| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1009324 = | 4 (0.050) | 22 (0.300) | 15/376 | 3.2 | 92.6% | intergenic (+172/‑89) | unknown/unknown | Threonyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.3)/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| ? | 1 | = 1009313 | 0 (0.000) | intergenic (+161/‑100) | unknown/unknown | Threonyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.3)/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
TTCACCGTGGAAGAATTTTTAGACATTCTGAAAAAACAAGTGAGAAATCGCGAATTGAAATTATTGGGTGAGGCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGC > 1/1009075‑1009568 | ttCACCGTGGAAGAATTTTTAGACATTCTGAAAAAACAAGTGAGAAATCGCGAATTGAAATTATTGGGTGAGGCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCATTAATAGGAGTAAAAAATATGcttgccttgcct < 1:483973/251‑1 (MQ=255) aCATTCTGAAAAAACAAGTGAGAAATCGCGAATTGAAATTATTGGGTGAGGCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGcttgccttgccttgccttgccttgcctaaacta < 1:109985/250‑7 (MQ=255) ttattGGGTGAGGCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTaaaa > 1:762537/1‑251 (MQ=255) gCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGcttgccttgccttgccttgccttgcctaaact < 1:563741/199‑6 (MQ=255) gCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCggag > 1:651693/1‑251 (MQ=255) gCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCggag > 1:515156/1‑251 (MQ=255) gCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCAAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGcttgccttgccttgccttgccttgcctaaac > 1:446700/1‑194 (MQ=255) aGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCAc > 1:230110/1‑224 (MQ=255) aaTTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGcttgccttgcc > 1:416748/1‑165 (MQ=255) gAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACtttt > 1:99769/1‑250 (MQ=255) tAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGcttgccttgccttgccttgccttgcctaaac > 1:82494/1‑158 (MQ=255) gAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGcttgccttgccttgccttgccttgcct > 1:125110/1‑152 (MQ=255) gAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCAc < 1:509339/186‑1 (MQ=255) catcatTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGc < 1:320664/251‑1 (MQ=255) cAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAAct > 1:330672/1‑249 (MQ=255) tttATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAAc < 1:697985/251‑1 (MQ=255) ttCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTacccaacttaaagctc < 1:137326/251‑16 (MQ=255) cTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTacccaacttaaagc < 1:275169/234‑14 (MQ=255) atatTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGATAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTCATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTacccaacttaaagc > 1:34500/1‑217 (MQ=255) atatTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATaaa > 1:42710/1‑151 (MQ=255) atatTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcga > 1:22655‑M1/1‑201 (MQ=255) gTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGcttgccttgccttgccttgcct < 1:79286/78‑1 (MQ=255) gTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaa > 1:170108‑M1/1‑196 (MQ=255) gTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTacccaacttaaagctcttttcc < 1:734897/233‑22 (MQ=255) cAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaa > 1:511262‑M1/1‑188 (MQ=255) gTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTAcc > 1:71705/1‑193 (MQ=255) acTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttatt < 1:843693‑M1/251‑72 (MQ=255) gTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTT‑AAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaattttta < 1:636407‑M1/243‑70 (MQ=255) accagtaataggagtaaaaaatatgcttgccttgccttgccttgccttgcctaaactaaacgttaattgcaagcaaaATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaatc < 1:441213‑M1/226‑87 (MQ=255) accagtaataggagtaaaaaatatgcttgccttgccttgccttgccttgcctaaactaaacgttaattgcaagcaaaATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaat > 1:542898‑M1/26‑165 (MQ=255) ccagtaataggagtaaaaaatatgcttgccttgccttgccttgccttgcctaaactaaacgttaattgcaagcaaAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaat > 1:469339‑M1/25‑164 (MQ=255) aaaatatgcttgccttgccttgccttgccttgcctaaactaaaCGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaatctgaaattgcagaac < 1:870213‑M1/240‑101 (MQ=255) aatatgcttgccttgccttgccttgccttgcctaaactaAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaatctgaaattgcagaacaagcc < 1:305433‑M1/245‑106 (MQ=255) | TTCACCGTGGAAGAATTTTTAGACATTCTGAAAAAACAAGTGAGAAATCGCGAATTGAAATTATTGGGTGAGGCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGC > 1/1009075‑1009568 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |