| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 111,888 | Δ17 bp | intergenic (–/+19230) | – / ← unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 111888 | 111904 | 17 | 61 [0] | [0] 61 | –/unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | 1 | = 111887 | 0 (0.000) | 61 (0.700) | 47/426 | 0.6 | 100% | intergenic (–/+19247) | –/unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| ? | 1 | 111905 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+19229) | –/unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC | |||||
ACTCTTCTGACCACCTATAACTACACTACCGGAATAGCGGACTTCACCCGCATTAGGGATATTTTTAGCAATTTCTCCATTGTAAAATACTTGATCATTAGGGAAATCTTCTGTCTTAGAAGATAAATAACCATATTGATAAAGGCTATTGTTCTCGCCTATAAAACTATAACTATCAGAATCTTCAAGTAGATTAATTTTATGTCCAGCAATATCTAACGCTTTTAGATTTGAATTACTATTTATTGAAGTTTTTGATACATCACCTTTTTCTGAAACTGAAAATACAGCGCCAGTATTAACTACAGGTGTCGGAGTACCGGAACCACCGCCGCCACTTCCGCAAGCTGTAACGGTTAATGATGTTAATACAATAAGACTCAATTTTGAAATTGAGTGTTTAAAATTACTCATAAAAAAACTCCTTAGAAATTAAAGTAATAGTCTAATATTTAATTAATAATCCCACTAAATTTTATAA > 1/111662‑112142 | ccgataggggcgccatcactcttctgaccacctataactacactaccggaatagcggacttcacccgcattaggaatatttttagcaatttctccattgtaaaatacttgatcattagggaaatcttctgtcttagaagataaataaccatattgataaaggctattgttctcgcctataaaactataactatcagaatcttcaagtagattaattttatgtccagcaatatctaacgcttttTATTGAAg > 1:128506‑M2/244‑251 (MQ=255) 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gataaaggctattgttctcgcctataaaactataactatcagaatcttcaagtagattaattttatgtccagcaatatctaacgcttttTATTGAAGTTTTTGATACATCACCTTTTTCTGAAACTGAAAATACAGCGCCAGTATTAACTACAGGTGTCGGAGTACCGGAACCACCGCCGCCACTTCCGCAAGCTGTAACGGTTAATGATGTTAATACAATAAGACTCAATTTTGAAATTGAGTGttt < 1:177099‑M2/159‑1 (MQ=255) aaaaggctattgttctcgcctataaaactataactatcagaatcttcaagtagattaattttatgtccagcaatatctaacgcttttTATTGAAGTTTTTGATACATCACCTTTTTCTGAAACTGAAAATACAGCGCCAGTATTAACTACAGGTGTCGGAGTACCGGAACCACCGCCGCCACTTCCGCAAGCTGTAACGGTTAATGATGTTAATACAATAAGACTCAATTTTGAAATTGAGTGTTTAAAAt < 1:452603‑M2/164‑1 (MQ=255) aggctattgttctcgcctataaaactataactatcagaatcttcaagtagattaattttatgtccagcaatatctaacgcttttTATTGAAGTTTTTGATACATCACCTTTTTCTGAAACTGAAAATACAGCGCCAGTATTAACTACAGGTGTCGGAGTACCGGAACCACCGCCGCCACTTCCGCAAGCTGTAACGGTTAATGATGTTAATAc > 1:395781‑M2/85‑213 (MQ=255) 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ACTCTTCTGACCACCTATAACTACACTACCGGAATAGCGGACTTCACCCGCATTAGGGATATTTTTAGCAATTTCTCCATTGTAAAATACTTGATCATTAGGGAAATCTTCTGTCTTAGAAGATAAATAACCATATTGATAAAGGCTATTGTTCTCGCCTATAAAACTATAACTATCAGAATCTTCAAGTAGATTAATTTTATGTCCAGCAATATCTAACGCTTTTAGATTTGAATTACTATTTATTGAAGTTTTTGATACATCACCTTTTTCTGAAACTGAAAATACAGCGCCAGTATTAACTACAGGTGTCGGAGTACCGGAACCACCGCCGCCACTTCCGCAAGCTGTAACGGTTAATGATGTTAATACAATAAGACTCAATTTTGAAATTGAGTGTTTAAAATTACTCATAAAAAAACTCCTTAGAAATTAAAGTAATAGTCTAATATTTAATTAATAATCCCACTAAATTTTATAA > 1/111662‑112142 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |