| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,031,466 | Δ11 bp | intergenic (‑263/‑138) | unknown ← / → unknown | hypothetical protein/Repressor protein CI |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1031466 | 1031476 | 11 | 32 [0] | [0] 32 | unknown/unknown | hypothetical protein/Repressor protein CI |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1031465 | 0 (0.000) | 32 (0.380) | 23/430 | 2.4 | 100% | intergenic (‑262/‑149) | unknown/unknown | hypothetical protein/Repressor protein CI |
| ? | 1 | 1031477 = | 0 (0.000) | intergenic (‑274/‑137) | unknown/unknown | hypothetical protein/Repressor protein CI | |||||
GATCCATTCTCCCTTCGGATAACTAACTCGCAATGCATTTTTTAATGTGGAGGGAGCCAATCCAGACTTAACTGAAAGCGAATGCAATGTAATGTTTCGCTCATGTAACTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/1031221‑1031465‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTGTTTAAATCAATACGTTAAGAGGTATTGTAAATTAAACTTAGTTTTAATCCTTGGTTTAAAACTAGGAGGTTAGATATGATCCGAGAGTGGCTAGAACTGAAAGACCTTTTGGGAGTAGCTGGACTACCAGAAACTGTTCAAGGGGTAACTAAAAAAGCCAAATTAGAAAACTGGGAAAGACGACTT > 1/1031477‑1031724 GATCCATTCTCCCTTCGGATAACTAACTCGCAATGCATTTTTTAATGTGGAGGGAGCCAATCCAGACTTAACTGAAAGCGAATGCAATGTAATGTTTCGCTCATGTAACTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAG > 1:812091/1‑251 CCCTTCGGATAACTAACTCGCAATGCATTTTTTAATGTGGAGGGAGCCAATCCAGACTTAACTGAAAGCGAATGCAATGTAATGTTTCGCTCATGTAACTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAG < 1:107266/251‑1 CCCTTCGGATAACTAACTCGCAATGCATTTTTTAATGTGGAGGGAGCCAATCCAGACTTAACTGAAAGCGAATGCAATGTAATGTTTCGCTCATGTAACTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAAT > 1:601089/1‑249 TTCGGATAACTAACTCGCAATGCATTTTTTAATGTGGAGGGAGCCAATCCAGACTTAACTGAAAGCGAATGCAATGTAATGTTTCGCTCATGTAACTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAGTTT < 1:87221/251‑1 TTCGGATAACTAACTCGCAATGCATTTTTTAATGTGGAGGGAGCCAATCCAGACTTAACTGAAAGCGAATGCAATGTAATGTTTCGCTCATGTAACTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAGTTT < 1:696710/251‑1 TTTTTAATGTGGAGGGAGCCAATCCAGACTTAACTGAAAGCGAATGCAATGTAATGTTTCGCTCATGTAACTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACC > 1:224090/1‑208 ATGTGGAGGGAGCCAATCCAGACTTAACTGAAAGCGAATGCAATGTAATGTTTCGCTCATGTAACTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGA < 1:748594/251‑1 ATGTGGAGGGAGCCAATCCAGACTTAACTGAAAGCGAATGCAATGTAATGTTTCGCTCATGTAACTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGA < 1:654766/251‑1 GAGCCAATCCAGACTTAACTGAAAGCGAATGCAATGTAATGTTTCGCTCATGTAACTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAGTTT > 1:441461/1‑211 CTGAAAGCGAATGCAATGTAATGTTTCGCTCATGTAACTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAGTTT > 1:815028/1‑193 ATGTAATGTTTCGCTCATGTAACTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTC < 1:366964/167‑1 GTAATGTTTCGCTCATGTAACTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTAAAT > 1:741275/1‑251 GTAATGTTTCGCTCATGTAACTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAAT > 1:590361/1‑171 CATGTAACTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACG < 1:17737/220‑1 CATGTAACTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAAT < 1:794361/158‑1 CTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGT > 1:859599/1‑144 CTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACC < 1:316863/138‑1 CTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACC > 1:601234/1‑138 ATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTAAATTAAACTTAGTTTTAATCCTTGGTTTAAAAC < 1:142910/251‑1 TCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTAAATTAAACTTAGTTTTAATCCTTGGTTTAAAACTAGGAGGTTAGATATGATCCGAGAG < 1:258807/248‑1 TTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTAAATTAAACTTAGTTTTAATCCTTGGTTTAAAACTAGGAGGTTAGATATGATCCGAGAGTGGCTAGAACTGAAAGACCTTTTG > 1:364573/1‑251 AGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAAT > 1:335256/1‑112 GGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAG < 1:265028/74‑1 GGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAG < 1:406427/74‑1 GTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTAAATTAAACTTAGTTTTAATCCTTGGTTTAAAACTAGGAGGTTAGATATGATCCGAGAGTGGCTAGAACTGAAAGACCTTTTGGGAGTAGCTGGACTACCAGAAACTGTTCAAGGGGTAACTAAAAAA > 1:299749/1‑251 GTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTAAATTAAACTTAGTTT > 1:900553/1‑139 GTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTAAA > 1:174772/1‑126 GTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAGTTTAAAT < 1:546691/56‑1 GTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAG > 1:258146/1‑39 CCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTAAATTAAACTTAGTTTTAATCCTTGGTTTAAAACTAGGAGGTTAGATATGATCCGAGAGTGGCTAGAACTGAAAGACCTTTTGGGAGTAGCTGGACTACCAGAAACTGTTCAAGGGGTAACTAAAAAAGCCAAA > 1:101781/1‑251 TAGTTTAAACCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTAAATTAAACTTAGTTTTAATCCTTGGTTTAAAACTAGGAGGTTAGATATGATCCGAGAGTGGCTAGAACTGAAAGACCTTTTGGGAGTAGCTGGACTACCAGAAACTGTTCAAGGGGTAACTAAAAAAGCCAAATTAGAAAACTGGGAAAG < 1:117822/251‑1 AACCTAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTATTTAAATCAATACGTTAATAGGTATTGTAAATTAAACTTAGTTTTAATCCTTGGTTTAAAACTAGGAGGTTAGATATGATCCGAGAGTGGCTAGAACTGAAAGACCTTTTGGGAGTAGCTGGACTACCAGAAACTGTTCAAGGGGTAACTAAAAAAGCCAAATTAGAAAACTGGGAAAGACGACTT > 1:486843/1‑251 GATCCATTCTCCCTTCGGATAACTAACTCGCAATGCATTTTTTAATGTGGAGGGAGCCAATCCAGACTTAACTGAAAGCGAATGCAATGTAATGTTTCGCTCATGTAACTCGTAAACAATCCGCTTTCTACTCCAATCCTTTTTTTTCATAGTTCCTCGCTTTTGCATTTGAATAATTTAAAGATTAGGTTAAACTTGGGTGTAAATCTTTAGTCTTACCCCTTAGCGTTAAACTTAGTTTAAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/1031221‑1031465‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCAAAGTCAACAATAGTTTAAATAAAAATTTTGTAAAACTTATGTAAAGAAATTTATTTTTGTTTAAATCAATACGTTAAGAGGTATTGTAAATTAAACTTAGTTTTAATCCTTGGTTTAAAACTAGGAGGTTAGATATGATCCGAGAGTGGCTAGAACTGAAAGACCTTTTGGGAGTAGCTGGACTACCAGAAACTGTTCAAGGGGTAACTAAAAAAGCCAAATTAGAAAACTGGGAAAGACGACTT > 1/1031477‑1031724 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |