| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 258496 | 77 (0.870) | 98 (1.130) | 65/424 | 0.1 | 72.1% | intergenic (+205/+5) | unknown/unknown | DNA‑directed RNA polymerase beta' subunit (EC 2.7.7.6)/Transposase, IS200 family |
| ? | 1 | 439414 = | 0 (0.000) | coding (118/141 nt) | unknown | Transposase, IS200 family | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
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> 1:6359‑M2/169‑251 (MQ=255) tttaggctactctataaggacctagtacttcacatgcccttcaaagggcatatgaaaaccaacaaccgtgaaataactctatgacctaccccttaaaggggtccacatatcctttcttcgataaattatcctgaatcatgtcttccttttcctgattccttatatCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGAt < 1:798605‑M2/86‑1 (MQ=255) actctataaggacctagtacttcacatgcccttcaaagggcatatgaaaaccaacaaccgtgaaataactctatgacctaccccttaaaggggtccacatatcctttcttcgataaattatcctgaatcatgtcttccttttcctgattccttatatCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTAt < 1:141328‑M2/81‑1 (MQ=255) actctataaggacctagtacttcacatgcccttcaaagggcatatgaaaaccaacaaccgtgaaataactctatgacctaccccttaaaggggtccacatatcctttcttcgataaattatcctgaatcatgtcttccttttcctgattccttatatCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGAt < 1:509256‑M2/86‑1 (MQ=255) 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1:515993‑M2/90‑251 (MQ=255) ctatgacctaccccttaaaggggtccacatatcctttcttcgataaattatcctgaatcatgtcttccttttcctgattccttatatCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTAtt > 1:815937‑M2/88‑249 (MQ=255) acctaccccttaaaggggtccacatatcctttcttcgataaattatcctgaatcatgtcttccttttcctgattccttatatCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTtatat < 1:662424‑M2/169‑1 (MQ=255) acctaccccttaaaggggtccacatatcctttcttcgataaattatcctgaatcatgtcttccttttcctgattccttatatCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTtatat < 1:695904‑M2/169‑1 (MQ=255) 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1:590962‑M2/76‑248 (MQ=255) cttaaaggggtccacatatcctttcttcgataaattatcctgaatcatgtcttccttttcctgattccttatatCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGAt > 1:571343‑M2/75‑160 (MQ=255) ggggtccacatatcctttcttcgataaattatcctgaatcatgtcttccttttcctgattccttatatCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTatat < 1:160270‑M2/136‑1 (MQ=255) ggtccacatatcctttcttcgataaattatcctgaatcatgtcttccttttcctgattccttatatCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTtatat < 1:507589‑M2/169‑1 (MQ=255) ggtccacatatcctttcttcgataaattatcctgaatcatgtcttccttttcctgattccttatatCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGGGGATTTTTTAt > 1:389451‑M2/67‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |