| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP028101 | = 2060554 | 274 (1.960) | coding (184/1413 nt) | C7Y58_09990 | alanine:cation symporter family protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 308 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |