| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,136,980 | Δ313 bp | coding (558‑870/1110 nt) | unknown ← | Inner membrane protein of type IV secretion of T‑DNA complex, TonB‑like, VirB10 |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1136980 | 1137292 | 313 | 71 [0] | [1] 71 | unknown | Inner membrane protein of type IV secretion of T‑DNA complex, TonB‑like, VirB10 |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1136979 | 0 (0.000) | 70 (0.840) | 49/426 | 0.5 | 100% | coding (871/1110 nt) | unknown | Inner membrane protein of type IV secretion of T‑DNA complex, TonB‑like, VirB10 |
| ? | 1 | 1137293 = | 0 (0.000) | coding (557/1110 nt) | unknown | Inner membrane protein of type IV secretion of T‑DNA complex, TonB‑like, VirB10 | |||||
TCCTATTTCTGTTTCAATTCGTACACATCGCCAAAATCAATATCCCGCGCAACAAAAATCCCCACTAAATCCCCTTGGTTCTTATAAAGCGTAGGGGGAATATTAATGGTTTTCTCTAAGATACTTTGTGCAATTTCCGAGCCGGCTTGTACCGTATCCGTTGGTTGGAAAGTTCCGCGTTTTGCTAATTGGGTAGATAGTGCACTGGTTGAATCGGTGATCATGCTTAACATGATGGCATTACCGAAACGTTCCCAGAAATGATTATCTACATAGCCCGGAATACCGGTTCCGCCTAATTCATCGGTTGCGCCGGAATTAATGTTGATGATGATATTTTTCGGTGTACGGATTTCACTCCAGACTACAAATAAACGTTCTTCGCCTTGCTGAATCTGACCGCTACGGAACTCACCGAACACGGTAGAGCCTTTTTCAATCAGTAGTACCGTGCCGTTTGCACTATATACATCGTTTGCCACAACGCAG > 1/1136738‑1137226 | tcctATTTCTGTTTCAATTCGTATACATCGCCAAAATCAATATCCCGCGCAACAAAAATCCCTACTAAATCCCCCTGGTTCTTATAAAGCGTAGGCGGAATATTAATGGTTTTCTCCAGGATACTTTGTGCAATTTCAGAGCCGGCTTGTACCGTATCAGTCGGATTAAATGTCCCCCGTTTGGCTAATTGAGTAGATAATGCACTGGTTGAATCGGTGATCATGCTTAACATGATGGCATTgccaacagt > 1:248387‑M1/1‑242 (MQ=255) 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TCCTATTTCTGTTTCAATTCGTACACATCGCCAAAATCAATATCCCGCGCAACAAAAATCCCCACTAAATCCCCTTGGTTCTTATAAAGCGTAGGGGGAATATTAATGGTTTTCTCTAAGATACTTTGTGCAATTTCCGAGCCGGCTTGTACCGTATCCGTTGGTTGGAAAGTTCCGCGTTTTGCTAATTGGGTAGATAGTGCACTGGTTGAATCGGTGATCATGCTTAACATGATGGCATTACCGAAACGTTCCCAGAAATGATTATCTACATAGCCCGGAATACCGGTTCCGCCTAATTCATCGGTTGCGCCGGAATTAATGTTGATGATGATATTTTTCGGTGTACGGATTTCACTCCAGACTACAAATAAACGTTCTTCGCCTTGCTGAATCTGACCGCTACGGAACTCACCGAACACGGTAGAGCCTTTTTCAATCAGTAGTACCGTGCCGTTTGCACTATATACATCGTTTGCCACAACGCAG > 1/1136738‑1137226 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |