| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP028101 | = 131134 | 238 (1.030) | 4 (0.020) | 3/272 | 16.3 | 1.8% | intergenic (+28/+36) | C7Y58_00635/C7Y58_00640 | ribosome‑recycling factor/preprotein translocase subunit SecY |
| ? | CP028101 | = 131139 | 221 (1.050) | intergenic (+33/+31) | C7Y58_00635/C7Y58_00640 | ribosome‑recycling factor/preprotein translocase subunit SecY | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
TCCTATTTCTGAAGATGAATTAAAGAAAGAAGAAACAAATGTTCAAACTTTAACTGATAAATATGTTAAAGAAATTGATGATTTACTTGCTAAAAAAGAAAAAGAAATTACTACAATCTAAGTAAATAGTGTTAATAAAAAAGATAGGTCAAAAACCTATCTTTTTTCATTTATATAATAATTATTAAATAAATCCTTTATAATCTCTCATAACTAAATGAGCATCTATTTGTTGTATAGTATCTAATGCAACACCAACAACAATTATTATTCCTGTTCCTCCAAAGTAAACTGGAAG > CP028101/130986‑131283 | tCCTATTTCTGAAGATGAATTAAAGAAAGAAGAAACAAATGTTCAAACTTTAACTGATAAATATGTTAAAGAAATTGATGATTTACTTGCTAAAAAAGAAAAAGAAATTACTACAATCTAAGTAAATAGTGTTAATAAAAAAGATAGGTc > 1:929634/1‑150 (MQ=255) ccTATTTCTGAAGATGAATTAAAGAAAGAAGAAACAAATGTTCAAACTTTAACTGATAAATATGTTAAAGAAATTGATGATTTACTTGCTAAAAAAGAAAAAGAAATTACTACAATCTAAGTAAATAGTGTTAATAAAAAAGATAGGTCa > 1:1022880/1‑150 (MQ=255) ccTATTTCTGAAGATGAATTAAAGAAAGAAGAAACAAATGTTCAAACTTTAACTGATAAATATGTTAAAGAAATTGATGATTTACTTGCTAAAAAAGAAAAAGAAATTACTACAATCTAAGTAAATAGTGTTAATAAAAAAGATAGGTCa < 1:3056771/150‑1 (MQ=255) cTATTTCTGAAGATGAATTAAAGAAAGAAGAAACAAATGTTCAAACTTTAACTGATAAATATGTTAAAGAAATTGATGATTTACTTGCTAAAAAAGAAAAAGAAATTACTACAATCTAAGTAAATAGTGTTAATAAAAAAGATAGGTCaa > 1:3442965/1‑150 (MQ=255) tttCTGAAGATGAATTAAAGAAAGAAGAAACAAATGTTCAAACTTTAACTGATAAATATGTTAAAGAAATTGATGATTTACTTGCTAAAAAAGAAAAAGAAATTACTACAATCTAAGTAAATAGTGTTAATAAAAAAGATAGGTCaaaaa < 1:841474/150‑1 (MQ=255) ttCTGAAGATGAATTAAAGAAAGAAGAAACACATGTTCAAACTTTAACTGATAAATATGTTAAAGAAATTGATGATTTACTTGCTAAAAAAGAAAAAGAAATTACTACAATCTAAGTAAATAGTGTTAATAAAAAAGATAGGTCAAAAAc < 1:1742017/150‑1 (MQ=255) ttCTGAAGATGAATTAAAGAAAGAAGAAACAAATGTTCAAACTTTAACTGATAAATATGTTAAAGAAATTGATGATTTACTTGCTAAAAAAGAAAAAGAAATTACTACAATCTAAGTAAATAGTGTTAATAAAAAAGATAGGTCAAAAAc < 1:187508/150‑1 (MQ=255) aaGATGAATTAAAGAAAGAAGAAACAAATGTTCAAACTTTAACTGATAAATATGTTAAAGAAATTGATGATTTACTTGCTAAAAAAGAAAAAGAAATTACTACAATCTAAGTAAATAGTGTTAATAAAAAAGATAGGTCAAAAACCTATc < 1:338018/150‑1 (MQ=255) aaGATGAATTAAAGAAAGAAGAAACAAATGTTCAAACTTTAACTGATAAATATGTTAAAGAAATTGATGATTTACTTGCTAAAAAAGAAAAAGAAATTACTACAATCTAAGTAAATAGTGTTAATAAAAAAGATAGGTCAAAAACCTATc < 1:1353036/150‑1 (MQ=255) aGATGAATTAAAGAAAGAAGAAACAAATGTTCAAACTTTAACTGATAAATATGTTAAAGAAATTGATGATTTACTTGCTAAAAAAGAAAAAGAAATTACTACAATCTAAGTAAATAGTGTTAATAAAAAAGATAGGTCAAAAACCTATCt > 1:660223/1‑150 (MQ=255) tGAATTAAAGAAAGAAGAAACAAATGTTCAAACTTTAACTGATAAATATGTTAAAGAAATTGATGATTTACTTGCTAAAAAAGAAAAAGAAATTACTACAATCTAAGTAAATAGTGTTAATAAAAAAGATAGGTCAAAAACCTATCtttt > 1:145541/1‑150 (MQ=255) aTTAAAGAAAGAAGAAACAAATGTTCAAACTTTAACTGATAAATATGTTAAAGAAATTGATGATTTACTTGCTAAAAAAGAAAAAGAAATTACTACAATCTAAGTAAATAGTGTTAATAAAAAAGATAGGTCAAAAACCTATCTTTTTTc < 1:793737/150‑1 (MQ=255) aTTAAAGAAAGAAGAAACAAATGTTCAAACTTTAACTGATAAATATGTTAAAGAAATTGATGATTTACTTGCTAAAAAAGAAAAAGAAATTACTACAATCTAAGTAAATAGTGTTAATAAAAAAGATAGGTCAAAAACCTATCTTTTTTc < 1:2762685/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |