| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 163,530 | Δ19 bp | intergenic (‑28079/+50149) | unknown ← / ← unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 163530 | 163548 | 19 | 85 [0] | [0] 85 | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 163529 | 0 (0.000) | 85 (0.960) | 59/430 | 0.3 | 100% | intergenic (‑28078/+50168) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| ? | 1 | 163549 = | 0 (0.000) | intergenic (‑28098/+50148) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG | |||||
CCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAACTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTGTTGTAATCGCTTCAATGGCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAATCGTATGAATTTTTGTCGCTAACTCTGGCGATTGTAGATTAGAGCATTTTTTCAATGGCAAAATACCTTGAAATTGGAAGAGTAATTTTTGAAAATCCTTATCTAATTTCCATGTTGGCAACTCTGCTACATCAAAACGACTGGCGTGTTGCGGATCGGTGTGTAAAACACGAATT > 1/163293‑163772 | cccTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCATAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaat > 1:444956‑M1/1‑237 (MQ=255) tctatctaAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaa < 1:646505‑M1/251‑18 (MQ=255) ctatctaAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaac < 1:629132‑M1/251‑19 (MQ=255) aTCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtaca > 1:341208‑M1/1‑225 (MQ=255) tCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaata < 1:510887‑M1/239‑16 (MQ=255) tatatCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattc > 1:611268‑M1/1‑221 (MQ=255) tatatCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaac < 1:697876‑M1/239‑19 (MQ=255) atCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacat < 1:9578‑M1/245‑28 (MQ=255) gTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaac > 1:339304‑M1/1‑211 (MQ=255) actgatcccAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctga > 1:267585‑M1/5‑205 (MQ=255) aCTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctga > 1:73096‑M1/1‑205 (MQ=255) tATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaat < 1:366088‑M1/251‑50 (MQ=255) aTAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccc > 1:697901‑M1/1‑195 (MQ=255) cAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaata < 1:26933‑M1/202‑16 (MQ=255) aTGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgtacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaa > 1:250189‑M1/1‑181 (MQ=255) gTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatc > 1:599331‑M1/1‑179 (MQ=255) gCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcga > 1:380631‑M1/1‑172 (MQ=255) gCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaat > 1:341739‑M1/1‑172 (MQ=255) gTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtac < 1:275427‑M1/192‑26 (MQ=255) gTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaac < 1:228946‑M1/185‑19 (MQ=255) cacaATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagatt < 1:494114‑M1/251‑89 (MQ=255) aaTCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattaga > 1:652063‑M1/1‑160 (MQ=255) aTCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagag > 1:23627‑M1/1‑159 (MQ=255) aTCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagag > 1:399383‑M1/1‑159 (MQ=255) aTCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagatt < 1:254352‑M1/247‑89 (MQ=255) aTCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaat < 1:68134‑M1/208‑50 (MQ=255) aTCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccc > 1:700745‑M1/1‑159 (MQ=255) aTCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaata > 1:857901‑M1/1‑159 (MQ=255) gcggcACGAATGAGCCACGAGCTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcatttt < 1:417583‑M1/250‑99 (MQ=255) gagctgaTGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTCCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaac < 1:387289‑M1/149‑19 (MQ=255) gATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaat > 1:529718‑M1/1‑129 (MQ=255) cTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaac < 1:5132‑M1/143‑19 (MQ=255) cATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcg < 1:582835‑M1/199‑79 (MQ=255) gTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagatt > 1:875532‑M1/1‑114 (MQ=255) gtgtTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaatac > 1:788489‑M1/1‑106 (MQ=255) gtgtTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagc < 1:649257‑M1/199‑94 (MQ=255) tgtTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatcc < 1:730106‑M1/251‑147 (MQ=255) tGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccat > 1:672950‑M1/1‑90 (MQ=255) ccGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaac < 1:574923‑M1/251‑171 (MQ=255) ccGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaac < 1:378158‑M1/251‑171 (MQ=255) tttttCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgcta < 1:471707‑M1/251‑178 (MQ=255) ttttCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctac < 1:421050‑M1/251‑179 (MQ=255) ttCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacat < 1:103995‑M1/251‑181 (MQ=255) gCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaac > 1:160811‑M1/1‑64 (MQ=255) ccTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacga > 1:372550‑M1/1‑62 (MQ=255) gCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaa > 1:389818‑M1/1‑59 (MQ=255) gCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattcc < 1:599779‑M1/89‑31 (MQ=255) ggttgTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacgactggcgtgt > 1:832400‑M1/1‑54 (MQ=255) ggttgTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacgactggcgtgt > 1:344866‑M1/1‑54 (MQ=255) ggttgTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagatt > 1:198911‑M1/1‑54 (MQ=255) ggttgTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCT‑ATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacgactggcgtgtt > 1:484542‑M1/1‑53 (MQ=255) gTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacgactggcgtgttgc > 1:527002‑M1/1‑50 (MQ=255) cccATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacgactggcgtgttgcggat < 1:665958‑M1/251‑205 (MQ=255) cccATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaat > 1:246040‑M1/1‑47 (MQ=255) cATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaa > 1:664688‑M1/1‑45 (MQ=255) gAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaat < 1:47860‑M1/154‑113 (MQ=255) gAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcac > 1:164849‑M1/1‑42 (MQ=255) cGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacgactggcgtgttgcggatcggtgtgtaaaacac < 1:867761‑M1/251‑220 (MQ=255) cGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacgactggcgtgttgcggatcggtgtgtaaaaca > 1:340202‑M1/1‑32 (MQ=255) cGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacgactggcgtgttgcggatcggtgtgtaaaaca > 1:680552‑M1/1‑32 (MQ=255) ataataTCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcgcgcggttaataaacgatgtacattccctaaagtccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagatt < 1:222696‑M1/117‑88 (MQ=255) ataataTCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacgactggcgtgttgcggatcggtgtgtaaaacacga > 1:337099‑M1/1‑30 (MQ=255) ataataTCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacgactggcgtgttgcggatcggtgtgtaaaacacga > 1:685772‑M1/1‑30 (MQ=255) ataataTCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactc < 1:371121‑M1/202‑173 (MQ=255) ataataTCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatc < 1:190725‑M1/181‑152 (MQ=255) ataataTCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattc < 1:684040‑M1/59‑30 (MQ=255) tatCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacgactggcgtgttgcggatcggtgtgtaaaacacgaattg > 1:714710‑M1/1‑26 (MQ=255) tatCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatct < 1:364210‑M1/178‑153 (MQ=255) tatCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaat > 1:74035‑M1/1‑26 (MQ=255) tatCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttc < 1:621650‑M1/127‑102 (MQ=255) atCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacgactggcgtgttgcggatcggtgtgtaaaacacgaattg > 1:96220‑M1/1‑25 (MQ=255) cTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacgactggcgtgttgcggatcggtgtgtaaa < 1:884160‑M1/238‑216 (MQ=255) cTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatcc > 1:838448‑M1/1‑23 (MQ=255) aaTGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacgactggcgtgttgcggatcggtgtgtaaaacacgaattgcat > 1:666226‑M1/1‑21 (MQ=255) aaTGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaag < 1:846456‑M1/149‑129 (MQ=255) aaTGTAATTTGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagatt > 1:378683‑M1/1‑21 (MQ=255) tttGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacgactggcgtgttgcggatcggtgtgtaaaacacgaattgcatcttttgtgc < 1:331775‑M1/251‑238 (MQ=255) ttGCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacgactggcgtgttgcggatcggtgtgtaaaacacgaattgcatcttttgtgcc < 1:749702‑M1/251‑239 (MQ=255) gCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacgactggcgtgttgcggatcggtgtgtaaaacacgaattgcatcttttgtgccta > 1:258340‑M1/1‑11 (MQ=255) gCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacgactggcgtgttgcggatcggtgtgtaaa < 1:786348‑M1/226‑216 (MQ=255) gCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgcta < 1:641978‑M1/188‑178 (MQ=255) gCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggca > 1:400987‑M1/1‑11 (MQ=255) gCTCTGTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaat > 1:218673‑M1/1‑11 (MQ=255) gTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagcattttttcaatggcaaaataccttgaaattggaagagtaatttttgaaaatccttatctaatttccatgttggcaactctgctacatcaaaacgactggcgtgttgcggatcggtgtgtaaaacacgaattgcatcttttgtgcctacgc > 1:742453‑M1/1‑6 (MQ=255) gTTCCTcgcacgcggttaataaacgatgtacattccctaaattaccccctgaaatcgtatgaatttttgtcgctaactctggcgattgtagattagagc < 1:417850‑M1/99‑94 (MQ=255) | CCCTCTATCTAAATCATATATCCATAGTCGCCACTTATCCCAATAAAATCCAGTAAATGTAATCGGCTCTGTACCACAATCTAAGGCGGCACGAATGAGCCACGAACTGATGCTTTCATTGAGGTAAAGCGGTGTTCGAATAATCCTTGATTTTATCCGATAATTTTTCGTAAGCCCTGCGTTGGTTGTACCCATGAATTATGCTCGATAATATCTAATGTAATTTGCTCTGTTCCTGTTGTAATCGCTTCAATGGCGCACGCGGTTAATAAACGATGTACATTCCCTAAATTACCCCCTGAAATCGTATGAATTTTTGTCGCTAACTCTGGCGATTGTAGATTAGAGCATTTTTTCAATGGCAAAATACCTTGAAATTGGAAGAGTAATTTTTGAAAATCCTTATCTAATTTCCATGTTGGCAACTCTGCTACATCAAAACGACTGGCGTGTTGCGGATCGGTGTGTAAAACACGAATT > 1/163293‑163772 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |