| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ? | 1 | 439414 = | 0 (0.000) | coding (118/141 nt) | unknown | Transposase, IS200 family | |||||
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
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ttatctttaagaaacgttaaatcgtgatccagcacacaaaattcaaaaacCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTtcctgattccttatatccgttctaagc > 1:586061‑M1/51‑240 (MQ=255) tGGTAGAAGAAGACAATCACGCGGAATAAGATTCCTGTAAATAACAATCCGCACGTAAAACGTGCAGTTTTTAGGCTATTCTATAAAGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATTCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATACTCCTACACTAcc < 1:429235/248‑1 (MQ=255) aagaCAATCACGCGGAATAAGATTCCTGTAAATAACAATCCGCACGTAAAACGTGCAGTTTTTAGGCTACTCTATAAAGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATTCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATACTCCTACACTACCTTTGTATTTAGc < 1:73772/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |