| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP028101 | = 131134 | 238 (1.030) | 4 (0.020) | 3/272 | 16.3 | 1.8% | intergenic (+28/+36) | C7Y58_00635/C7Y58_00640 | ribosome‑recycling factor/preprotein translocase subunit SecY |
| ? | CP028101 | = 131139 | 221 (1.050) | intergenic (+33/+31) | C7Y58_00635/C7Y58_00640 | ribosome‑recycling factor/preprotein translocase subunit SecY | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
TTTCTGAAGATGAATTAAAGAAAGAAGAAACAAATGTTCAAACTTTAACTGATAAATATGTTAAAGAAATTGATGATTTACTTGCTAAAAAAGAAAAAGAAATTACTACAATCTAAGTAAATAGTGTTAATAAAAAAGATAGGTCAAAAACCTATCTTTTTTCATTTATATAATAATTATTAAATAAATCCTTTATAATCTCTCATAACTAAATGAGCATCTATTTGTTGTATAGTATCTAATGCAACACCAACAACAATTATTATTCCTGTTCCTCCAAAGTAAACTGGAAGTCCCA > CP028101/130991‑131288 | ttCTGAAGATGAATTAAAGAAAGAAGAAACAAATGTTCAAACTTTAACTGATAAATATGTTAAAGAAATTGATGATTTACTTGCTAAAAAAGAAAAAGAAATTACTACAATCTAAGTAAATAGTGTTAATAAAAAAGATAGGTCAAAAAc < 1:187510/150‑1 (MQ=255) tCTGAAGATGAATTAAAGAAAGAAGAAACAAATGTTCAAACTTTAACTGATAAATATGTTAAAGAAATTGATGATTTACTTGCTAAAAAAGAAAAAGAAATTACTACAATCTAAGTAAATAGTGTTAATAAAAAAGATAGGTCAAAAAcc > 1:573813/1‑150 (MQ=255) cTGAAGATGAATTAAAGAAAGAAGAAACAAATGTTCAAACTTTAACTGATAAATATGTTAAAGAAATTGATGATTTACTTGCTAAAAAAGAAAAAGAAATTACTACAATCTAAGTAAATAGTGTTAATAAAAAAGATAGGTCAAAAACCt > 1:2037866/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |