| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP028101 | 865498 = | 158 (0.880) | 7 (0.040) | 4/422 | 3.6 | 4.1% | coding (128/1359 nt) | C7Y58_04280 | Trk system potassium transporter TrkA |
| ? | CP028101 | 865618 = | 178 (1.040) | coding (248/1359 nt) | C7Y58_04280 | Trk system potassium transporter TrkA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
TTAAAAAAGCAGTTGAGCCTTTATATCTTCCAAATATTGAAGATTATGGATATAAGATGGTAGATAAAAAAGATTATGAAGAATTTACAGCTTATATATATAAAAAATAGGATAGGGGTAAAATGAAAATAGTAATTGTAGGAGCAGGTAAAGTTGGAGAGTTACTTTGCCGTGATTTATCATTAGAGGGAAATGATATAATTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGATTATTCATCTCAACTTAACTTTATGACAGAATCTTTAGGGATAGATTTAGTAATAAATCCAGAACTTGAAGCA > CP028101/865249‑865748 | ttAAAAAAGCAGTTGAGCCTTTATATCTTCCAAATATTGAAGATTATGGATATAAGATGGTAGATAAAAAAGATTATGAAGAATTTACAGCTTATATATATAAAAAATAGGATAGGGGTAAAATGAAAATAGTAATTGTAGGAGCAGGTAAAGTTGGAGAGTTACTTTGCCGTGATTTATCATTAGAGGGAAATGATATAATTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCtaataa < 1:868785/250‑1 (MQ=255)ttAAAAAAGCAGTTGAGCCTTTATATCTTCCAAATATTGAAGATTATGGATATAAGATGGTAGATAAAAAAGATTATGAAGAATTTACAGCTTATATATATAAAAAATAGGATAGGGGTAAAATGAAAATAGTAATTGTAGGAGCAGGTAAAGTTGGAGAGTTACTTTGCCGTGATTTATCATTAGAGGGAAATGATATAATTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCtaataa < 1:370438/250‑1 (MQ=255) aaaGCAGTTGAGCCTTTATATCTTCCAAATATTGAAGATTATGGATATAAGATGGTAGATAAAAAAGATTATGAAGAATTTACAGCTTATATATATAAAAAATAGGATAGGGGTAAAATGAAAATAGTAATTGTAGGAGCAGGTAAAGTTGGAGAGTTACTTTGCCGTGATTTATCATTAGAGGGAAATGATATAATTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACTTGAAAAGATTCTAGCTAATAATGatat < 2:202776/251‑1 (MQ=255) ttGAGCCTTTATATCTTCCAAAAAATGAAGATTATGGATATAAGATGGTAGATGAAAAAGATTATGAAGAATTTACAGCTGATATATATAAAAAATAGGATAGGCGTAAAATGAAAATAGAAATTGTTGGAGCAGGTAAAGTTGGAGAGTTACTTAGCCGTGATTTATCAATAGAGGGAAATGATATAATTTTAATTGAACAAGATATAAAAATACTTGAAAAGATTGTCGCTAATAATGAtattgtga < 2:743503/249‑5 (MQ=255) 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1:850998/1‑250 (MQ=255) ataatGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGATTATTCATCTCAACTTAACTTTATGACAGAATCTTTAGGGATAGATTTAGTAATAAATCCAGAACTTGaa > 1:43241/1‑251 (MQ=255) ataatGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAGTACAGATTATTCATCTCAACTTAACTTTATGACAGAATCTTTAGGGATAGATTTAGTAATAAATCCAGAACTTGaa > 2:155072/1‑251 (MQ=255) taatGATATTATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACt > 1:98665/1‑94 (MQ=255) taatGATATCATGGGGTTCGTTGGTAGTGGTGTGAGTTATGATGTACAGATGGAAGCAGAAGTCCCAAAAGCTGATGTTTTTATAGCTGTTACTGAAAAAGATGAAATAAATATAATATCATCAGTTATAGCTAAAAAATTAGGGGCAAAGTACACTATTGCCAGAGTTAGAAg < 1:104701/174‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |