| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP028101 | 865498 = | 158 (0.880) | 7 (0.040) | 4/422 | 3.6 | 4.1% | coding (128/1359 nt) | C7Y58_04280 | Trk system potassium transporter TrkA |
| ? | CP028101 | 865618 = | 178 (1.040) | coding (248/1359 nt) | C7Y58_04280 | Trk system potassium transporter TrkA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
ATGAAAATAGTAATTGTAGGAGCAGGTAAAGTTGGAGAGTTACTTTGCCGTGATTTATCATTAGAGGGAAATGATATAATTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGATTATTCATCTCAACTTAACTTTATGACAGAATCTTTAGGGATAGATTTAGTAATAAATCCAGAACTTGAAGCAGCAAAAGATATAAAACAAAATATAGATTTCCCAGAAGCATTAAATGTTGAAAATTTTTTAAATGGAAGATTGAAACTTGTAGAGTTTCATGTTGATGAAGATTCAATTTTAAATAATGT > CP028101/865371‑865867 | aTGAAAATAGTAATTGTAGGAGCAGGTAAAGTTGGAGAGTTACTTTGCCGTGATTTATCATTAGAGGGAAATGATATAATTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACTTGAAAAAATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGt < 2:605759/251‑1 (MQ=255) aaaaTAGTAATTGTAGGAGCAGGTAAAGTTGGAGAGTTACTTTGCCGTGATTTATCATTAGAGGGAAATGATATAATTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTta < 2:667626/250‑1 (MQ=255) tAGTAATTGTAGGAGCAGGTAAAGTTGGAGAGTTACTTTGCCGTGATTTATCATTAGAGGGAAATGATATAATTTTAATTGAATAAGATATAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCt < 2:547469/251‑1 (MQ=255) gTAGGAGCAGGTAAAGTTGGAGAGTTACTTTGCCGTGATTTATCATTAGAGGGAAATGATATAATTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAAtt > 2:245546/1‑251 (MQ=255) cAGGTAAAGTTGGAGAGTTACTTTGCCGTGATTTATCATTAGAGGGAAATGATATAATTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAgggg < 2:300743/249‑1 (MQ=255) ttGGAGAGTTACTTTGCCGTGATTTATCATTAGAGGGAAATGATATAATTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACGTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTacac < 2:581580/250‑1 (MQ=255) gagaGTTACTTTGCCGTGATTTATCATTAGAGGGAAATGATATAATTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTAt < 1:380585/250‑1 (MQ=255) ttACTTTGCCGTGATTTATCATTAGAGGGAAATGATATAATTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCa < 2:318410/250‑1 (MQ=255) gCCGTGATTTATCATTAGAGGGAAATGATATAATTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGa > 2:316864/1‑251 (MQ=255) cGTGATTTATCATTAGAGGGAAATGATATAATTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAg < 2:226870/251‑1 (MQ=255) cGTGATTTATCATTAGAGGGAAATGATATAATTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACTCGAAAAGATTCTAGCTTATAATGATATTATGGAGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAg < 1:698407/251‑1 (MQ=255) cATTAGAGGGAAATGATATAATTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGattat > 1:41397/1‑251 (MQ=255) agGGAAATGATATAATTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGATTATTCAtc < 2:283949/250‑1 (MQ=255) atatAATTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAg > 1:397258/1‑226 (MQ=255) atatAATTTTAAATGAACAAGATATAAATATACTTAGAAAGATTCTAGCTAATAATGAGATTATGGCGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATCTAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCACAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGATTAATCATCTCaacttaac < 2:866573/251‑1 (MQ=255) aaTTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGATTATTCATCTCAACTTAACTTTa > 2:780390/1‑251 (MQ=255) gAACAAGATATAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGATTATTCATCTCAACTTAACTTTATGACAGAAt > 1:36043/1‑250 (MQ=255) tgATATAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGATTATTCATCTCAACTTAACTTTATGAc > 2:496129/2‑240 (MQ=255) aGATATAAAAATACTTGACAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGAAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTACAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGATTATTCATCTCAACTTAACTTTATGACAGAATCTTTAg > 1:334603/1‑251 (MQ=255) 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atatAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGATTATTCATCTCAACTTAACTTTATGACAGAATCTTTAgg < 2:161567/250‑1 (MQ=255) atatAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGATTATTCATCTCAACTTAACTTTATGACAGAATCTTTAgg < 2:36043/250‑1 (MQ=255) taAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTACTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGt < 2:784519/203‑1 (MQ=255) 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cTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGATTATTCATCTCAACTTAACTTTATGACAGAATCTTTAGGGATAGATTTAGTAATAAATCCAGa > 1:536413/1‑251 (MQ=255) aGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGATTATTCATCTCAACTTAACTTTATGACAGAATCTTTAGGGATAGATTTAGTAATAAATCCAGaa > 2:63485/1‑250 (MQ=255) aGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGCAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTacac > 2:813739/1‑162 (MQ=255) ataatGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGATTATTCATCTCAACTTAACTTTATGACAGAATCTTTAGGGATAGATTTAGTAATAAATCCAGAACTTGaa > 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attatGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGATTATTCATCTCAACTTAACTTTATGAc < 1:44058/200‑1 (MQ=255) attatGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGATTATTCATCTCAACTTAACTTTATGAc > 2:44058/1‑200 (MQ=255) attatGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGATTATTCATCTCAACTTAACTTTATGACAGAATCTTTAGGGATAGATTTAGTAATAAATCCAGAACTTGAAGCAGCaaa > 2:642651/1‑251 (MQ=255) attatGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGATTATTCATCTCAACTTAACTTTATGACAGAATCTTTAGGGATAGATTTAGTAATAAATCCAGAACTTGAAGCAGCaaa > 2:712430/1‑251 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |