| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | 1 | 90835 = | 150 (1.700) | coding (294/690 nt) | unknown | hypothetical protein | |||||
TCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGGTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/90701‑90793‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCGATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCAAAGGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGTTCTTCTTTCATTTGTTAAGTTTACTGCATTCTTGATGATATCTTTGCCGCTTACTATTGTCATCAGAGTTGCATTGACGGGACCCACGCCTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGAT > 1/90835‑91080 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 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TACATATTCAGTTCTCCGGGCTTCATTTTGAGCTTTGTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGATCTTCTTTCGTCTGTTAAGTTT < 1:125780/166‑1 ACATATTCAGTTCTCCGGGCTTCATTTTGAGCTTTGTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGATCTTCTTTCGTCTGTTAAGTTTACCGCATTCTTAATGATATCTTTGCCGCTTACTATTGTCATCACAGTTGCATTGACGGAACCCACGCCTTCAATATGTGCACCGC > 1:850207/1‑250 ACATATTCAGTTCTCCGGGCTTCATTTTGAGCTTTGTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGATCTTCTTTCGTCTGTTAAGTTTACCGCATTCTTAATGAT < 1:215145/182‑1 ATATTCAGTTCTCCGGGCTTCATTTTGAGCTTTGTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGATCTTCTTTCGTCTGTTAAGTTTACCGCATTCTTAATGATATCTTTGCCGCTTACTAT > 1:330825/1‑198 ATATTCAGTTCTCCGGGCTTCATTTTGAGCTTTGTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAATAC < 1:194100/121‑1 ATTCAGTTCTCCGGGCTTCATTTTGAGCTTTGTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGATCTTCTTTCGTCTGTTAAGTTTACCGCATTCTTAATGATATCTTTGCCGCTTACTATTGTCATCACAGTTGCATTGACGGAACCCACGCCTTCAATA > 1:567674/1‑236 ATTCAGTTCTCCGGGCTTCATTTTGAGCTTTGTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGATCTTCTTTCGTCTGTTAAGTTT < 1:62767/161‑1 GTTCTCCGGGCTTCATTTTGAGCTTTGTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGATCTTCTTTCGTCTGTTAAGTTTACCGCATTCTTAATGATATCTTTGCCGCTTACTATTGTCATCACAGTTGCATTGACGGAACCCACGCCTTCAATATGTGCACCGCCGATACCCAA > 1:699928/1‑251 TTCTCCGGGCTTCATTTTGAGCTTTGTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGATCTTCTTTCGTCTGTTAAGTTTACCGCATTCTTAATGATATCTTTGCCGCTTACTATTGTCATCACAGTTGCATTGACGGACCCCACGCCTTCAATATGTGCACCGCCGATACCC < 1:762314/248‑1 GGCTTCATTTTGAGCTTTGTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGATCTTCTTTCGTCTGTTAAGTTTACCGCATTCTTAATG < 1:138585/163‑1 GCTTCATTTTGAGCTTTGTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAAC < 1:668327/74‑1 ATTTTGAGCTTTGTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGATCTTCTTTCGTCTGTTAAGTTTACCGCATTCTTAATGATATCTTTGCCGC > 1:607271/1‑170 ATTTTGAGCTTTGTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGATCTTCTTT < 1:397969/128‑1 GCTTTGTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAA > 1:445116/1‑90 TTGTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGATCTTCTTTCGTCTGTTAAGTTTACcgc < 1:139893/137‑4 TTGTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGATCTTCTTTCGTCTGTTAAGTTTACCGCATTCTTGATGATATCTTTGCCGCTTACTATTGTCATCACAGTTGCATTGACGGAACCCACGCCTTCAATATGTGCACCGCCGATACCCAAGCCGCCTTAGCTCTCAAAAATGAT > 1:539207/1‑251 TTGTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGATCTTCTTTCGTCTGTTAAGTTTACCGCATTCTTAATGATATCTTTGCCGCTTACTATTGTCATCACAGTTGCATTGACGGAACCCACGCCTTCAATATGTGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTAGCTCTCAAAAAT < 1:431432/248‑1 TTGTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGATCTTCTTTCGTCTGTTAAGTTTACCGCATTCTTAATGATATCTTTGCCGCTTACTATTGTCATCACAGTTGCATTGACGGAACCCACGCCTTCAATATG < 1:20112/209‑1 TTGTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGATCTTCTTTCGTCTGTTAAGTTTACCGCATTCTTAATGATATCTTTGCCGCTTACTATTGTCA < 1:716925/172‑1 GTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGATCTTCTTTCGTCTGTTAAGTTTACCGCATTCTTAATGATATCTTTGCCGCTTACTATTGTCATCACAGTTG < 1:791128/179‑1 GTTAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCAATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCGAAAGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGATCTTCTTTCGTCTGTTAAGTTTACCGCATTCTTAATGATATCTTTGCCGCTTACTATTGTCATC < 1:789142/172‑1 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGGTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/90701‑90793‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCGATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCAAAGGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGTTCTTCTTTCATTTGTTAAGTTTACTGCATTCTTGATGATATCTTTGCCGCTTACTATTGTCATCAGAGTTGCATTGACGGGACCCACGCCTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGAT > 1/90835‑91080 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |