| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP028101 | 718084 = | 207 (0.900) | 3 (0.010) | 3/276 | 16.4 | 1.6% | intergenic (+52/‑225) | C7Y58_03540/C7Y58_03545 | hypothetical protein/short‑chain fatty acids transporter |
| ? | CP028101 | 718110 = | 176 (0.820) | intergenic (+78/‑199) | C7Y58_03540/C7Y58_03545 | hypothetical protein/short‑chain fatty acids transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
GTGCTGAATATAGAAACTGGGCAGTTACAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGT‑CTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGTTTTAAATTTTTAAATATATATTTTATAAATAAATTGTATAAGTTATGTTTTAAAACATATATTTCATTTACTAAAATATTGTACTAAAAAAGTAAGGA > CP028101/717935‑718232 | gTGCTGAATATAGAAACTGGGCAGTTACAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGa > 1:1664138/1‑150 (MQ=255) cTGAATATAGAAACTGGGCAGTTACAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGaaaa > 1:2836671/1‑150 (MQ=255) tGAATATAGAAACTGGGCAGTTACAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAAc > 1:1844043/1‑150 (MQ=255) tGAATATAGAAACTGGGCAGTTACAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAAc < 1:2551819/150‑1 (MQ=255) gAATATAGAAACTGGGCAGTTACAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAAcc < 1:1442007/150‑1 (MQ=255) atatAGAAACTGGGCAGTTACAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGt > 1:1738542/1‑150 (MQ=255) tataGAAACTGGGCAGTTACAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTg < 1:2464268/150‑1 (MQ=255) tataGAAACTGGGCAGTTACAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAAATGGCAACCAACTACTTGGACTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATACAAAATTATTAATTAATAATATAAAAACCGTg > 1:2360859/1‑150 (MQ=255) ataGAAACTGGGCAGTTACAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGa > 1:2068199/1‑150 (MQ=255) ataGAAACTGGGCAGTTACAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGa < 1:2433490/150‑1 (MQ=255) taGAAACTGGGCAGTTACAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGag > 1:2469273/1‑150 (MQ=255) gAAACTGGGCAGTTACAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGagta > 1:1204041/1‑150 (MQ=255) gAAACTGGGCAGTTACAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGagta > 1:2010080/1‑150 (MQ=255) aaCTGGGCAGTTACAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGagtagt < 1:514060/150‑1 (MQ=255) aaCTGGGCAGTTACAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGagtagt < 1:514054/150‑1 (MQ=255) gTTACAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGT‑CTCACGGtt < 1:884863/150‑1 (MQ=255) ttACAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGT‑CTCACGGttt > 1:39816/1‑150 (MQ=255) cAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGT‑CTCACGGtttttt > 1:640564/1‑150 (MQ=255) 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aaaaaCTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGATGGTATGAAAGTTACTTTCTATTCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAACTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGT‑ATCACGGTTTTTTATTTctataaaagctat > 1:3132966/1‑150 (MQ=255) aaaaCTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGT‑CTCACGGTTTTTTATTTctataaaagctata > 1:2969138/1‑150 (MQ=255) aaaaCTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGT‑CTCACGGTTTTTTATTTctataaaagctata > 1:1473913/1‑150 (MQ=255) aaaCTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGT‑CTCACGGTTTTTTATTTctataaaagctataa > 1:3321968/1‑150 (MQ=255) aaCTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGACAGTTCCTTTCTAATCTAGCTTCGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTCTTAGTTACTAATATGCCACCCGTGATTCGT‑CTCACGATTTTTTATTTctctaaaagttctaaa > 1:3508984/1‑143 (MQ=255) 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atGAAAACCGTGAGTAGT‑CTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGTTTTAAATTTTTAAATATATATTTTATAAATAAATTGTATAAGTTATGTTTTAAAACATATATTTCATTTACTAAAATATTGTACTAAAAAAGTAAg < 1:3086/150‑1 (MQ=255) tGAAAACCGTGAGTAGT‑CTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGTTTTAAATTTTTAAATATATATTTTATAAATAAATTGTATAAGTTATGTTTTAAAACATATATTTCATTTACTAAAATATTGTACTAAAAAAGTAAgg > 1:1011491/1‑150 (MQ=255) | GTGCTGAATATAGAAACTGGGCAGTTACAGCTGAATCTAAAGCTAAAAACTGGAGATGGCAACCAACTGCTTGGGCTGGTATGAAAGTTACTTTCTAATCTAGCTTAGCTAAGGTTAAAATTAATAAAAAATTATTAATTAATAATATGAAAACCGTGAGTAGT‑CTCACGGTTTTTTATTTCTATAAAAGCTATAAAAGTTTTAAATTTTTAAATATATATTTTATAAATAAATTGTATAAGTTATGTTTTAAAACATATATTTCATTTACTAAAATATTGTACTAAAAAAGTAAGGA > CP028101/717935‑718232 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |