| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP028101 | = 82578 | 400 (0.840) | 10 (0.030) | 9/238 | 20.3 | 3.1% | coding (495/504 nt) | C7Y58_00325 | hypothetical protein |
| ? | CP028101 | = 82548 | 298 (0.790) | coding (1582/1584 nt) | C7Y58_00320 | potassium/proton antiporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 395 total aligned reads displayed.
TTGATAAAAATTCAAAATACAAAAATAAATCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATGAACAATTTCTGTTTG > CP028101/82399‑82697 | gATAAAAATGCAAAATACAAAAATAAATCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATaa < 2:942091/150‑1 (MQ=255) aaaaaTTCAAAATACAAAAATAAATCTATTAGAGAACTTGATAAGAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATaaaaa < 2:1369325/150‑1 (MQ=255) aaaaaTTCAAAATACAAAAATAAATCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATaaaaa < 2:3431907/150‑1 (MQ=255) aaaaaTTCAAAATACAAAAATAAATCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATaaaaa < 2:1929632/150‑1 (MQ=255) aaaaaTTCAAAATACAAAAATAAATCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATaaaaa > 2:2888186/1‑150 (MQ=255) aaaaTTCAAAATACAAAAATAAATCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATaaaaaa < 1:457728/150‑1 (MQ=255) aaaTTCAAAATACAAAAATAAATCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATaaaaaaa < 1:969175/150‑1 (MQ=255) aaTTCAAAATACAAAAATAAATCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAAt > 2:1152614/1‑150 (MQ=255) aTTCAAAATACAAAAATAAATCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATa < 1:2434174/150‑1 (MQ=255) aTTCAAAATACAAAAATAAATCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATa > 2:75176/1‑150 (MQ=255) ttaaaaaTATAAAAATAAATCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTTTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATaa < 1:2019639/147‑1 (MQ=255) ttCAAAATACAAAAATAAATCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATaa < 2:3304377/150‑1 (MQ=255) aCAAAAATAAATCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTg < 1:1458258/150‑1 (MQ=255) cAAAAATAAATCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGc > 1:2472848/1‑150 (MQ=255) aaaaTAAATCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCt < 2:69477/150‑1 (MQ=255) aataaatCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTa < 2:347747/150‑1 (MQ=255) aaatCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTAttt < 1:1444805/150‑1 (MQ=255) atCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTAttttt < 1:1607650/150‑1 (MQ=255) tCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTAtttttt < 2:1390719/150‑1 (MQ=255) tCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTGTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTAtttttt < 2:2518245/150‑1 (MQ=255) cTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTAttttttt < 1:3370478/150‑1 (MQ=255) cTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTAttttttt < 1:1054878/150‑1 (MQ=255) tATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTAtttttttt < 2:1945501/150‑1 (MQ=255) aTTAGAGAACTTGATAAAAATACTGTAGTTGTTATGATTAAAAGAAATGCTGTTGCTATGATTCCAAGGGGAAATACAGCTTTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAGAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTttc < 2:3083411/150‑1 (MQ=255) tAGAGAACTTGATAAAAATACTTCAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTttctt > 2:1831650/1‑150 (MQ=255) agagAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTttcttc < 2:3131734/150‑1 (MQ=255) gaACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTtctgt > 1:86847/1‑150 (MQ=255) cTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTtctgtctg > 2:1597267/1‑150 (MQ=255) tGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCtgtg > 1:2920806/1‑150 (MQ=255) tagaagcaCTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATCTTTTGGTATGACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGtat < 2:2401592/143‑1 (MQ=255) tAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGtat > 2:2075956/1‑150 (MQ=255) tACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTTGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAg < 1:2936018/150‑1 (MQ=255) tACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCat > 1:2240104/1‑149 (MQ=255) tACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAg < 2:217690/150‑1 (MQ=255) cTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAgtg > 1:851652/1‑150 (MQ=255) cTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGCTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAgtg < 1:602955/150‑1 (MQ=255) tttAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAgtgt > 2:1208038/1‑150 (MQ=255) ttAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGtt > 2:1999864/1‑150 (MQ=255) 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tGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTa < 1:1826817/150‑1 (MQ=255) gtgttACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAGTTACCTCATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATg < 2:670265/147‑1 (MQ=255) gTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATg > 1:3149912/1‑150 (MQ=255) tACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGTCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTATTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAGTCATCATAATGTTTATGAACa > 1:2829798/1‑150 (MQ=255) tACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATTATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATGAACa > 1:2182098/1‑150 (MQ=255) 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tAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATGAACAATTTCTGTTTg < 2:275636/150‑1 (MQ=255) tAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTACTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATGAACAATTTCTGTTTg < 1:3299254/150‑1 (MQ=255) | TTGATAAAAATTCAAAATACAAAAATAAATCTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATGAACAATTTCTGTTTG > CP028101/82399‑82697 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |