| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP028101 | 2060542 = | 263 (1.870) | 17 (0.120) | 12/440 | 2.4 | 6.0% | coding (172/1413 nt) | C7Y58_09990 | alanine:cation symporter family protein |
| ? | CP028101 | = 2060554 | 274 (1.960) | coding (184/1413 nt) | C7Y58_09990 | alanine:cation symporter family protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
TTTCAACTTTAATGAAGTAACAAAATTTTAAAATAAATAAAAGGGGGTAAAATTATATGGATTTTTTAAATTATATAATTGGACAAATCAACACAGTTTTATGGTCTTATGTTCTTATTGCACTTTTACTACTATCAGGGTTATTTTATACTTTGAGGACAGGTTTTGCACAAGGAAGATTATTAGGTGATATGGTTGCATTAATTACTGGCAAACTTTCTTCACTTAAAGATGGTGAAAAGAAAATTGCTGGACAAGTAACTGGTTTCCAAGCGTTCTGTATAGCTGTTGCTTCTCACGTTGGAACAGGTAACCTTGCAGGAGTTGCAATAGCAGTTGTAGTTGGTGGCCCAGGAGCATTGTTTTGGATGTGGATAATTGCTCTTTTAGGTGCTGCAACAAGTTTAATCGAAAATACTTTGGCTCAAACTTATAAAGTAAAAGATGGTAAAGGTGGATTTAGAGGTGGACCTTCTTA > CP028101/2060315‑2060792 | tttCAACTTTAATGAAGTAACAAAATTTTAAAATAAATCAAAGGGGGTAAAATTATATGCATTTTTTAAATTATATAATTGTACAAATCAACACAGTTTTATGGTCTTATGTTCTTATTGCACTTTTACTACTATCAGGGTTATTTTATACTTTGAGGACAGGTTTTGCACAAGGAAGATTATTAGGTGATATGGTTGCATTAATTACTGGCAAACTTTCTTCACTTAAAGATGGTGAAAAGAAAATTGCt < 1:532944/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |