| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | 1 | 90835 = | 150 (1.700) | coding (294/690 nt) | unknown | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
CCGCGGTGCTATAACTATCCGCTTTAAGATACATTGCCGCACGTGGGTATTTAGCACTAAGCTCGTCAATGTCTGATTTTAGTGGGCGTGGCATATTGACGCCGTCGTTATATTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGGTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATGCCTCGTGTTCCGCTTTGCGAAATGCTCTTAAAGTTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCGATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCAAAGGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGTTCTTCTTTCATTTGTTAAGTTTACTGCATTCTTGATGATATCTTTGCCGCTTACTATTGTCATCAGAGTTGCATTGACGGGACCCACGCCTTCAATATGCGCA > 1/90561‑91042 | ccGCGGTGCTATAACTATCCGCTTTAAGATACATTGCCGCACGTGGGTATTTAGCACTAAGCTCGTCAATGTCTGATTTTGGTGGGCGTGGCATATTGACGCCGTCGTTATATTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTa > 1:887502/1‑251 (MQ=255) cgGTGCTATAACTATCCGCTTTAAGATACATTGCCGCACGTGGGTATTTAGCTCTAAGCTCGTCAATGTCTGATTTTGGTGGGCGTGGCATATTGACGCCGTCGTTATATTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAAt < 1:398538/251‑1 (MQ=255) cgGTGCTATAACTATCCGCTTTAAGATACATTGCCGCACGTGGGTATTTAGCACTAAGCTCGTCAATGTCTGATTTTGGTGGGCGTGGCATATTGACGCCGTCGTTATATTCGTCCGCCATTGCGCGATAAAGTTGCTCATGATAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTAATTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAAt < 1:133449/251‑1 (MQ=255) gTGCTATAACTATCCGCTTTAAGATACATTGCCGCCCGTGGGAATTTATCACTAAGCTCGTCAATGTCTGATTTTGGTGGGCGTGGCATATTGACGTCGTCGATATATTCGTCCGCCTTTGCGCGATAAAGTTGCTCTTGTTAATAATCAACTTCGCTGTATGCTTTTTGTATTTCTTTAATGCCTGGTTACTTAGCTTCTAATCTCGCTTCTTTAGCTTTTGCCAATTCTTTGGCGTTTGCTTTAAATg > 1:839864/1‑250 (MQ=255) 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1/90561‑91042 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |