| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,140,758 | Δ45 bp | intergenic (+3709/‑18702) | unknown → / → unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1140758 | 1140802 | 45 | 60 [0] | [0] 60 | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1140757 | 0 (0.000) | 55 (0.640) | 36/416 | 1.1 | 100% | intergenic (+3708/‑18747) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| ? | 1 | 1140803 = | 0 (0.000) | intergenic (+3754/‑18701) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC | |||||
AATTTAACCCGTGAAGAACATGATTATTTGTTAGCCGAAAAAATTGACGAATTGGCACCGGATTATATTGTGTTGGCAAAATATATGCGGGTCTTAAATCCGAAATTTGTAGCGCGTTATCCTAATCGGGTGATTAACATTCACCATTCGTTTTTGCCTGCATTTATCGGCGCAAAACCTTATCAGCAGGCTTATGAGCGCGGTGTAAAAATTATCGGTGCGACGGCGCATTTTATTAATAACGAATTAGATCAAGGTCCGATTATTATGCAGAATGTGATTAATATTGATCACACCTATAGTGTGGAAGCCATGATGAAAGCCGGACGAGACGTGGAAAAAACAGTATTAAGCCGTGCACTGGATCTTGCGTTACATGATCGTATTTTTGTGTATAAGAACAAAACGATTGTTTTATAGACCGCACTTTGGTTGTGATTCTTTCAAACCATCTTCAGTATGTATGAAGACGGGTTTTTTATTTATGATA > 1/1140517‑1141006 | aaTTTAACCCGTGAAGAACATGATTATTTGTTAGCCGAAAAAATTGACGAATTGGCACCGGATTATATTGTGTTGGCAAAATATATGCGGGTCTTAAATCCGAAATTTGTAGCGCGTTATCCTAATCGGGTGATTAACATTCACCATTCGTTTTTGCCTGCATTTATCGGCGCAAAACCTTATCAGCAGGCTTATGAGCGCGGTGTAAAAATTATCGGTGCGACGGCGCATTTTATTAATAttgatcaca > 1:608446‑M1/1‑241 (MQ=255) 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1:448732‑M1/1‑123 (MQ=255) aTCCTAATCGGGTGATTAACATTCACCATTCGTTTTTGCCTGCATTTATCGGCGCAAAACCTTATCAGCAGGCTTATGAGCGCGGTGTAAAAATTATCGGTGCGACGGCGCATTTTATTAATAttgatcacacctatagtgtggaagccatgatgaaagccggacgagacgtggaaaaaacagtattaagccgtgcactggatcttgcgttacatgat < 1:206213‑M1/218‑96 (MQ=255) aTCCTAATCGGGTGATTAACATTCACCATTCGTTTTTGCCTGCATTTATCGGCGCAAAACCTTATCAGCAGGCTTATGAGCGCGGTGTAAAAATTATCGGTGCGACGGCGCATTTTATTAATAttgatc > 1:132991‑M1/1‑123 (MQ=255) aTCCTAATCGGGTGATTAACATTCACCATTCGTTTTTGCCTGCATTTATCGGCGCAAAACCTTATCAGCAGGCTTATGAGCGCGGTGTAAAAATTATCGGTGCGACGGCGCATTTTATTAAGAttgatcacacctatagtgtggaagccatgatgaaagccggacgagacgtggaaaaaacagtattaagccgtgcactggat < 1:758795‑M1/203‑81 (MQ=255) gATTAACATTCACCATTCGTTTTTGCCTGCATTTATCGGCGCAAAACCTTATCAGCAGGCTTATGAGCGCGGTGTAAAAATTATCGGTGCGACGGCGCATTTTATTAATAttgatcacacctatagtgtggatgccatgatgaaagccggacgagacgtggaaaaaacagtattaagccgtgcactggatcttgcgttacatgatcgtatttttgtgtataagaacaaaacgattgttttatagaccgca > 1:109792‑M1/1‑110 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |