| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP028101 | = 2136413 | 203 (0.880) | 21 (0.090) | 15/298 | 11.0 | 9.2% | intergenic (‑791/+84) | C7Y58_10225/C7Y58_10230 | autotransporter domain‑containing protein/hypothetical protein |
| ? | CP028101 | 2136935 = | 210 (0.910) | pseudogene (591/1029 nt) | C7Y58_10230 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
CCTAAAATTAAGAATAATACTCCAAACGGATATCCTATTGAGTGCCCTACTCCAACTCCAGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTAGCTGCTGCAAGTCCTGCTGAACTTGT > CP028101/2136786‑2137084 | ccTAAAATTAAGAATAATACTCCAAATGGATATCCTATTGAGTGCCCTACTCCAACTCCAGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCAttt > 1:1140778/1‑150 (MQ=255) tAAAATTAAGAATAATACTCCAAACGGATATCCTATTGAGTGCCCTACTCCAACTCCAGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCAttttt < 1:2544479/150‑1 (MQ=255) tAAAATTAAGAATAATACTCCAAACGGATATCCTATTGAGTGCCCTACTCCAACTCCAGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCAttttt > 1:1955678/1‑150 (MQ=255) aaaaTTAAGAATAATACTCCAAACGGATATCCTATTGAGTGCCCTACTCCAACTCCAGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCAtttttt < 1:823358/150‑1 (MQ=255) aataatACTCCAAACGGATATCCTATTGAGTGCCCTACTCCAACTCCAGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCa < 1:2312379/150‑1 (MQ=255) ataataCTCCAAACGGATATCCTATTGAGTGCCCTACTCCAACTCCAGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCAt > 1:1291615/1‑150 (MQ=255) cTCCAAACGGATATCCTATTGAGTGCCCTACTCCAACTCCAGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCtcttt > 1:2071490/1‑150 (MQ=255) cGGATATCCTATTGAGTGCCCTACTCCAACTCCAGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGc < 1:3179437/150‑1 (MQ=255) cGGATATCCTATTGAATGCCCTACTCCAACTCCAGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGc < 1:3332340/150‑1 (MQ=255) ggATAGCCTATTGAGTGCCCTACTCCAACTCCAGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCa < 1:2649818/150‑1 (MQ=255) cTATTGAGTGCCCTACTCCAACTCCAGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGa > 1:1634844/1‑150 (MQ=255) tATTGAGTGCCCTACTCCAACTCCAGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGat < 1:878205/150‑1 (MQ=255) tGAGTGCCCTACTCCAACTCCAGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGataat < 1:1579419/150‑1 (MQ=255) gTGCCCTACTCCAACTCCAGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGc > 1:476004/1‑150 (MQ=255) tGCCCTACTCCAACTCCAGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCt > 1:720893/1‑150 (MQ=255) cccTACTCCAACTCCAGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTaa > 1:585869/1‑150 (MQ=255) tccaactccaGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAAtttt < 1:1524387/150‑1 (MQ=255) ccaactccaGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAAttttt < 1:2986726/150‑1 (MQ=255) ccaactccaGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAAttttt < 1:494110/150‑1 (MQ=255) ccaactccaGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAAttttt > 1:3368974/1‑150 (MQ=255) caactccaGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTg < 1:2718189/150‑1 (MQ=255) caactccaGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTg < 1:957012/150‑1 (MQ=255) caactccaGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTg < 1:2625237/150‑1 (MQ=255) caactccaGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGCGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATCTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAAttttta > 1:2566491/1‑149 (MQ=255) tccaGCTTTTGTTTGTGTTACGGTAACTTCTGTTTCTTCAGCGTAGTAATTCTGTGTCTTTTCTACTGTCCTTTTTTCTGGAATATCTTCCTTTTTTACTTTAGCGTCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATCGCTAAAATTTTTGtttt < 1:3529787/150‑1 (MQ=255) tccaGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTATTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGtttt > 1:2446866/1‑150 (MQ=255) caGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTCCTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTCAAATTTTTGTTTTAg > 1:2185979/1‑150 (MQ=255) caGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAg < 1:60729/150‑1 (MQ=255) aGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGt < 1:189643/150‑1 (MQ=255) ttttGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTcc > 1:1446193/1‑150 (MQ=255) tttGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCt < 1:1419901/150‑1 (MQ=255) tttGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCt < 1:1419898/150‑1 (MQ=255) gCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCa < 1:2339177/150‑1 (MQ=255) cTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCAc < 1:2384083/150‑1 (MQ=255) cTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCAc < 1:1468792/150‑1 (MQ=255) ttCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACt < 1:287525/150‑1 (MQ=255) tCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACtt < 1:1873555/150‑1 (MQ=255) ccTGTTACATAAACTCCCATGTATTCAGCTGATAAAGTCGGTGCATTTTCTACTGTCACTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTACTTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTCGTTCCTTCACtt > 1:1019922/2‑150 (MQ=255) cTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTa > 1:3287765/1‑150 (MQ=255) gTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCTTTCACTTaaa > 1:2022614/1‑150 (MQ=255) gTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTGTGTTTTAGTGCCTTCACTTaaa < 1:3526578/150‑1 (MQ=255) tACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATc > 1:1114904/1‑150 (MQ=255) aCATCAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCAGTGTATTTTCTCCTGCCATTTTTCCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGTATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAACTTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAActct > 1:1006819/1‑150 (MQ=255) cATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCtt < 1:1170997/150‑1 (MQ=255) cATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCtt > 1:668940/1‑150 (MQ=255) tAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGa > 1:822818/1‑150 (MQ=255) tAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGa > 1:979611/1‑150 (MQ=255) tAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGa < 1:1039639/150‑1 (MQ=255) aaaCTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGaa < 1:2746760/150‑1 (MQ=255) aaCTTCTGTGTCTTCAGCTGATACAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGaaa < 1:1748072/150‑1 (MQ=255) aaCTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGaaa < 1:1199276/150‑1 (MQ=255) aaCTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGaaa < 1:3200181/150‑1 (MQ=255) aaCTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGaaa < 1:2457048/150‑1 (MQ=255) aCTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAAt < 1:758872/150‑1 (MQ=255) cTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAAtt > 1:355465/1‑150 (MQ=255) cTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCAc < 1:2049190/150‑1 (MQ=255) tgtgTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACt < 1:1224384/150‑1 (MQ=255) tgtgTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACt < 1:1834040/150‑1 (MQ=255) 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tCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAg < 1:2279300/150‑1 (MQ=255) cGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGc < 1:2303232/150‑1 (MQ=255) ggTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATTTCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCt < 1:3306010/150‑1 (MQ=255) tgtATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTc < 1:2728329/150‑1 (MQ=255) aTTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCtga > 1:2710944/1‑150 (MQ=255) aTTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTCTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGCAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCtga > 1:3064649/1‑150 (MQ=255) ttCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCCAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCtgatga > 1:3487810/1‑150 (MQ=255) tCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGAc < 1:772541/150‑1 (MQ=255) aCTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCa < 1:1753827/150‑1 (MQ=255) gTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTa > 1:1776867/1‑150 (MQ=255) cATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTAgc > 1:728023/1‑150 (MQ=255) cATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTAgc > 1:3083992/1‑150 (MQ=255) aTTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTAgct > 1:1099000/1‑150 (MQ=255) ttttttCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTAactg > 1:2536422/1‑150 (MQ=255) tttttCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTCACTCTTGCAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTAgctgc > 1:331987/1‑150 (MQ=255) tttttCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTAgctgc < 1:3458206/150‑1 (MQ=255) ttttCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTAgctgct > 1:3495040/1‑150 (MQ=255) ttttCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTAgctgct > 1:1355908/1‑150 (MQ=255) ttttCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTAgctgct > 1:379447/1‑150 (MQ=255) ttttCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTAgctgct > 1:379443/1‑150 (MQ=255) ttttCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTAgctgct < 1:3204951/150‑1 (MQ=255) ttCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTAGCtgctgc < 1:566429/150‑1 (MQ=255) ttCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTAGCtgctgc > 1:1851520/1‑150 (MQ=255) tCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTAGCTGCTGCa < 1:2507921/150‑1 (MQ=255) tCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTAGCTGCTGCAAGTCctgct < 1:698577/150‑1 (MQ=255) tCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTAGCTGCTGCAAGTCCTGCTGaa > 1:1082752/1‑150 (MQ=255) tttttAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTAGCTGCTGCAAGTCCTGCTGAACTTg > 1:2052673/1‑150 (MQ=255) | CCTAAAATTAAGAATAATACTCCAAACGGATATCCTATTGAGTGCCCTACTCCAACTCCAGCTTTTGCTTCTGTTACATAAACTTCTGTGTCTTCAGCTGATAAAGTCGGTGTATTTTCTACTGTCATTTTTTCTGGAATATCTTCATTTTTTAATTTAGCATCTCTTTCTTTTGCATTATTGATAATAGCTAAAATTTTTGTTTTAGTTCCTTCACTTAAATCTTGAAATTCACTTGCTAAGTGTCTTGATTCAGCTTCTGATGACTCAGTAGCTGCTGCAAGTCCTGCTGAACTTGT > CP028101/2136786‑2137084 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |