| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 1,311,549 | Δ20 bp | intergenic (+121/‑175) | unknown → / → unknown | Translation initiation factor 2/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1311569 = | 3 (0.030) | 50 (0.660) | 35/372 | 0.9 | 94.7% | intergenic (+141/‑174) | unknown/unknown | Translation initiation factor 2/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| ? | 1 | = 1311548 | 3 (0.040) | intergenic (+120/‑195) | unknown/unknown | Translation initiation factor 2/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) | |||||
CGTTTCCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAA > 1/1311311‑1311763 | cgTTTCCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATgcctcacctcacc > 1:727411‑M2/1‑238 (MQ=255) tttCCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATgcctcacctcacctc > 1:843020‑M2/1‑236 (MQ=255) tttCCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATgcctcacctcacct < 1:404297‑M2/250‑15 (MQ=255) ccGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATgcctcacctcacctcacc > 1:683588‑M2/1‑233 (MQ=255) tAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATgcctcacctcacctcacctcacctcacc > 1:609530‑M2/1‑223 (MQ=255) aTGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATgcctcacctcacctcacctcacctcaccttgcaca < 1:89664‑M2/251‑36 (MQ=255) aaTGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATgcctcacctcacctcacctcacctcaccttgcacaactt > 1:35105‑M2/1‑212 (MQ=255) 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1:168112/248‑1 (MQ=255) aTTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATgcctcacctcacctcacctcacctcaccttgcacaacttatatctaaactcaaggaaatttttcaaattaatcaaccggagctggatttcggtatttatcgcattttaaattccagcgctgcggaaattgccacctttcttgaaaccacacttc < 1:609141‑M2/249‑155 (MQ=255) ttCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATgcctcacctcacctcacctcacctcaccttgcacaacttatatctaaactcaaggaaatttttcaaattaatcaaccggagctggatttcggtatttatcgcattttaaattcccgcgctgcggaaattgccacctttcttgaaaccacacttcct < 1:807307‑M2/250‑157 (MQ=255) gtgtTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATgcctcacctcacctcacctcacctcaccttgcacaacttatatctaaactcaaggaaatttttcaaattaatcaaccggagctggatttcggtatttatcgcattttaaattcccgcgctgcggaaattgccacctttcttgaaaccacacttcctcaaaaaa < 1:771092‑M2/251‑164 (MQ=255) 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1:853270‑M2/251‑178 (MQ=255) ctTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATgcctcacctcacctcacctcacctcaccttgcacaacttatatctaaactcaaggaaatttttcaaattaatcaaccggagctggatttcggtatttatcgcattttaaattcccgcgctgcggaaattgccacctttcttgaaaccacacttcctcaaaaaattcaaactgcattg < 1:539867‑M2/251‑178 (MQ=255) ctTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATgcctcacctcacctcacctcacctcaccttgcacaacttatatctaaactcaaggaaatttttcaaattaatcaaccggagctggatttcggtatttatcgcattttaaattcccgcgctgcggaaattgccacctttcttgaaac < 1:879323‑M2/220‑147 (MQ=255) ctTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATgcctcacctcacctcacctcacctcaccttgcacaacttatatctaaactcaaggaaatttttcaaattaatcaaccggagctggatttcggtatttatcgcattttaaattcccgcgctgcggaaattgccacctttcttg > 1:731812‑M2/1‑74 (MQ=255) ctTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATgcctcacctcacc < 1:245444‑M2/87‑14 (MQ=255) 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tAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATgcctcacctcacctcacctcacctcaccttgcacaacttatatctaaactcaaggaaatttttcaaattaatcaaccggagctggatttcggtatttatcgcattttaaattcccgcgctgcggaaattgccacctttcttgaaaccacacttcctcaaaaaattcaaactgcattgg < 1:819158‑M2/214‑179 (MQ=255) aaaTATgcctcacctcacctcacctcacctcaccttgcacaacttatatctaaactcaaggaaatttttcaaattaatcaaccggagctggatttcggtatttatc < 1:551014‑M2/106‑101 (MQ=255) | CGTTTCCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAA > 1/1311311‑1311763 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |