| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 118,608 | Δ17 bp | coding (174‑190/765 nt) | unknown → | hypothetical protein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 118608 | 118624 | 17 | 61 [0] | [0] 61 | unknown | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | 1 | = 118607 | 0 (0.000) | 61 (0.730) | 47/426 | 0.5 | 100% | coding (173/765 nt) | unknown | hypothetical protein |
| ? | 1 | 118625 = | 0 (0.000) | coding (191/765 nt) | unknown | hypothetical protein | |||||
ATTATTAATTAAATATTAGACTATTACTTTAATTTCTAAGGAGTTTTTTTATGAGTAATTTTAAACACTCAATTTCAAAATTGAGTCTTATTGTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAATAGTAATTCAAATCTAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTATCTTCTAAGACAGAAGATTTCCCTAATGATCAAGTATTTTACAATGGAGAAATTGCTAAAAATATCCCTAATGCGGGTGAAGTCCGCTATTCCGGTAGTGTAGTTATAGGTGGTCAGAAGAGTGATGGCGCCCCTATCGG > 1/118385‑118865 | ttataaaatttagtgggattattaattaaatattagactattactttaatttctaaggagtttttttatgagtaattttaaacactcaatttcaaaattgagtcttattgtattaacatcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGat < 1:39068‑M2/11‑1 (MQ=255) atttagtgggattattaattaaatattagactattactttaatttctaaggagtttttttatgagtaattttaaacactcaatttcaaaattgagtcttattgtattaacatcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtgggtccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttccgaaaaaggggatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTg > 1:826825‑M2/234‑248 (MQ=255) gggattattaattaaatattagactattactttaatttctaaggagtttttttatgagtaattttaaacactcaatttcaaaattgagtcttattgtattaacatcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtgggtccgggactccgacacctgtaggtaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggcgaggtatcaaaaaactcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATaa > 1:854337‑M2/227‑251 (MQ=255) ggattattaattaaatattagactattactttaatttctaaggagtttttttatgagtaattttaaacactcaatttcaaaattgagtcttattgtattaacatcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggggatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATaaa > 1:307082‑M2/226‑251 (MQ=255) taattaaatattagactattactttaatttctaaggagtttttttatgagtaattttaaacactcaatttcaaaattgagtcttattgtattaacatcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAAt > 1:840608‑M2/219‑250 (MQ=255) atattagactattactttaatttctaaggagtttttttatgagtaattttaaacactcaatttcaaaattgagtcttattgtattaacatcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGat > 1:557517‑M2/212‑222 (MQ=255) atattagactattactttaatttctaaggagtttttttatgagtaattttaaacactcaatttcaaaattgagtcttattgtattaacatcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGa > 1:335167‑M2/212‑251 (MQ=255) 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(MQ=255) gtttttttatgagtaattttaaacactcaatttcaaaattgagtcttattgtattaacatcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGa < 1:378499‑M2/43‑1 (MQ=255) gtttttttatgagtaattttaaacactcaatttcaaaattgagtcttattgtattaacatcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTc < 1:519267‑M2/46‑1 (MQ=255) taattttaaacactcaatttcaaaattgagtcttattgtattaacatcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGcc < 1:268975‑M2/81‑1 (MQ=255) attttaaacactcaatttcaaaattgagtcttattgtattaacatcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAAt < 1:205785‑M2/28‑1 (MQ=255) attttaaacactcaatttcaaaattgagtcttattgtattaacatcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCctttt > 1:452603‑M2/167‑250 (MQ=255) aaacactcaatttcaaaattgagtcttattgtattaacatcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATc > 1:177099‑M2/162‑248 (MQ=255) acactcaatttcaaaattgagtcttattgtattaacatcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAatat < 1:578434‑M2/92‑1 (MQ=255) 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attgtattaacatcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTATCTTCTAAGACagaag > 1:713254‑M2/135‑251 (MQ=255) gtattaacatcattagccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGttattta < 1:7818‑M2/101‑1 (MQ=255) gtattaacatcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAAt < 1:133286‑M2/28‑1 (MQ=255) gtattaacatcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAAc < 1:571596‑M2/74‑1 (MQ=255) 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gtattaacatcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttcccgtactcccacacctgtagttaacactggcaccgtattttcagtttcagaaaaaggggatgtatcaaaaacttcaattaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATTAAATTAATCTACTTTAAGATTTTGATAGTTATAGTTTTTTAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATCTGGGTTTTTTTCTTCTAAg > 1:196024‑M2/132‑241 (MQ=255) catcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATc > 1:886315‑M2/125‑211 (MQ=255) atcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGat < 1:166177‑M2/11‑1 (MQ=255) tcattaaccgttacagcttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTATCTTCTAAGACAGAAGATTTCCCTAATg > 1:515661‑M2/123‑251 (MQ=255) 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1:480167‑M2/114‑251 (MQ=255) cttgcggaagtggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTATCTTCTAAGACAGAAGATTTCCCTAATGATCAAGTATTTTAc < 1:746695‑M2/143‑1 (MQ=255) tggcggcggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTATCTTCTAAGACAGAAGATTTCCCTAATGATCAAGTATTTTACAATGGAGAAAtt < 1:38214‑M2/155‑1 (MQ=255) cggtggttccggtactccgacacctgtagttaatactggcgctgtattttcagtttcagaaaaaggtgatgtatcaaaaacttcaataaaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTATCTTCTAAGACAGAAGATTTCCCTAATGATCAAGTATTTTACAATGGAGAAATTGCTaaa > 1:691486‑M2/91‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |