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GTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCATTATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCG > 1:209772/1‑251 GTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCATTATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTAC < 1:24015/180‑1 CCTCCCGCTCTATCATCATTATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTAT < 1:670642/251‑1 TCCCGCTCTATCATCATTATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTATTC < 1:584106/251‑1 GCTCTATCATCATTATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATA < 1:389136/118‑1 CTCTATCATCATTATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTATTCTCCC < 1:612873/250‑1 CTATCATCATTATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTAT < 1:544376/242‑1 ATCATCATTATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCG < 1:775155/223‑1 ATCATTATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTATTCTCCCTGTAAGAT < 1:375185/251‑1 ATCATTATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTATTCTCCCTGTAAGAT < 1:448769/251‑1 ATCATTATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTCAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTATTCTCCCTGTAAGAT < 1:391189/251‑1 ||| TCCTCCAGAACCGTATAATTCATCCCAATGTGGCCAAGCGCACCGCTCAATATATACACCACCAATAACAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/686604‑686831‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTATTCTCCCTGTAAGAT > 1/686832‑687076 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |