| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,140,758 | Δ45 bp | intergenic (+3709/‑18702) | unknown → / → unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1140758 | 1140802 | 45 | 60 [0] | [0] 60 | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1140757 | 0 (0.000) | 55 (0.640) | 36/416 | 1.1 | 100% | intergenic (+3708/‑18747) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| ? | 1 | 1140803 = | 0 (0.000) | intergenic (+3754/‑18701) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC | |||||
GACGAATTGGCACCGGATTATATTGTGTTGGCAAAATATATGCGGGTCTTAAATCCGAAATTTGTAGCGCGTTATCCTAATCGGGTGATTAACATTCACCATTCGTTTTTGCCTGCATTTATCGGCGCAAAACCTTATCAGCAGGCTTATGAGCGCGGTGTAAAAATTATCGGTGCGACGGCGCATTTTATTAATAACGAATTAGATCAAGGTCCGATTATTATGCAGAATGTGATTAATATTGATCACACCTATAGTGTGGAAGCCATGATGAAAGCCGGACGAGACGTGGAAAAAACAGTATTAAGCCGTGCACTGGATCTTGCGTTACATGATCGTATTTTTGTGTATAAGAACAAAACGATTGTTTTATAGACCGCACTTTGGTTGTGATTCTTTCAAACCATCTTCAGTATGTATGAAGACGGGTTTTTTATTTATGATATTCGGGCTTGAAAAGCGAAATGCCAGCCTTAATATACAATAACAT > 1/1140562‑1141051 | aatttaacccgtgaagaacatgattatttgttagccgaaaaaattgacgaattggcaccggattatattgtgttggcaaaatatatgcgggtcttaaatccgaaatttgtagcgcgttatcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATcaca > 1:608446‑M2/242‑250 (MQ=255) acccgtgaagaacatgattatttgttagccgaaaaaattgacgaattggcaccggattatattgtgttggcaaaatatatgcgggtcttaaatccgaaatttgtagcgcgttatcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAg < 1:685573‑M2/16‑1 (MQ=255) gtgaagaacatgattatttgttagccgaaaaaattgacgaattggcaccggattatattgtgttggcaaaatatatgcgggtcttaaatccgaaatttgtagcgcgttatcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAg < 1:511973‑M2/16‑1 (MQ=255) gaacatgattatttgttagccgaaaaaattgacgaattggcaccggattatattgtgttggcaaaatatatgcgggtcttaaatccgaaatttgtagcgcgttatcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAGTGTGGAAg > 1:804358‑M2/227‑250 (MQ=255) catgattatttgttagccgaaaaaattgacgaattggcaccggattatattgtgttggcaaaatatatgcgggtcttaaatccgaaatttgtagcgcgttatcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAGTGTGGAAGCCat > 1:163357‑M2/224‑251 (MQ=255) ggattatattgtgttggcaaaatatatgcgggtcttaaatccgaaatttgtagcgcgttatcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAg < 1:686255‑M2/16‑1 (MQ=255) ggattatattgtgttggcaaaatatatgcgggtcttaaatccgaaatttgtagcgcgttatcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAGTGTGGAAg > 1:405947‑M2/183‑206 (MQ=255) ggattatattgtgttggcaaaatatatgcgggtcttaaatccgaaatttgtagcgcgttatcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAGTGTGGAAGCCATGATGAAAGCCGGACg > 1:810993‑M2/183‑225 (MQ=255) ggattatattgtgttggcaaaatatatgcgggtcttaaatccgaaatttgtagcgcgttatcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAGTGTGGAAGCCATGATGAAAGCCGGACGAGACGTGGAAAAAACAGTATTAAGc > 1:140351‑M2/183‑250 (MQ=255) atattgtgttggcaaaatatatgcgggtcttaaatccgaaatttgtagcgcgttatcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAGTGTGGAAGCCATGATGAAAGCCGGACGAGACGTGGAAAAAACAGTATTAAGCCGTGCa > 1:136287‑M2/178‑251 (MQ=255) attgtgttggcaaaatatatgcgggtcttaaatccgaaatttgtagcgcgttatcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAg < 1:229770‑M2/16‑1 (MQ=255) 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atcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAGTGTGGAAGCCATGATGAAAGCCGGACGAGACGTGGAAAAAACAGTATTAAGCCGTGCACTGGATCTTGCGTTACATGATCGTATTTTTGTGTATAAGAACAAAACGATTGtt > 1:213384‑M2/124‑251 (MQ=255) atcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAGTGTGGAAGCCATGATGAAAGCCGGACGAGACGTGGAAAAAACAGTATTAAGCCGTGCACTGGATCTTGCGTTACATGATCGTATTTTTGTGTATAAGAACAAAACGATTGtt > 1:448732‑M2/124‑251 (MQ=255) atcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaagaTTGATCACACCTATAGTGTGGAAGCCATGATGAAAGCCGGACGAGACGTGGAAAAAACAGTATTAAGCCGTGCACTGGAt < 1:758795‑M2/80‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |