| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 1,311,549 | Δ20 bp | intergenic (+121/‑175) | unknown → / → unknown | Translation initiation factor 2/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1311569 = | 3 (0.030) | 50 (0.660) | 35/372 | 0.9 | 94.7% | intergenic (+141/‑174) | unknown/unknown | Translation initiation factor 2/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| ? | 1 | = 1311548 | 3 (0.040) | intergenic (+120/‑195) | unknown/unknown | Translation initiation factor 2/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) | |||||
AATCGCCGTTGTCGTAATAGCGGGAAAAGAAAGTGAAAAGATGGTTATAAACTGCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 1/1311824‑1311569‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aggtgaggtgaggtgaggtgaggtgaggtATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATTCCATGCCGTTACGCACTTCGGAAACG < 1/1311548‑1311311 AATCGCCGTTGTCGTAATAGCGGGAAAAGAAAGTGAAAAGATGGTTATAAACTGCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGA < 1:653935/238‑1 CGTTGTCGTAATAGCGGGAAAAGAAAGTGAAAAGATGGTTATAAACTGCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGca < 1:132164/251‑3 TTGTCGTAATAGCGGGAAAAGAAAGTGAAAAGATGGTTATAAACTGCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGcat < 1:286817/250‑4 GTCGTAATAGCGGGAAAAGAAAGTGAAAAGATGGTTATAAACTGCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTG < 1:868067/222‑1 GGAAAAGAAAGTGAAAAGATGGTTATAATCTGCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGT > 1:240079/1‑209 TGGTTATAAACTGCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTA > 1:44234/1‑251 TGGTTATAAACTGCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTA < 1:574036/251‑1 TATAAACTGCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTT < 1:325205/251‑1 CTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTG < 1:827069/251‑1 TTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATA < 1:816780/245‑1 TGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCA‑‑‑‑‑AGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATAT < 1:37320/251‑1 GCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATAT > 1:224448/1‑250 GCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGG > 1:535609/1‑241 TTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTA > 1:384785/1‑251 CGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATA‑TTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAA < 1:901022/251‑1 CCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTA < 1:819158/214‑1 CAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAG < 1:539867/251‑1 CAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAG < 1:853270/251‑1 ATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAG < 1:185266/251‑1 ATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAG < 1:407747/251‑1 TTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACAC < 1:771092/251‑1 TTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACAC < 1:428945/251‑1 GAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAG < 1:177956/233‑1 AGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAA < 1:807307/250‑1 GAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCTGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAAT < 1:609141/249‑1 TGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGAC < 1:30176/251‑1 GGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTG > 1:731679/1‑143 GTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAG < 1:879323/220‑1 GTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCC < 1:630726/210‑1 GTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATC > 1:501317/1‑209 CAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAG > 1:676117/1‑218 CAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAG > 1:731812/1‑216 CAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGG > 1:394836/1‑195 AAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAG < 1:747586/250‑1 AAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAG < 1:179948/250‑1 CAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAAT < 1:763017/251‑1 TCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGAT < 1:538587/251‑1 CGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGT < 1:677901/157‑1 CGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAA > 1:438746/1‑73 GATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTT < 1:551014/106‑1 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GATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACC > 1:536776/1‑183 GATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCC > 1:666086/1‑108 AAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATT > 1:35105/1‑251 GTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTT > 1:77289/1‑134 TGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATTCCAT < 1:89664/251‑1 GTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACC > 1:91543/1‑173 GGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATTCCATGCCGTTA > 1:609530/1‑251 gGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTC > 1:535297/2‑217 GGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATTCCATGCCGTTACGCACTTCGG > 1:683588/1‑251 GAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATTCCATGCCGTTACGCACTTCGGAAA > 1:843020/1‑251 AGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATTCCATGCCGTTACGCACTTCGGAAA < 1:404297/250‑1 GGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATTCCATGCCGTTACGCACTTCGGAAACG > 1:727411/1‑251 GGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAG < 1:245444/87‑1 GAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAG > 1:412399/1‑86 GGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCC > 1:791256/1‑72 AATCGCCGTTGTCGTAATAGCGGGAAAAGAAAGTGAAAAGATGGTTATAAACTGCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTGAGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 1/1311824‑1311569‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aggtgaggtgaggtgaggtgaggtgaggtATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATTCCATGCCGTTACGCACTTCGGAAACG < 1/1311548‑1311311 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |