| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | 1 | 111,888 | Δ17 bp | intergenic (–/+19230) | – / ← unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | 1 | = 111887 | 0 (0.000) | 61 (0.700) | 47/426 | 0.6 | 100% | intergenic (–/+19247) | –/unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| ? | 1 | 111905 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+19229) | –/unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC | |||||
CCGATAGGGGCGCCATCACTCTTCTGACCACCTATAACTACACTACCGGAATAGCGGACTTCACCCGCATTAGGGATATTTTTAGCAATTTCTCCATTGTAAAATACTTGATCATTAGGGAAATCTTCTGTCTTAGAAGATAAATAACCATATTGATAAAGGCTATTGTTCTCGCCTATAAAACTATAACTATCAGAATCTTCAAGTAGATTAATTTTATGTCCAGCAATATCTAACGCTTTTAGATTTGAATTACTATTTATTGAAGTTTTTGATACATCACCTTTTTCTGAAACTGAAAATACAGCGCCAGTATTAACTACAGGTGTCGGAGTACCGGAACCACCGCCGCCACTTCCGCAAGCTGTAACGGTTAATGATGTTAATACAATAAGACTCAATTTTGAAATTGAGTGTTTAAAATTACTCATAAAAAAACTCCTTAGAAATTAAAGTAATAGTCTAATATTTAATTAATAAT > 1/111645‑112125 | ccGATAGGGGCGCCATCACTCTTCTGACCACCTATAACTACACTACCGGAATAGCGGACTTCACCCGCATTAGGAATATTTTTAGCAATTTCTCCATTGTAAAATACTTGATCATTAGGGAAATCTTCTGTCTTAGAAGATAAATAACCATATTGATAAAGGCTATTGTTCTCGCCTATAAAACTATAACTATCAGAATCTTCAAGTAGATTAATTTTATGTCCAGCAATATCTAACGCTTTTtattgaag > 1:128506‑M1/1‑243 (MQ=255) 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1:378499‑M1/1‑45 (MQ=255) tCTTCAAGTAGATTAATTTTATGTCCAGCAATATCTAACGCTTTTtattgaagtttttgatacatcacctttttctgaaactgaaaatacagcgccagtattaactacaggtgtcggag > 1:618655‑M1/1‑45 (MQ=255) tCAAGTAGATTAATTTTATGTCCAGCAATATCTAACGCTTTTtattgaagtttttgatacatcacctttttctgaaactgaaaatacagcgccagtattaactacaggtgtcggagtaccggaaccaccgccgccacttccgcaagctgtaacggttaatgatgttaatacaataagactcaattttgaaattgagtgtttaaaattactcataaaaaaactccttagaaattaaagtaatagtctaatat < 1:335167‑M1/251‑210 (MQ=255) gATTAATTTTATGTCCAGCAATATCTAACGCTTTTtattgaagtttttgatacatcacctttttctgaaactgaaaatacagcgccagtattaact < 1:134513‑M1/96‑62 (MQ=255) aTTAATTTTATGTCCAGCAATATCTAACGCTTTTtattgaagtttttgatacatcacctttttctgaaactgaaaatacagcgccagtattaactacaggtgtcggagtaccggaaccaccgccgccacttccgcaagctgtaacggttaatgatgttaatacaataagactcaattttgaaattgagtgtttaaaattactcataaaaaaactccttagaaattaaagtaatagtctaatatttaatta < 1:840608‑M1/250‑217 (MQ=255) 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CCGATAGGGGCGCCATCACTCTTCTGACCACCTATAACTACACTACCGGAATAGCGGACTTCACCCGCATTAGGGATATTTTTAGCAATTTCTCCATTGTAAAATACTTGATCATTAGGGAAATCTTCTGTCTTAGAAGATAAATAACCATATTGATAAAGGCTATTGTTCTCGCCTATAAAACTATAACTATCAGAATCTTCAAGTAGATTAATTTTATGTCCAGCAATATCTAACGCTTTTAGATTTGAATTACTATTTATTGAAGTTTTTGATACATCACCTTTTTCTGAAACTGAAAATACAGCGCCAGTATTAACTACAGGTGTCGGAGTACCGGAACCACCGCCGCCACTTCCGCAAGCTGTAACGGTTAATGATGTTAATACAATAAGACTCAATTTTGAAATTGAGTGTTTAAAATTACTCATAAAAAAACTCCTTAGAAATTAAAGTAATAGTCTAATATTTAATTAATAAT > 1/111645‑112125 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |