| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 90793 | 160 (1.810) | 52 (0.730) +GCTACATATTCAGTTCTCCGGGCTTCATTTTGAGCTTTGTT |
22/348 | 1.8 | 29.3% | coding (336/690 nt) | unknown | hypothetical protein |
| ? | 1 | 90835 = | 150 (1.700) | coding (294/690 nt) | unknown | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
CGCACGTGGGTATTTAGCACTAAGCTCGTCAATGTCTGATTTTAGTGGGCGTGGCATATTGACGCCGTCGTTATATTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGGTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCGATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCAAAGGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGTTCTTCTTTCATTTGTTAAGTTTACTGCATTCTTGATGATATCTTTGCCGCTTACTATTGTCATCAGAGTTGCATTGACGGGACCCACGCCTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGAT > 1/90598‑91080 | ggTATTTAGCACTAAGCTCGTCAATGTCTGATTTTGGTGGGCGTGGCATATTGACGCCGTCGTTATATTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCaa > 1:686041/1‑251 (MQ=255) gTATTTAGCACTAAGCTCGTCAATGTCTGATTTTGGTGGGCGTGGCATATTGACGCCGTCGTTATATTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCaa > 1:101287/1‑250 (MQ=255) aaGCTCGTCAATGTCTGATTTTGGTGGGCGTGGCATATTGACGCGGTCGTTATATTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAg < 1:319616/230‑1 (MQ=255) tCGTCAATGTCTGATTTTGGTGGGCGTGGCATATTGACGCCGTCGTTATATTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAAt < 1:271316/251‑1 (MQ=255) tCGTCAATGTCTGATTTTGGTGGGCGTGGCATATTGACGCCGTCGTTATATTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAAt < 1:254694/251‑1 (MQ=255) tttggTGGGCGTGGCATATTGACGCTGTCGTTAAATTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCGATCCCTTTAAc < 1:293076/247‑1 (MQ=255) tttggTGGGCGTGGCATATTGACGCCGTCGTTATATTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCGATCCCTTTAAc < 1:232818/247‑1 (MQ=255) tttggTGGGCGTGGCATATTGACGCCGTCGTTATATTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCGATCCCTTTAAc < 1:187793/247‑1 (MQ=255) tGGGCGTGGCATATTGACGCCGTCGTTATATTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCGATCCCTTTAACTGgag < 1:739647/251‑1 (MQ=255) gCGTGGCATATTGACGCCGTCGTTATATTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCGATCCCTTTAACTGGAGAgg > 1:615557/1‑251 (MQ=255) tatTGACGCCGTCGTTATATTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCGATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCa > 1:344881/1‑251 (MQ=255) aCGCCGTCGTTATATTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCGATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCAAAgg < 1:470217/250‑1 (MQ=255) gtcgtTATATTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCGATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTc < 1:229163/240‑1 (MQ=255) 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tataTTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCTTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCGATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCAAAGGCATCATAATAc < 1:454051/251‑1 (MQ=255) tataTTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCGATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCAAAGGCATCATAATAc < 1:804333/251‑1 (MQ=255) tataTTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCGATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCAAAGGCATCATAATAc < 1:274446/251‑1 (MQ=255) tatTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCGATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCAAAGGCATCATAATACTc < 1:901298/251‑1 (MQ=255) gCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCGATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCAAAGGCATCATAATACTCGTCtttttt > 1:378587/1‑251 (MQ=255) aaGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCGATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCAAAGGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGttcttc < 1:596135/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |