| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP028101 | 718084 = | 207 (0.900) | 3 (0.010) | 3/276 | 16.4 | 1.6% | intergenic (+52/‑225) | C7Y58_03540/C7Y58_03545 | hypothetical protein/short‑chain fatty acids transporter |
| ? | CP028101 | 718110 = | 176 (0.820) | intergenic (+78/‑199) | C7Y58_03540/C7Y58_03545 | hypothetical protein/short‑chain fatty acids transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
CAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGTTTTAAATTTTTAAATATATATTTTATAAATAAATTGTATAAGTTATGTTTTAAAACATATATTTCATTTACTAAAATATTGTACTAAAAAAGTAAGGATTTAGTTGACTTTAATTTATAAACG > CP028101/717962‑718257 | cAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGtttttt < 1:3470114/150‑1 (MQ=255) tGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTAttt > 1:563031/1‑150 (MQ=255) gAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTc > 1:2492544/1‑150 (MQ=255) 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ctagaGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTctata < 1:2733814/146‑1 (MQ=255) cTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTctata < 1:2035775/150‑1 (MQ=255) cTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTctata > 1:2122456/1‑150 (MQ=255) tAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTctataa > 1:626165/1‑150 (MQ=255) aaaGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTctataaa < 1:895958/150‑1 (MQ=255) 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aaaaCTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTctataaaagctata > 1:1473914/1‑150 (MQ=255) aaaCTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTctataaaagctataa > 1:3321968/1‑150 (MQ=255) cTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTctataaaagctataaaag < 1:719999/150‑1 (MQ=255) ggAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGtt < 1:1230543/150‑1 (MQ=255) agaTGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGtttt > 1:911827/1‑150 (MQ=255) agaTGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGtttt > 1:911818/1‑150 (MQ=255) gaTGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGCATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTGAGCTAAGGGTAAAATTAATAAAGAATTATTAATTAAGAATATGAAAACCGTGAGGAGTCTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGtttga < 1:3514889/150‑3 (MQ=255) tGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAAACGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGttttaaa > 1:2775831/1‑150 (MQ=255) tGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAACTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGttttaaa < 1:2173158/150‑1 (MQ=255) caaccaacTGCTTGGGCCGGTATACAAGCTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTCAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTCTATAACAGCTATAAAAGttttaaattt > 1:2436852/1‑150 (MQ=255) aaccaacTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGttttaaatttt < 1:2039857/150‑1 (MQ=255) accaacTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGttttaaattttt < 1:3045895/150‑1 (MQ=255) accaacTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGttttaaattttt > 1:1304960/1‑150 (MQ=255) accaacTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAA‑CCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGttttaaattttta < 1:1017462/150‑1 (MQ=255) ccaacTGCTTGTTCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTGGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGATTAGTCTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGttttaaattttta < 1:2375106/150‑1 (MQ=255) ccaacTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGttttaaattttta > 1:1263707/1‑150 (MQ=255) caacTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGttttaaatttttaa < 1:1702471/150‑1 (MQ=255) aacTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGttttaaatttttaaa < 1:2473377/150‑1 (MQ=255) aacTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGttttaaatttttaaa < 1:814079/150‑1 (MQ=255) acTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATACGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGttttaaatttttaaat < 1:3317009/150‑1 (MQ=255) 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ggTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGTTTTAAATTTTTAAATATATATTTTATAAATAAATTGTATAAGTTATGTTTTAACACATATATTTCATTTACTAAAATATTGTACTAAGGAAGTAAGGATTTAGTTGGCTTTAATTtatc < 1:272469/150‑2 (MQ=255) gTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGTTTTAAATTTTTAAATATATATTTTATAAATAAATTGTATAAGTTATGTTTTAAAACATATATTTCATTTACTAAAATATTGTACTAAAAAAGTAAGGATTTAGTTGACTTTAATTTATaa > 1:1630363/1‑150 (MQ=255) ttttttATTTCTATAAAAGCTATAAAAGTTTTAAATTTTTAAATATATATTTTATAAATAAATTGTATAAGTTATGTTTTAAAACATATATTTCATTTACTAAAATATTGTACTAAAAAAGTAGGGATTTAGTTGACTTTAATTTATaaa > 1:3044391/1‑150 (MQ=255) ttttttATTTCTATAAAAGCTATAAAAGTTTTAAATTTTTAAATATATATTTTATAAATAAATTGTATAAGTTATGTTTTAAAACATATATTTCATTTACTAAAATATTGTACTAAAAAAGTAAGGATTTAGTTGACTTTAATTTATaaa > 1:218832/1‑150 (MQ=255) ttttgtATTTCTATAAAAGCTATAAAAGTTTTAAATTTTTAAATATATATTTTATAAATAAATTGTATAAGTTATGTTTTAAAACATATATTTCATTTACTAAAATATTGTACTAAAAAAGTAAGGATTTAGTTGACTTTAATTTATaaa < 1:2537826/150‑1 (MQ=255) tttttATTTCTATAAAAGCTATAAAAGTTTTAAATTTTTAAATATATATTTTATAAATAAATTGTATAAGTTATGTTTTAAAACATATATTTCATTTACTAAAATATTGTACTAAAAAAGTAAGGATTTAGTTGACTCTAATTTATAAAc > 1:3292057/1‑150 (MQ=255) ttttATTTCTATAAAAGCTATAAAAGTTTTAAATTTTTAAATATATATTTTATAAATAAATTGTATAAGTTATGTTTTAAAACATATATTTCATTTACTAAAATATTGTACTAAAAAAGTAAGGATTTAGTTGACTTTAATTTATAAACg < 1:154504/150‑1 (MQ=255) | CAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGTCTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGTTTTAAATTTTTAAATATATATTTTATAAATAAATTGTATAAGTTATGTTTTAAAACATATATTTCATTTACTAAAATATTGTACTAAAAAAGTAAGGATTTAGTTGACTTTAATTTATAAACG > CP028101/717962‑718257 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |