| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | 1 | 118,608 | Δ17 bp | coding (174‑190/765 nt) | unknown → | hypothetical protein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | 1 | 118608 | 118624 | 17 | 61 [0] | [0] 61 | unknown | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | 1 | = 118607 | 0 (0.000) | 61 (0.730) | 47/426 | 0.5 | 100% | coding (173/765 nt) | unknown | hypothetical protein |
| ? | 1 | 118625 = | 0 (0.000) | coding (191/765 nt) | unknown | hypothetical protein | |||||
TTATAAAATTTAGTGGGATTATTAATTAAATATTAGACTATTACTTTAATTTCTAAGGAGTTTTTTTATGAGTAATTTTAAACACTCAATTTCAAAATTGAGTCTTATTGTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAATAGTAATTCAAATCTAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTATCTTCTAAGACAGAAGATTTCCCTAATGATCAAGTATTTTACAATGGAGAAATTGCTAAAAATATCCCTAATGCGGGTGAAGTCCGCTATTCCGGTAGTGTAGTTATAGGTGGTCAGAAGAGT > 1/118368‑118848 | ttATAAAATTTAGTGGGATTATTAATTAAATATTAGACTATTACTTTAATTTCTAAGGAGTTTTTTTATGAGTAATTTTAAACACTCAATTTCAAAATTGAGTCTTATTGTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAAaagcgttagat < 1:39068‑M1/251‑12 (MQ=255) 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TTATAAAATTTAGTGGGATTATTAATTAAATATTAGACTATTACTTTAATTTCTAAGGAGTTTTTTTATGAGTAATTTTAAACACTCAATTTCAAAATTGAGTCTTATTGTATTAACATCATTAACCGTTACAGCTTGCGGAAGTGGCGGCGGTGGTTCCGGTACTCCGACACCTGTAGTTAATACTGGCGCTGTATTTTCAGTTTCAGAAAAAGGTGATGTATCAAAAACTTCAATAAATAGTAATTCAAATCTAAAAGCGTTAGATATTGCTGGACATAAAATTAATCTACTTGAAGATTCTGATAGTTATAGTTTTATAGGCGAGAACAATAGCCTTTATCAATATGGTTATTTATCTTCTAAGACAGAAGATTTCCCTAATGATCAAGTATTTTACAATGGAGAAATTGCTAAAAATATCCCTAATGCGGGTGAAGTCCGCTATTCCGGTAGTGTAGTTATAGGTGGTCAGAAGAGT > 1/118368‑118848 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |