| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,308,177 | Δ11 bp | intergenic (+148597/+112750) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1308177 | 1308187 | 11 | 32 [0] | [0] 32 | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1308176 | 0 (0.000) | 32 (0.360) | 23/430 | 2.4 | 100% | intergenic (+148596/+112761) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| ? | 1 | 1308188 = | 0 (0.000) | intergenic (+148608/+112749) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT | |||||
AAGTCGTCTTTCCCAGTTTTCTAATTTGGCTTTTTTAGTTACCCCTTGAACAGTTTCTGGTAGTCCAGCTACTCCCAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTCTTAACGTATTGATTTAAACAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/1307929‑1308176‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAGTTACATGAGCGAAACATTACATTGCATTCGCTTTCAGTTAAGTCTGGATTGGCTCCCTCCACATTAAAAAATGCATTGCGAGTTAGTTATCCGAAGGGAGAATGGATC > 1/1308188‑1308432 AAGTCGTCTTTCCCAGTTTTCTAATTTGGCTTTTTTAGTTACCCCTTGAACAGTTTCTGGTAGTCCAGCTACTCCCAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGGTT < 1:486843/251‑1 CTTTCCCAGTTTTCTAATTTGGCTTTTTTAGTTACCCCTTGAACAGTTTCTGGTAGTCCAGCTACTCCCAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTA > 1:117822/1‑251 TTTGGCTTTTTTAGTTACCCCTTGAACAGTTTCTGGTAGTCCAGCTACTCCCAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGG < 1:101781/251‑1 TTTTTTAGTTACCCCTTGAACAGTTTCTGGTAGTCCAGCTACTCCCAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGAC < 1:299749/251‑1 CAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAA < 1:364573/251‑1 CTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGA > 1:258807/1‑248 GTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGAT > 1:142910/1‑251 AAACTAAGTTTAATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGAC < 1:900553/139‑1 ATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAGTTACATGAGCGAAACATTAC < 1:741275/251‑1 TTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGAC < 1:174772/126‑1 CGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAGTTACATG > 1:17737/1‑220 ATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCT < 1:335256/112‑1 TCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAGTTACATGAGCGAAACATTACATTGCATTCGCTTTCAGTTAAGTCTGGATTGGCTCCCTCCACAT > 1:748594/1‑251 TCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAGTTACATGAGCGAAACATTACATTGCATTCGCTTTCAGTTAAGTCTGGATTGGCTCCCTCCACAT > 1:654766/1‑251 ATTTAAACTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGAC > 1:546691/1‑56 AAACTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAGTTACATGAGCGAAACATTACATTGCATTCGCTTTCAGTTAAGTCTGGATTGGCTCCCTCCACATTAAAAAATGCATTGCGAGTTAGTTATCCGAA > 1:87221/1‑251 AAACTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAGTTACATGAGCGAAACATTACATTGCATTCGCTTTCAGTTAAGTCTGGATTGGCTCCCTCCACATTAAAAAATGCATTGCGAGTTAGTTATCCGAA > 1:696710/1‑251 AAACTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAGTTACATGAGCGAAACATTACATTGCATTCGCTTTCAGTTAAGTCTGGATTGGCTC < 1:441461/211‑1 AAACTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAGTTACATGAGCGAAACATTACATTGCATTCGCTTTCAG < 1:815028/193‑1 CTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAGTTACATGAGCGAAACATTACATTGCATTCGCTTTCAGTTAAGTCTGGATTGGCTCCCTCCACATTAAAAAATGCATTGCGAGTTAGTTATCCGAAGGG > 1:107266/1‑251 CTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACC > 1:406427/1‑74 CTATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACC > 1:265028/1‑74 ATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAGTTACATGAGCGAAACATTACATTGCATTCGCTTTCAGTTAAGTCTGGATTGGCTCCCTCCACATTAAAAAATGCATTGCGAGTTAGTTATCCGAAGGG < 1:601089/249‑1 ATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAGTTACATGAGCGAAACATTAC < 1:590361/171‑1 ATTGTTGACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAGTTACATG > 1:794361/1‑158 GACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAGTTACATGAGCGAAACATTACAT > 1:366964/1‑167 ACTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAG < 1:859599/144‑1 CTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAGTTACATGAGCGAAACATTACATTGCATTCGCTTTCAGTTAAGTCTGGATTGGCTCCCTCCACATTAAAAAATGCATTGCGAGTTAGTTATCCGAAGGGAGAATGGATC < 1:812091/251‑1 CTTTAGGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGAC < 1:258146/39‑1 GGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAGTTACATGAGCGAAACATTACATTGCATTCGCTTTCAGTTAAGTCTGGATTGGCTCCCTCCACATTAAAAA < 1:224090/208‑1 GGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAG < 1:601234/138‑1 GGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAG > 1:316863/1‑138 AAGTCGTCTTTCCCAGTTTTCTAATTTGGCTTTTTTAGTTACCCCTTGAACAGTTTCTGGTAGTCCAGCTACTCCCAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTCTTAACGTATTGATTTAAACAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/1307929‑1308176‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAGTTACATGAGCGAAACATTACATTGCATTCGCTTTCAGTTAAGTCTGGATTGGCTCCCTCCACATTAAAAAATGCATTGCGAGTTAGTTATCCGAAGGGAGAATGGATC > 1/1308188‑1308432 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |