| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,140,758 | Δ45 bp | intergenic (+3709/‑18702) | unknown → / → unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1140758 | 1140802 | 45 | 60 [0] | [0] 60 | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1140757 | 0 (0.000) | 55 (0.640) | 36/416 | 1.1 | 100% | intergenic (+3708/‑18747) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| ? | 1 | 1140803 = | 0 (0.000) | intergenic (+3754/‑18701) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC | |||||
GACGAATTGGCACCGGATTATATTGTGTTGGCAAAATATATGCGGGTCTTAAATCCGAAATTTGTAGCGCGTTATCCTAATCGGGTGATTAACATTCACCATTCGTTTTTGCCTGCATTTATCGGCGCAAAACCTTATCAGCAGGCTTATGAGCGCGGTGTAAAAATTATCGGTGCGACGGCGCATTTTATTAATAACGAATTAGATCAAGGTCCGATTATTATGCAGAATGTGATTAATATTGATCACACCTATAGTGTGGAAGCCATGATGAAAGCCGGACGAGACGTGGAAAAAACAGTATTAAGCCGTGCACTGGATCTTGCGTTACATGATCGTATTTTTGTGTATAAGAACAAAACGATTGTTTTATAGACCGCACTTTGGTTGTGATTCTTTCAAACCATCTTCAGTATGTATGAAGACGGGTTTTTTATTTATGATATTCGGGCTTGAAAAGCGAAATGCCAGCCTTAATATACAATAACAT > 1/1140562‑1141051 | aatttaacccgtgaagaacatgattatttgttagccgaaaaaattgacgaattggcaccggattatattgtgttggcaaaatatatgcgggtcttaaatccgaaatttgtagcgcgttatcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATcaca > 1:608446‑M2/242‑250 (MQ=255) acccgtgaagaacatgattatttgttagccgaaaaaattgacgaattggcaccggattatattgtgttggcaaaatatatgcgggtcttaaatccgaaatttgtagcgcgttatcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAg < 1:685573‑M2/16‑1 (MQ=255) gtgaagaacatgattatttgttagccgaaaaaattgacgaattggcaccggattatattgtgttggcaaaatatatgcgggtcttaaatccgaaatttgtagcgcgttatcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAg < 1:511973‑M2/16‑1 (MQ=255) gaacatgattatttgttagccgaaaaaattgacgaattggcaccggattatattgtgttggcaaaatatatgcgggtcttaaatccgaaatttgtagcgcgttatcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAGTGTGGAAg > 1:804358‑M2/227‑250 (MQ=255) 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(MQ=255) ggattatattgtgttggcaaaatatatgcgggtcttaaatccgaaatttgtagcgcgttatcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAGTGTGGAAGCCATGATGAAAGCCGGACGAGACGTGGAAAAAACAGTATTAAGc > 1:140351‑M2/183‑250 (MQ=255) atattgtgttggcaaaatatatgcgggtcttaaatccgaaatttgtagcgcgttatcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAGTGTGGAAGCCATGATGAAAGCCGGACGAGACGTGGAAAAAACAGTATTAAGCCGTGCa > 1:136287‑M2/178‑251 (MQ=255) attgtgttggcaaaatatatgcgggtcttaaatccgaaatttgtagcgcgttatcctaatcgggtgattaacattcaccattcgtttttgcctgcatttatcggcgcaaaaccttatcagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAg < 1:229770‑M2/16‑1 (MQ=255) 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1:701915‑M2/66‑251 (MQ=255) cagcaggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAGTGTGGAAGCCATGATGAAAGCCGGACGAGACGTGGAAAAAACAGTATTAAGc > 1:45571‑M2/59‑126 (MQ=255) ggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATc < 1:774869‑M2/6‑1 (MQ=255) ggcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAGTGTGGAAGCCATGATGAAAGCCAGACGAGACGTGGAAAAAACAGTATTAAGCCGTGCACTGGATCTTGCGTTACATGATCGTATTTTTGTGTATAAGAACAAAACGATTGTTTTATAGACCGCACTTTGGTTGTGATTCTTTCAAACCATCTTCAGtatgtatg < 1:183670‑M2/180‑1 (MQ=255) gcttatgagcgcggtgtaaaaattatcggtgcgacggcgcattttattaataTTGATCACACCTATAGGGTGGAAGCCATGATGAAAGCCGGACGAGACGTGGAAAAAACAGTATTAAGCCGTGCACTGGATCTTGCGTTACATGATCGTATTTTTGTGTATAAGAACAAAACGATTGTTTTATAGACCGCACTTTGGTTGTGATTCTTTCAAACCATCTTCAGTATGTATGAAGACGGGTTTtttattta > 1:180305‑M2/53‑251 (MQ=255) 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ttattaataTTGATCACACCTATAGTGTGGAAGCCATGATGAAAGCCGGACGAGACGTGGAAAAAACAGTATTAAGCCGTGCACTGGATCTTGCGTTACATGATCGTATTTTTGTGTATAAGAACAAAACGATTGTTTTATAGACCGCACTTTGGTTGTGATTCTTTCAAACCATCTTCAGTATGTATGAAGACGGGTTTTTTATTTATGATATTCGGGCTTGAAAAGCGAAATGCCAGCCTTAatat < 1:665664‑M2/239‑1 (MQ=255) tattaataTTGATCACACCTATAGTGTGGAAGCCATGATGAAAGCCGGACGAGACGTGGAAAAAACAGTATTAAGCCGTGCACTGGATCTTGCGTTACATGATCGTATTTTTGTGTATAAGAACAAAACGATTGTTTTATAGACCGCACTTTGGTtg < 1:833606‑M2/149‑1 (MQ=255) tattaataTTGATCACACCTATAGTGTGGAAGCCATGATGAAAGCCGGACGAGACGTGGAAAAAACAGTATTAAGCCGTGCACTGGATCTTGCGTTACATGATCGTATTTTTGTGTATAAGAACAAAACGATTGTTTTATAGACCGCACTTTGGTTGTGATTCTTTCAAACCATCTTCAGTATGTATGAAGAc > 1:196981‑M2/9‑193 (MQ=255) attaataTTGATCACACCTATAGTGTGGAAGCCATGATGAAAGCCGGACGAGACGTGGAAAAGACAGTATTAAGCCGTGCACTGGATCTTGCGTTACATGATCGTATTTTTGTGTATAAGAACAAAACGATTGTTTTATAGACCGCACTTTGGTTGTGATTCTTTCAAACCATCTTCAGTATGTATGAAGa < 1:525186‑M2/184‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |