| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,136,980 | Δ313 bp | coding (558‑870/1110 nt) | unknown ← | Inner membrane protein of type IV secretion of T‑DNA complex, TonB‑like, VirB10 |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1136980 | 1137292 | 313 | 71 [0] | [1] 71 | unknown | Inner membrane protein of type IV secretion of T‑DNA complex, TonB‑like, VirB10 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1136979 | 0 (0.000) | 70 (0.840) | 49/426 | 0.5 | 100% | coding (871/1110 nt) | unknown | Inner membrane protein of type IV secretion of T‑DNA complex, TonB‑like, VirB10 |
| ? | 1 | 1137293 = | 0 (0.000) | coding (557/1110 nt) | unknown | Inner membrane protein of type IV secretion of T‑DNA complex, TonB‑like, VirB10 | |||||
CGGAATTAATGTTGATGATGATATTTTTCGGTGTACGGATTTCACTCCAGACTACAAATAAACGTTCTTCGCCTTGCTGAATCTGACCGCTACGGAACTCACCGAACACGGTAGAGCCTTTTTCAATCAGTAGTACCGTGCCGTTTGCACTATATACATCGTTTGCCACAACGCAGCCGAGATTGCCGGCCACGGTGGAAACAAGTTTTGTGCGTAAGGAACACTGAATAAAAGTGCCTTTTGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGCGCTTTACCCGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAACATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGATTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATTTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGGAGACAATCCTTTGATTAAACGGGGGGCGGATGGAATATCTAACGCCTCTGTCGTACTATGATTTT > 1/1137051‑1137539 | tcctatttctgtttcaattcgtatacatcgccaaaatcaatatcccgcgcaacaaaaatccctactaaatccccctggttcttataaagcgtaggcggaatattaatggttttctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGt > 1:248387‑M2/243‑251 (MQ=255) ttcgtatacatcgccaaaatcaatatcccgcgcaacaaaaatccctactaaatccccctggttcttataaagcgtaggcggaatattaatggttttctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGAcc > 1:605604‑M2/226‑249 (MQ=255) tcgtatacatcgccaaaatcaatatcccgcgcaacaaaaatccctactaaatccccctggttcttataaagcgtaggcggaatattaatggttttctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCggg > 1:288050‑M2/225‑251 (MQ=255) catcgccaaaatcaatatcccgcgcaacaaaaatccctactaaatccccctggttcttataaagcgtaggcggaatattaatggttttctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTAt < 1:508186‑M2/34‑1 (MQ=255) catcgccaaaatcaatatcccgcgcaacaaaaatccctactaaatccccctggttcttataaagcgtaggcggaatattaatggttttctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTAt < 1:482138‑M2/34‑1 (MQ=255) gccaaaatcaatatcccgcgcaacaaaaatccctactaaatccccctggttcttataaagcgtaggcggaatattaatggttttctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTatggg > 1:291545‑M2/214‑248 (MQ=255) aatcaatatcccgcgcaacaaaaatccctactaaatccccctggttcttataaagcgtaggcggaatattaatggttttctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTa > 1:55230‑M2/209‑250 (MQ=255) atcaatatcccgcgcaacaaaaatccctactaaatccccctggttcttataaagcgtaggcggaatattaatggttttctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTAcc < 1:558750‑M2/44‑1 (MQ=255) tcaatatcccgcgcaacaaaaatccctactaaatccccctggttcttataaagcgtaggcggaatattaatggttttctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTAc > 1:877090‑M2/207‑249 (MQ=255) aatccccctggttcttataaagcgtaggcggaatattaatggttttctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTtcaaata < 1:657763‑M2/76‑3 (MQ=255) aatccccctggttcttataaagcgtaggcggaatattaatggttttctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTtcaaata < 1:534921‑M2/76‑3 (MQ=255) ggttcttataaagcgtaggcggaatattaatggttttctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCtt > 1:465062‑M2/167‑251 (MQ=255) cttataaagcgtaggcggaatattaatggttttctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGc < 1:397013‑M2/89‑1 (MQ=255) gaatattaatggttttctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGttggt > 1:556672‑M2/146‑249 (MQ=255) tattaatggttttctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTcaaat > 1:895880‑M2/143‑216 (MQ=255) aatggttttctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTAc < 1:11000‑M2/113‑1 (MQ=255) ggttttctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCgt > 1:723875‑M2/136‑251 (MQ=255) tctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAg < 1:100574‑M2/121‑1 (MQ=255) ctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGt > 1:649342‑M2/130‑251 (MQ=255) ccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTg > 1:445681‑M2/128‑251 (MQ=255) ggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTAt > 1:702748‑M2/125‑251 (MQ=255) atactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATc < 1:119187‑M2/128‑1 (MQ=255) atactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATc < 1:344739‑M2/128‑1 (MQ=255) atactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCt < 1:389129‑M2/129‑1 (MQ=255) actttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTAt > 1:312015‑M2/121‑247 (MQ=255) gcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGa > 1:659247‑M2/114‑251 (MQ=255) caatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGaa < 1:707011‑M2/139‑1 (MQ=255) caatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGaa < 1:257774‑M2/139‑1 (MQ=255) caatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGa < 1:223166‑M2/138‑1 (MQ=255) tttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACAt > 1:861862‑M2/110‑251 (MQ=255) ttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACatc < 1:233769‑M2/143‑2 (MQ=255) ccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGaaa < 1:564717‑M2/148‑1 (MQ=255) ggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTg < 1:205200‑M2/124‑1 (MQ=255) ggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAAc < 1:199476‑M2/149‑1 (MQ=255) ggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACgg > 1:846658‑M2/100‑250 (MQ=255) ggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACgg > 1:669835‑M2/100‑250 (MQ=255) gcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACgg > 1:14698‑M2/99‑249 (MQ=255) attaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGAt < 1:461564‑M2/173‑1 (MQ=255) aaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGt > 1:312825‑M2/76‑251 (MQ=255) atgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAATGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTAc < 1:204564‑M2/178‑1 (MQ=255) cccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGt < 1:299954‑M2/122‑1 (MQ=255) cccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGgag < 1:443178‑M2/184‑1 (MQ=255) ccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGgaga > 1:31311‑M2/67‑251 (MQ=255) ggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATc > 1:611436‑M2/61‑188 (MQ=255) aattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTg > 1:755700‑M2/57‑186 (MQ=255) tgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCg > 1:825214‑M2/54‑168 (MQ=255) agataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGCCGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTAc > 1:386557‑M2/49‑161 (MQ=255) agataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTAc > 1:95516‑M2/49‑226 (MQ=255) gataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGc > 1:624423‑M2/48‑64 (MQ=255) gataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGGAGAc < 1:317537‑M2/186‑1 (MQ=255) ataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTAc < 1:798201‑M2/113‑1 (MQ=255) ataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGt < 1:628103‑M2/176‑1 (MQ=255) tgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGGAGACAATCCTTTGATTAAACGTGGGGc < 1:421122‑M2/209‑1 (MQ=255) ggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGGAGACAATCCTTTGATTAAACg < 1:221399‑M2/203‑1 (MQ=255) atcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGGAGACAATCCTTTGATTAAACGTGGGGCGGATGGCATATc < 1:465065‑M2/221‑1 (MQ=255) atcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGGAGACAATCCTTTGATTAAACGTGGGGCGGATGGCATATc < 1:762157‑M2/221‑1 (MQ=255) gtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGGAGACAATCCTTTGATTAAACGTGGGGCGGATGGCATATCTaa > 1:53515‑M2/27‑250 (MQ=255) tgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGGAGACAATCCTTTGATTAAACGTGGGGCGGATGGCATATCTaa < 1:340545‑M2/224‑1 (MQ=255) tgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGGAGACAATCCTTTGATTAAACGTGGGGCGGATGGCATATCTAACGCct > 1:735888‑M2/20‑248 (MQ=255) gcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGGAGACAATCCTTTGATTAAACg < 1:226926‑M2/203‑1 (MQ=255) gcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGGAGACAATCCCTTGATTAAACg > 1:851247‑M2/19‑221 (MQ=255) gcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTAGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACatc > 1:84462‑M2/19‑160 (MQ=255) taacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTg > 1:80894‑M2/16‑139 (MQ=255) acatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGGAGACAATCCTTTGATTAAACGTGGGGCGGATGGCATATCTAACGCCTCTGTCgtt > 1:824851‑M2/14‑249 (MQ=255) acatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGGTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGGAGACAATCCTTTGATTAAACGTGGGGCGGATGGCATATCTAACGCCTCTGt < 1:438377‑M2/233‑1 (MQ=255) catgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTAc < 1:505888‑M2/113‑1 (MQ=255) catgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGgag < 1:119367‑M2/184‑1 (MQ=255) tgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGAACGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCt < 1:45897‑M2/84‑1 (MQ=255) tggcaatGCCAACAGTAAAGTGGAATTGACCGGGGGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACCTACTGGCGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGGATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGGCATCGGTAGTACCCGGAGACAATCCTTTGATTAAACGTGGGGCGGATGGCATATCTAACGCCTCTGTCGTTCTATGAt < 1:711814/245‑1 (MQ=255) cattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGGAGACAATCCTTTGATTAAACGTGGGGCGGATGGCATATCTAACGCCTCTGTCGTTCTATGAttt < 1:572534‑M2/246‑1 (MQ=255) attGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATCTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGGAGACAATCCTTTGATTAAACGTGGGGCGGATGGCATATCTAACGCCTCTGTCGTTCTATGAtttt > 1:436239‑M2/4‑250 (MQ=255) | CGGAATTAATGTTGATGATGATATTTTTCGGTGTACGGATTTCACTCCAGACTACAAATAAACGTTCTTCGCCTTGCTGAATCTGACCGCTACGGAACTCACCGAACACGGTAGAGCCTTTTTCAATCAGTAGTACCGTGCCGTTTGCACTATATACATCGTTTGCCACAACGCAGCCGAGATTGCCGGCCACGGTGGAAACAAGTTTTGTGCGTAAGGAACACTGAATAAAAGTGCCTTTTGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGCGCTTTACCCGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAACATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGATTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATTTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGGAGACAATCCTTTGATTAAACGGGGGGCGGATGGAATATCTAACGCCTCTGTCGTACTATGATTTT > 1/1137051‑1137539 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |