| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 1,311,549 | Δ20 bp | intergenic (+121/‑175) | unknown → / → unknown | Translation initiation factor 2/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1311569 = | 3 (0.030) | 50 (0.660) | 35/372 | 0.9 | 94.7% | intergenic (+141/‑174) | unknown/unknown | Translation initiation factor 2/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| ? | 1 | = 1311548 | 3 (0.040) | intergenic (+120/‑195) | unknown/unknown | Translation initiation factor 2/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) | |||||
GCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAAGAAACGGCAGTTTATAACCA > 1/1311331‑1311783 | cgtttccgaagtgcgtaacggcatggaatgcggtatcggcgtgaagaactacaacgatgtgaaagtcggcgaccagattgaagtgtttgaagtggttgaggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatgcctcacctcacc > 1:727411‑M1/239‑251 (MQ=255) tttccgaagtgcgtaacggcatggaatgcggtatcggcgtgaagaactacaacgatgtgaaagtcggcgaccagattgaagtgtttgaagtggttgaggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatgcctcacctcacctc > 1:843020‑M1/237‑251 (MQ=255) tttccgaagtgcgtaacggcatggaatgcggtatcggcgtgaagaactacaacgatgtgaaagtcggcgaccagattgaagtgtttgaagtggttgaggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatgcctcacctcacct < 1:404297‑M1/14‑1 (MQ=255) ccgaagtgcgtaacggcatggaatgcggtatcggcgtgaagaactacaacgatgtgaaagtcggcgaccagattgaagtgtttgaagtggttgaggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatgcctcacctcacctcacc > 1:683588‑M1/234‑251 (MQ=255) taacggcatggaatgcggtatcggcgtgaagaactacaacgatgtgaaagtcggcgaccagattgaagtgtttgaagtggttgaggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCtcacctcacctcacctcacctcacc > 1:609530‑M1/224‑251 (MQ=255) atggaatgcggtatcggcgtgaagaactacaacgatgtgaaagtcggcgaccagattgaagtgtttgaagtggttgaggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGcaca < 1:89664‑M1/35‑1 (MQ=255) aatgcggtatcggcgtgaagaactacaacgatgtgaaagtcggcgaccagattgaagtgtttgaagtggttgaggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACtt > 1:35105‑M1/213‑251 (MQ=255) gtatcggcgtgaagaactacaacgatgtgaaagtcggcgaccagattgaagtgtttgaagtggttgaggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATc > 1:807807‑M1/207‑250 (MQ=255) ggcgtgaagaactacaacgatgtgaaagtcggcgaccagattgaagtgtttgaagtggttgaggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagcaagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTaaa < 1:231221‑M1/48‑1 (MQ=255) gaactacaacgatgtgaaagtcggcgaccagattgaagtgtttgaagtggttgaggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatgcctcacctcacctcacctcaccc > 1:535297‑M1/194‑216 (MQ=255) gaactacaacgatgtgaaagtcggcgaccagattgaagtgtttgaagtggttgaggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATc > 1:710765‑M1/194‑237 (MQ=255) gaactacaacgatgtgaaagtcggcgaccagattgaagtgtttgaagtggttgaggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATc < 1:587940‑M1/44‑1 (MQ=255) gaactacaacgatgtgaaagtcggcgaccagattgaagtgtttgaagtggttgaggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGaaa < 1:130656‑M1/58‑1 (MQ=255) atgtgaaagtcggcgaccagattgaagtgtttgaagtggttgaggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAAtt < 1:859513‑M1/69‑1 (MQ=255) gtttgaagtggttgaggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCt > 1:32040‑M1/155‑237 (MQ=255) gtttgaagtggttgaggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTAttt < 1:875120‑M1/97‑1 (MQ=255) ggttgaggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAAc > 1:736816‑M1/146‑194 (MQ=255) ggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGcac > 1:91543‑M1/140‑173 (MQ=255) ggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATc > 1:536776‑M1/140‑183 (MQ=255) atctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGa < 1:538587‑M1/125‑1 (MQ=255) atttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTg < 1:763017‑M1/130‑1 (MQ=255) aaTTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAAcc < 1:168112/248‑1 (MQ=255) tctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGTCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACt < 1:727791‑M1/50‑1 (MQ=255) ctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCttt < 1:179948‑M1/138‑1 (MQ=255) ctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCttt < 1:747586‑M1/138‑1 (MQ=255) gtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACcaca < 1:30176‑M1/150‑1 (MQ=255) aaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAAc > 1:77289‑M1/98‑134 (MQ=255) attcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCAGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTc < 1:609141‑M1/154‑1 (MQ=255) ttcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCt < 1:807307‑M1/156‑1 (MQ=255) gtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCaaaaaa < 1:428945‑M1/163‑1 (MQ=255) gtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCaaaaaa < 1:771092‑M1/163‑1 (MQ=255) ggATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCgg < 1:444728/161‑1 (MQ=255) ctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatgcctcacctc > 1:412399‑M1/77‑86 (MQ=255) ctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTg > 1:676117‑M1/77‑218 (MQ=255) ctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTc < 1:177956‑M1/157‑1 (MQ=255) ctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCAt < 1:185266‑M1/175‑1 (MQ=255) ctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCAt < 1:407747‑M1/175‑1 (MQ=255) acacCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAATCTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAAcc < 1:703858/208‑1 (MQ=255) cttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatgcctcacctcacc < 1:245444‑M1/13‑1 (MQ=255) cttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTg > 1:731812‑M1/75‑216 (MQ=255) cttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAAc < 1:879323‑M1/146‑1 (MQ=255) cttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTg < 1:539867‑M1/177‑1 (MQ=255) cttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTg < 1:853270‑M1/177‑1 (MQ=255) tttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCg < 1:901022‑M1/180‑1 (MQ=255) taggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCaa > 1:384785‑M1/67‑251 (MQ=255) ggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatgcctcacc > 1:791256‑M1/65‑72 (MQ=255) ggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATc > 1:666086‑M1/65‑108 (MQ=255) ggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAAc < 1:630726‑M1/146‑1 (MQ=255) gatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAAc > 1:501317‑M1/64‑209 (MQ=255) atataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGc > 1:224448‑M1/63‑250 (MQ=255) atataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCT‑‑‑‑‑TGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCa < 1:37320‑M1/189‑1 (MQ=255) acaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCg < 1:677901‑M1/101‑1 (MQ=255) caccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAAg < 1:827069‑M1/196‑1 (MQ=255) ccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTg > 1:394836‑M1/54‑195 (MQ=255) ccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGc > 1:535609‑M1/54‑241 (MQ=255) tattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCaa < 1:816780‑M1/195‑1 (MQ=255) aaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAAGAAACGGCAGTTtata < 1:325205‑M1/211‑1 (MQ=255) gtaacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATc > 1:487536‑M1/38‑81 (MQ=255) taacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTgg < 1:819158‑M1/178‑1 (MQ=255) taacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAAGAAACGGCAGTTTATAACCa > 1:44234‑M1/37‑251 (MQ=255) taacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAAGAAACGGCAGTTTATAACCa < 1:574036‑M1/215‑1 (MQ=255) aaatatGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATc < 1:551014‑M1/100‑1 (MQ=255) | GCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAAGAAACGGCAGTTTATAACCA > 1/1311331‑1311783 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |