ=255) cTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatg > 1:664830‑M1/1‑79 (MQ=255) cAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctata < 1:841661‑M1/251‑176 (MQ=255) tAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgct > 1:482742‑M1/1‑73 (MQ=255) aGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagct > 1:131990‑M1/1‑72 (MQ=255) gCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctatac < 1:572187‑M1/247‑177 (MQ=255) gCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcac < 1:752407‑M1/208‑138 (MQ=255) gCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattg > 1:103488‑M1/1‑71 (MQ=255) cTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaag < 1:873940‑M1/126‑57 (MQ=255) atatatTTATGACCTTTCTCCATTCAATTTATTAGTTGTTGAAGTACAATCCCTCCCTCTCTATCATCattatttttttatgcttcaatagatttaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctataccattatt > 1:505713‑M1/1‑68 (MQ=255) atatTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctatacc < 1:833067‑M1/243‑178 (MQ=255) atatTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatc > 1:216599‑M1/1‑66 (MQ=255) tatTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggt < 1:127929‑M1/162‑98 (MQ=255) atTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctataccattattaaag > 1:11373‑M1/1‑64 (MQ=255) atTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctc < 1:319556‑M1/222‑159 (MQ=255) atTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaat > 1:393507‑M1/1‑64 (MQ=255) atTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggt < 1:219651‑M1/161‑98 (MQ=255) atTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGA‑GAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaat < 1:838630‑M1/84‑22 (MQ=255) ttATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctataccattattaaagat < 1:705024‑M1/251‑190 (MQ=255) ttCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctatac > 1:434552‑M1/1‑53 (MQ=255) ccATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctataccattattaaagatcgggttatttaaa > 1:70979‑M1/1‑49 (MQ=255) ccATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattg < 1:216456‑M1/163‑115 (MQ=255) cAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgc > 1:591304‑M1/1‑44 (MQ=255) ggagTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctataccattattaaagatcgggttatttgaaaaatcactatta > 1:432108‑M1/1‑37 (MQ=255) gagTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctataccattattaaagatcgggttatttgaaaaatcactatta > 1:716964‑M1/1‑36 (MQ=255) gagTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctataccattattaaagatcgggttatttgaaaaatcactatta > 1:453430‑M1/1‑36 (MQ=255) gTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctataccattattaaagatcgggttatttgaaaaatcactattaccg > 1:209772‑M1/1‑34 (MQ=255) gTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattac < 1:24015‑M1/180‑156 (MQ=255) cctcccGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctataccattattaaagatcgggttatttgaaaaatcactattaccgctgccagacatatgtat < 1:670642‑M1/251‑235 (MQ=255) tcccGCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctataccattattaaagatcgggttatttgaaaaatcactattaccgctgccagacatatgtattc < 1:584106‑M1/251‑237 (MQ=255) gCTCTATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgata < 1:389136‑M1/118‑108 (MQ=255) ctctATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctataccattattaaagatcgggttatttgaaaaatcactattaccgctgccagacatatgtattctccc < 1:612873‑M1/250‑241 (MQ=255) ctATCATCattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctataccattattaaagatcgggttatttgaaaaatcactattaccgctgccagacatatgtat < 1:544376‑M1/242‑235 (MQ=255) atcatcattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctataccattattaaagatcgggttatttgaaaaatcactattaccg < 1:775155‑M1/223‑218 (MQ=255) atcattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctataccattattaaagatcgggttatttgaaaaatcactattaccgctgccagacatatgtattctccctgtaagat < 1:375185‑M1/251‑249 (MQ=255) atcattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctataccattattaaagatcgggttatttgaaaaatcactattaccgctgccagacatatgtattctccctgtaagat < 1:448769‑M1/251‑249 (MQ=255) atcattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagtcaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctataccattattaaagatcgggttatttgaaaaatcactattaccgctgccagacatatgtattctccctgtaagat < 1:391189‑M1/251‑249 (MQ=255) | TCCTCCAGAACCGTATAATTCATCCCAATGTGGCCAAGCGCACCGCTCAATATATACACCACCAATAACAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTATTCTCCCTGTAAGATAAT > 1/686604‑687079 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |