| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,031,466 | Δ11 bp | intergenic (‑263/‑138) | unknown ← / → unknown | hypothetical protein/Repressor protein CI |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1031466 | 1031476 | 11 | 32 [0] | [0] 32 | unknown/unknown | hypothetical protein/Repressor protein CI |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1031465 | 0 (0.000) | 32 (0.380) | 23/430 | 2.4 | 100% | intergenic (‑262/‑149) | unknown/unknown | hypothetical protein/Repressor protein CI |
| ? | 1 | 1031477 = | 0 (0.000) | intergenic (‑274/‑137) | unknown/unknown | hypothetical protein/Repressor protein CI | |||||
CCTTCGGATAACTAACTCGCAATGCATTTTTTAATGTGGAGGGAGCCAATCCAGACTTAACTGAAAGCGAATGCAATGTAATGTTTCGCTCATGTAACTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACTAAGTTTAAAACCAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTGTTTAAATCAATACGTTAAGAGGTATTGTAAATTAAACTTAGTTTTAATCCTTGGTTTAAAACTAGGAGGTTAGATATGATCCGAGAGTGGCTAGAACTGAAAGACCTTTTGGGAGTAGCTGGACTACCAGAAACTGTTCAAGGGGTAACTAAAAAAGCCAAATTAGAAAACTGGGAAAGACGACTT > 1/1031232‑1031724 | gatccattctcccttcggataactaactcgcaatgcattttttaatgtggagggagccaatccagacttaactgaaagcgaatgcaatgtaatgtttcgctcatgtaactcgtaaacaatccgctttctactccaatccttttttttcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAg > 1:812091‑M2/246‑251 (MQ=255) cccttcggataactaactcgcaatgcattttttaatgtggagggagccaatccagacttaactgaaagcgaatgcaatgtaatgtttcgctcatgtaactcgtaaacaatccgctttctactccaatccttttttttcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAAt > 1:601089‑M2/236‑249 (MQ=255) cccttcggataactaactcgcaatgcattttttaatgtggagggagccaatccagacttaactgaaagcgaatgcaatgtaatgtttcgctcatgtaactcgtaaacaatccgctttctactccaatccttttttttcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAg < 1:107266‑M2/16‑1 (MQ=255) ttcggataactaactcgcaatgcattttttaatgtggagggagccaatccagacttaactgaaagcgaatgcaatgtaatgtttcgctcatgtaactcgtaaacaatccgctttctactccaatccttttttttcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAGttt < 1:87221‑M2/19‑1 (MQ=255) ttcggataactaactcgcaatgcattttttaatgtggagggagccaatccagacttaactgaaagcgaatgcaatgtaatgtttcgctcatgtaactcgtaaacaatccgctttctactccaatccttttttttcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAGttt < 1:696710‑M2/19‑1 (MQ=255) tttttaatgtggagggagccaatccagacttaactgaaagcgaatgcaatgtaatgtttcgctcatgtaactcgtaaacaatccgctttctactccaatccttttttttcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacc > 1:224090‑M2/208‑208 (MQ=255) atgtggagggagccaatccagacttaactgaaagcgaatgcaatgtaatgtttcgctcatgtaactcgtaaacaatccgctttctactccaatccttttttttcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGa < 1:748594‑M2/50‑1 (MQ=255) atgtggagggagccaatccagacttaactgaaagcgaatgcaatgtaatgtttcgctcatgtaactcgtaaacaatccgctttctactccaatccttttttttcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGa < 1:654766‑M2/50‑1 (MQ=255) gagccaatccagacttaactgaaagcgaatgcaatgtaatgtttcgctcatgtaactcgtaaacaatccgctttctactccaatccttttttttcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAGttt > 1:441461‑M2/193‑211 (MQ=255) ctgaaagcgaatgcaatgtaatgtttcgctcatgtaactcgtaaacaatccgctttctactccaatccttttttttcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAGttt > 1:815028‑M2/175‑193 (MQ=255) atgtaatgtttcgctcatgtaactcgtaaacaatccgctttctactccaatccttttttttcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTc < 1:366964‑M2/8‑1 (MQ=255) gtaatgtttcgctcatgtaactcgtaaacaatccgctttctactccaatccttttttttcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAAt > 1:590361‑M2/158‑171 (MQ=255) gtaatgtttcgctcatgtaactcgtaaacaatccgctttctactccaatccttttttttcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTAAAt > 1:741275‑M2/158‑251 (MQ=255) catgtaactcgtaaacaatccgctttctactccaatccttttttttcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAAt < 1:794361‑M2/14‑1 (MQ=255) catgtaactcgtaaacaatccgctttctactccaatccttttttttcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACg < 1:17737‑M2/76‑1 (MQ=255) ctcgtaaacaatccgctttctactccaatccttttttttcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacc < 1:316863‑M2/1‑1 (MQ=255) ctcgtaaacaatccgctttctactccaatccttttttttcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacc > 1:601234‑M2/138‑138 (MQ=255) ctcgtaaacaatccgctttctactccaatccttttttttcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGt > 1:859599‑M2/138‑144 (MQ=255) atccgctttctactccaatccttttttttcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTAAATTAAACTTAGTTTTAATCCTTGGTTTAAAAc < 1:142910‑M2/124‑1 (MQ=255) tcatagttcctcgcttttgcatttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTAAATTAAACTTAGTTTTAATCCTTGGTTTAAAACTAGGAGGTTAGATATGATCCGagag < 1:258807‑M2/149‑1 (MQ=255) tttgaataatttaaagattaggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTAAATTAAACTTAGTTTTAATCCTTGGTTTAAAACTAGGAGGTTAGATATGATCCGAGAGTGGCTAGAACTGAAAGACCTTTTg > 1:364573‑M2/79‑251 (MQ=255) aggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAat > 1:335256‑M2/60‑112 (MQ=255) ggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAg < 1:265028‑M2/16‑1 (MQ=255) ggttaaacttgggtgtaaatctttagtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAg < 1:406427‑M2/16‑1 (MQ=255) gtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAg > 1:258146‑M2/34‑39 (MQ=255) gtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAGTTtaaat < 1:546691‑M2/23‑1 (MQ=255) gtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTaaa > 1:174772‑M2/34‑126 (MQ=255) gtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTAAATTAAACTTAGttt > 1:900553‑M2/34‑139 (MQ=255) gtcttaccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTAAATTAAACTTAGTTTTAATCCTTGGTTTAAAACTAGGAGGTTAGATATGATCCGAGAGTGGCTAGAACTGAAAGACCTTTTGGGAGTAGCTGGACTACCAGAAACTGTTCAAGGGGTAACTaaaaaa > 1:299749‑M2/34‑251 (MQ=255) ccccttagcgttaaacttagtttaaacCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTAAATTAAACTTAGTTTTAATCCTTGGTTTAAAACTAGGAGGTTAGATATGATCCGAGAGTGGCTAGAACTGAAAGACCTTTTGGGAGTAGCTGGACTACCAGAAACTGTTCAAGGGGTAACTAAAAAAGCCaaa > 1:101781‑M2/28‑251 (MQ=255) tagtttaaacCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTAAATTAAACTTAGTTTTAATCCTTGGTTTAAAACTAGGAGGTTAGATATGATCCGAGAGTGGCTAGAACTGAAAGACCTTTTGGGAGTAGCTGGACTACCAGAAACTGTTCAAGGGGTAACTAAAAAAGCCAAATTAGAAAACTGGGAAAg < 1:117822‑M2/241‑1 (MQ=255) aacCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTAAATTAAACTTAGTTTTAATCCTTGGTTTAAAACTAGGAGGTTAGATATGATCCGAGAGTGGCTAGAACTGAAAGACCTTTTGGGAGTAGCTGGACTACCAGAAACTGTTCAAGGGGTAACTAAAAAAGCCAAATTAGAAAACTGGGAAAGACGACtt > 1:486843‑M2/4‑251 (MQ=255) | CCTTCGGATAACTAACTCGCAATGCATTTTTTAATGTGGAGGGAGCCAATCCAGACTTAACTGAAAGCGAATGCAATGTAATGTTTCGCTCATGTAACTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACTAAGTTTAAAACCAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTGTTTAAATCAATACGTTAAGAGGTATTGTAAATTAAACTTAGTTTTAATCCTTGGTTTAAAACTAGGAGGTTAGATATGATCCGAGAGTGGCTAGAACTGAAAGACCTTTTGGGAGTAGCTGGACTACCAGAAACTGTTCAAGGGGTAACTAAAAAAGCCAAATTAGAAAACTGGGAAAGACGACTT > 1/1031232‑1031724 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |