| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | 1 | 1,010,171 | Δ377 bp | intergenic (‑3715/‑24672) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1010171 | 1010547 | 377 | 68 [0] | [0] 68 | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1010170 | 0 (0.000) | 67 (0.770) | 55/426 | 0.3 | 100% | intergenic (‑3714/‑25049) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 1010548 = | 0 (0.000) | intergenic (‑4092/‑24671) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA | |||||
GTGGCGATATTGTAAGAATTTGTTTAAATCCGGTTGTTGGTAATGAAATTCAGGGGGAACAACGACTGGTTTTAGTCATTAGCCCCAAACGTTTTAATCAATATGGATTAATTTTAGTCTGCCCGATCACGCAAGGTGAAGCCTCAATTTCTAGAAAAGGTGGCTTTTATGTGAGTTTAATGGGATATGGTTTGGATACATTAGGTGGCGTTGTAGCCAATCAATCCAGAACATTAGATTGGCGTAATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACGGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTAAGAAGCTGGAGGATTTCGGACGTTGCTTGGTTTGTCCTTCCAGGC > 1/1010302‑1010796 | gtctttttttgcttattaggaaaaagaagtgtttttggactgtacttgatttttgttcttattaggctaaaatgtatcacaaaatgatacgttgaggtgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCg < 1:97347‑M2/4‑1 (MQ=255) 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GTGGCGATATTGTAAGAATTTGTTTAAATCCGGTTGTTGGTAATGAAATTCAGGGGGAACAACGACTGGTTTTAGTCATTAGCCCCAAACGTTTTAATCAATATGGATTAATTTTAGTCTGCCCGATCACGCAAGGTGAAGCCTCAATTTCTAGAAAAGGTGGCTTTTATGTGAGTTTAATGGGATATGGTTTGGATACATTAGGTGGCGTTGTAGCCAATCAATCCAGAACATTAGATTGGCGTAATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACGGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTAAGAAGCTGGAGGATTTCGGACGTTGCTTGGTTTGTCCTTCCAGGC > 1/1010302‑1010796 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |