| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 118,608 | Δ17 bp | coding (174‑190/765 nt) | unknown → | hypothetical protein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 118608 | 118624 | 17 | 61 [0] | [0] 61 | unknown | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | 1 | = 118607 | 0 (0.000) | 61 (0.730) | 47/426 | 0.5 | 100% | coding (173/765 nt) | unknown | hypothetical protein |
| ? | 1 | 118625 = | 0 (0.000) | coding (191/765 nt) | unknown | hypothetical protein | |||||
TTATAAAATTTAGTGGGATTATTAATTAAATATTAGACTATTACTTTAATTTCTAAGGAGTTTTTTTATGAGTAATTTTAAACACTCAATTTCAAAATTGAGTCTTATTGTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/118368‑118607‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTATCTTCTAAGACAGAAGATTTCCCTAATGATCAAGTATTTTACAATGGAGAAATTGCTAAAAATATCCCTAATGCGGGTGAAGTCCGCTATTCCGGTAGTGTAGTTATAGGTGGTCAGAAGAGTGATGGCGCCCCTATCGG > 1/118625‑118865 TTATAAAATTTAGTGGGATTATTAATTAAATATTAGACTATTACTTTAATTTCTAAGGAGTTTTTTTATGAGTAATTTTAAACACTCAATTTCAAAATTGAGTCTTATTGTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGAT < 1:39068/251‑1 ATTTAGTGGGATTATTAATTAAATATTAGACTATTACTTTAATTTCTAAGGAGTTTTTTTATGAGTAATTTTAAACACTCAATTTCAAAATTGAGTCTTATTGTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGGTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCCGAAAAAGGGGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTG > 1:826825/1‑248 GGGATTATTAATTAAATATTAGACTATTACTTTAATTTCTAAGGAGTTTTTTTATGAGTAATTTTAAACACTCAATTTCAAAATTGAGTCTTATTGTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGGTCCGGGACTCCGACACCTGTAGGTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGCGAGGTATCAAAAAACTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAA > 1:854337/1‑251 GGATTATTAATTAAATATTAGACTATTACTTTAATTTCTAAGGAGTTTTTTTATGAGTAATTTTAAACACTCAATTTCAAAATTGAGTCTTATTGTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGGGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAA > 1:307082/1‑251 TAATTAAATATTAGACTATTACTTTAATTTCTAAGGAGTTTTTTTATGAGTAATTTTAAACACTCAATTTCAAAATTGAGTCTTATTGTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAAT > 1:840608/1‑250 ATATTAGACTATTACTTTAATTTCTAAGGAGTTTTTTTATGAGTAATTTTAAACACTCAATTTCAAAATTGAGTCTTATTGTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGA > 1:335167/1‑251 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GTTTTTTTATGAGTAATTTTAAACACTCAATTTCAAAATTGAGTCTTATTGTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTC < 1:519267/227‑1 GTTTTTTTATGAGTAATTTTAAACACTCAATTTCAAAATTGAGTCTTATTGTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGA < 1:378499/224‑1 GTTTTTTTATGAGTAATTTTAAACACTCAATTTCAAAATTGAGTCTTATTGTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGC < 1:37160/197‑1 TAATTTTAAACACTCAATTTCAAAATTGAGTCTTATTGTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCC < 1:268975/249‑1 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ATTGTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTATCTTCTAAGACAGAAG > 1:713254/1‑251 GTATTAACATCATTAGCCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTA < 1:7818/232‑1 GTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTATCTTCTAAGAC > 1:843792/1‑243 GTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATC > 1:482180/1‑218 GTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCT < 1:395781/213‑1 GTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAAC < 1:571596/205‑1 GTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAAT < 1:133286/159‑1 GTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCCGTACTCCCACACCTGTAGTTAACACTGGCACCGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGGGATGTATCAAAAACTTCAATTAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATTAAATTAATCTACTTTAAGATTTTGATAGTTATAGTTTTTTAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATCTGGGTTTTTTTCTTCTAAG > 1:196024/1‑241 CATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATC > 1:886315/1‑211 ATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGAT < 1:166177/134‑1 TCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTATCTTCTAAGACAGAAGATTTCCCTAATG > 1:515661/1‑251 AACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTA < 1:440000/218‑1 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GTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTATCTTCTAAGACAGAAGATTTCC > 1:867325/1‑170 GTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAG < 1:502877/113‑1 TTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTATCTTCTAAGACAGAAGATTTCCCTAATGATCAAGTATTTTACAATGGAGAAATTGCTAAAAATATTCCTAATGCGGGTGAAGTCCGCTATTCCGGTAGTGTAGTTA < 1:11404/251‑1 TTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTATCTTCTAAGACAGAAGATTTCCCTAATGATCAAGTATTTTACAATGGAGAAATTGCTAAAAATATTCCTAATGCGGGTGAAGTCCGCTATTCCGGTAGTGTAGTTATAGGT < 1:876879/249‑1 GAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTATCTTCTAAGACAGAAGATTTCCCTAATGATCAAGTATTTTACAATGGAGAAATTGCTAAAAATATTCCTAATGCGGGTGAAGTCCGCTATTCCGGTAGTGTAGTTA < 1:192363/239‑1 GGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTATCTTCTAAGACAGAAGATTTCCCTAATGATCAAGTATTTTACAATGGAGAAATTGCTAAAAATATTCCTAATGCGGGTGAAGTCCGCTATTCCGGTAGTGTAGTTATAGG > 1:418958/1‑237 CTTCAATAAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTATCTTCTAAGACAGAAGATTTCCCTAATGATCAAGTATTTTACAATGGAGAAATTGCTAAAAATATTCCTAATGCGGGTGAAGTCCGCTATTCCGGTAGTGTAGTTATAGGTGGTCAGAAGAGTGATGGCGCCCCTATCGG < 1:128506/251‑1 TTATAAAATTTAGTGGGATTATTAATTAAATATTAGACTATTACTTTAATTTCTAAGGAGTTTTTTTATGAGTAATTTTAAACACTCAATTTCAAAATTGAGTCTTATTGTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/118368‑118607‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTATCTTCTAAGACAGAAGATTTCCCTAATGATCAAGTATTTTACAATGGAGAAATTGCTAAAAATATCCCTAATGCGGGTGAAGTCCGCTATTCCGGTAGTGTAGTTATAGGTGGTCAGAAGAGTGATGGCGCCCCTATCGG > 1/118625‑118865 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |