| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,010,171 | Δ377 bp | intergenic (‑3715/‑24672) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1010171 | 1010547 | 377 | 68 [0] | [0] 68 | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1010170 | 0 (0.000) | 67 (0.770) | 55/426 | 0.3 | 100% | intergenic (‑3714/‑25049) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 1010548 = | 0 (0.000) | intergenic (‑4092/‑24671) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA | |||||
GTGGCGATATTGTAAGAATTTGTTTAAATCCGGTTGTTGGTAATGAAATTCAGGGGGAACAACGACTGGTTTTAGTCATTAGCCCCAAACGTTTTAATCAATATGGATTAATTTTAGTCTGCCCGATCACGCAAGGTGAAGCCTCAATTTCTAGAAAAGGTGGCTTTTATGTGAGTTTAATGGGATATGGTTTGGATACATTAGGTGGCGTTGTAGCCAATCAATCCAGAACATTAGATTGGCGTAATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACGGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTAAGAAGCTGGAGGATTTCGGACGTTGCTTGGTTTGTCCTTCCAGGC > 1/1010302‑1010796 | gtctttttttgcttattaggaaaaagaagtgtttttggactgtacttgatttttgttcttattaggctaaaatgtatcacaaaatgatacgttgaggtgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCg < 1:97347‑M2/4‑1 (MQ=255) tctttttttgcttattaggaaaaagaagtgtttttggactgtacttgatttttgttcttattaggctaaaatgtatcacaaaatgatacgttgaggtgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAg < 1:604822‑M2/6‑1 (MQ=255) cttattaggaaaaagaagtgtttttggactgtacttgatttttgttcttattaggctaaaatgtatcacaaaatgatacgttgaggtgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGaa < 1:860166‑M2/16‑1 (MQ=255) aagtgtttttggactgtacttgatttttgttcttattaggctaaaatgtatcacaaaatgatacgttgaggtgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCAc < 1:549361‑M2/30‑1 (MQ=255) aagtgtttttggactgtacttgatttttgttcttattaggctaaaatgtatcacaaaatgatacgttgaggtgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCAc < 1:787599‑M2/30‑1 (MQ=255) ctgtacttgatttttgttcttattaggctaaaatgtatcacaaaatgatacgttgaggtgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTg < 1:214518‑M2/44‑1 (MQ=255) gtacttgatttttgttcttattaggctaaaatgtatcacaaaatgatacgttgaggtgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCa > 1:327894‑M2/206‑251 (MQ=255) gtacttgatttttgttcttattaggctaaaatgtatcacaaaatgatacgttgaggtgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCa > 1:589197‑M2/206‑251 (MQ=255) ggctaaaatgtatcacaaaatgatacgttgaggtgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGaa > 1:96504‑M2/183‑198 (MQ=255) ggctaaaatgtatcacaaaatgatacgttgaggtgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATcacag > 1:595279‑M2/183‑249 (MQ=255) ggctaaaatgtatcacaaaatgatacgttgaggtgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATc < 1:272322‑M2/65‑1 (MQ=255) gctaaaatgtatcacaaaatgatacgttgaggtgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggcgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATcacag > 1:547372‑M2/182‑248 (MQ=255) aaatgatacgttgaggtgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGa > 1:92083‑M2/166‑251 (MQ=255) atgatacgttgaggtgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAgg > 1:656391‑M2/164‑251 (MQ=255) acgttgaggtgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGaa > 1:63707‑M2/159‑251 (MQ=255) aggtgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAAt > 1:751021‑M2/153‑251 (MQ=255) tgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGc < 1:8820‑M2/101‑1 (MQ=255) tgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGc < 1:798924‑M2/101‑1 (MQ=255) gaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAg > 1:242625‑M2/149‑154 (MQ=255) ggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGc < 1:897658‑M2/101‑1 (MQ=255) gtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCAcc > 1:603817‑M2/146‑176 (MQ=255) gaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGtt > 1:866972‑M2/141‑180 (MQ=255) caagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACgg < 1:506909‑M2/116‑1 (MQ=255) agactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTa > 1:336422‑M2/134‑251 (MQ=255) gactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAg > 1:875557‑M2/133‑251 (MQ=255) gaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAg > 1:321554‑M2/128‑238 (MQ=255) aaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGc < 1:876639‑M2/45‑1 (MQ=255) aaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAacac < 1:542853‑M2/125‑1 (MQ=255) aaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAacac < 1:688795‑M2/125‑1 (MQ=255) aaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAacac < 1:621970‑M2/125‑1 (MQ=255) aaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAaca > 1:550889‑M2/127‑250 (MQ=255) aaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAaca > 1:640369‑M2/127‑250 (MQ=255) aattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAg > 1:478891‑M2/126‑236 (MQ=255) aaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGtacggtagaaatttttggt > 1:583003‑M2/122‑243 (MQ=255) caatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGTGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAAtt > 1:648143‑M2/119‑251 (MQ=255) gggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTa > 1:895600‑M2/114‑250 (MQ=255) ggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCAc > 1:590253‑M2/113‑142 (MQ=255) ggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGtt > 1:843504‑M2/113‑152 (MQ=255) tagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAg < 1:713140‑M2/18‑1 (MQ=255) tagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATcacag > 1:20094‑M2/108‑174 (MQ=255) tagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCaaaaa > 1:693573‑M2/108‑238 (MQ=255) gcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAAtt < 1:682758‑M2/133‑1 (MQ=255) cttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAAc < 1:749965‑M2/159‑1 (MQ=255) gaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGat > 1:741807‑M2/87‑145 (MQ=255) gattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGAt > 1:347316‑M2/83‑178 (MQ=255) attcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAg > 1:823141‑M2/77‑251 (MQ=255) ttcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAggg > 1:506530‑M2/76‑164 (MQ=255) cactaattcttgatacgggtgatcttttagaattaaatccagtggataataaatttcctttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTg > 1:770101‑M2/70‑96 (MQ=255) cactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGAtattat < 1:213388‑M2/64‑1 (MQ=255) atcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGaaa > 1:845051‑M2/64‑251 (MQ=255) atcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGaaa > 1:305959‑M2/64‑251 (MQ=255) tcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTcc < 1:151211‑M2/54‑1 (MQ=255) tgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGAt < 1:124962‑M2/96‑1 (MQ=255) ttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTaagaa < 1:409677‑M2/208‑1 (MQ=255) gaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTaagaag > 1:606547‑M2/41‑249 (MQ=255) aaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTAAGAAGCTggagga < 1:117214‑M2/217‑1 (MQ=255) accaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTAAGAAGCTGGAGGAt < 1:67611‑M2/218‑1 (MQ=255) caagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAg > 1:11864‑M2/32‑142 (MQ=255) aagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTAAGAAGCTGGAGGAttt > 1:563517‑M2/31‑250 (MQ=255) gtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGa < 1:797393‑M2/186‑1 (MQ=255) ggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTaagaa < 1:179375‑M2/208‑1 (MQ=255) ttaatttaacgggtaATCGAGCGAATAAGAAAGTGGAAACCGGACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTAAGAAGCTGGAGGATTTCGGACGTTGCTTGGtt < 1:103856‑M2/236‑1 (MQ=255) tattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGc < 1:286056‑M2/198‑1 (MQ=255) tattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTAAGAAGCTGGAGGATTTCGGACGTTGCTTGGttt < 1:292563‑M2/237‑1 (MQ=255) ttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTAAGAAGCTGGAGGATTTCGGACGTTGCTTGGTTTGTcc < 1:358672‑M2/241‑1 (MQ=255) ggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTAAGAAGCTGGAGGATTTCGGACGTTGCTTGGTTTGTCCTTCCa > 1:10645‑M2/6‑251 (MQ=255) gttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTAAGAAGCTGGAGGATTTCGGACGTTGCTTGGTTTGTCCTTCCAg > 1:774463‑M2/5‑251 (MQ=255) taATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTAAGAAGCTGGAGGATTTCGGACGTTGCTTGGTTTGTCCTTCCAGGc < 1:118341‑M2/249‑1 (MQ=255) | GTGGCGATATTGTAAGAATTTGTTTAAATCCGGTTGTTGGTAATGAAATTCAGGGGGAACAACGACTGGTTTTAGTCATTAGCCCCAAACGTTTTAATCAATATGGATTAATTTTAGTCTGCCCGATCACGCAAGGTGAAGCCTCAATTTCTAGAAAAGGTGGCTTTTATGTGAGTTTAATGGGATATGGTTTGGATACATTAGGTGGCGTTGTAGCCAATCAATCCAGAACATTAGATTGGCGTAATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACGGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTAAGAAGCTGGAGGATTTCGGACGTTGCTTGGTTTGTCCTTCCAGGC > 1/1010302‑1010796 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |