| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP028101 | = 82578 | 400 (0.840) | 10 (0.030) | 9/238 | 20.3 | 3.1% | coding (495/504 nt) | C7Y58_00325 | hypothetical protein |
| ? | CP028101 | = 82548 | 298 (0.790) | coding (1582/1584 nt) | C7Y58_00320 | potassium/proton antiporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 406 total aligned reads displayed.
CTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATGAACAATTTCTGTTTGTCTTTGGTAAACTATTTCATTAGCTATTGC > CP028101/82429‑82727 | cTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTAttttttt < 1:3370478/150‑1 (MQ=255)cTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTAttttttt < 2:2956506/150‑1 (MQ=255) aTTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTttc < 1:6780/150‑1 (MQ=255) aTTAGAGAACTTGATAAAAATACTGTAGTTGTTATGATTAAAAGAAATGCTGTTGCTATGATTCCAAGGGGAAATACAGCTTTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAGAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTttc < 2:3083411/150‑1 (MQ=255) tAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTttctt > 2:1402628/1‑150 (MQ=255) agagAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTttcttc > 1:3298302/1‑150 (MQ=255) agagAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTttcttc < 2:3131734/150‑1 (MQ=255) gaACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATGAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTtctgt > 1:86843/1‑150 (MQ=255) aaCTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTtctgtc > 2:660815/1‑150 (MQ=255) ttGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTctgtctgt > 2:2331888/1‑150 (MQ=255) gATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTgtgt > 1:138886/1‑150 (MQ=255) tAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGtat > 1:2725830/1‑150 (MQ=255) aaTACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATc < 2:194456/150‑1 (MQ=255) aTACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGGGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACGGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCa < 1:3556390/150‑1 (MQ=255) aTACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTACTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACGGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCa < 1:2204747/150‑1 (MQ=255) cTTTCATTTTTATGAGTAAAAGAAATGATTTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAACATGCTATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAgtg < 1:3110998/150‑1 (MQ=255) cTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAgtg > 1:2428412/1‑150 (MQ=255) cTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAgtg < 1:602948/150‑1 (MQ=255) tttAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAgtgt > 2:848264/1‑150 (MQ=255) tttAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAgtgt > 2:1208038/1‑150 (MQ=255) aTTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTtgc > 1:279217/1‑150 (MQ=255) tGATTAAAAGAAATGATGTTGCGATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGcttct < 1:1854834/150‑1 (MQ=255) gATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACACCTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGcttctt > 2:3514103/1‑150 (MQ=255) gATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGcttctt > 1:1915615/1‑150 (MQ=255) aTTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTtg > 2:3471563/1‑150 (MQ=255) ttAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTtgt > 1:1189389/1‑150 (MQ=255) aaaGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGa < 2:1992073/150‑1 (MQ=255) aaaGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGa > 1:629839/1‑150 (MQ=255) aaGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGat < 1:971645/150‑1 (MQ=255) aGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGata < 1:2451227/150‑1 (MQ=255) gAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGatat > 1:1947628/1‑150 (MQ=255) tGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTa > 2:2770521/1‑150 (MQ=255) cTATGATTCCAAGTGGAAATACGACTCTATTAGACAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTaaa > 2:2688526/1‑150 (MQ=255) cTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGTTTCTTGTGGATATTCCTTATTTaaa > 2:3556447/1‑150 (MQ=255) aTGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTACAat > 1:2538783/1‑150 (MQ=255) tGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAata < 1:3304181/150‑1 (MQ=255) gATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAatat < 2:188925/150‑1 (MQ=255) aTTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAGTATc > 1:2168154/1‑150 (MQ=255) aTTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATc > 2:1759647/1‑150 (MQ=255) ttCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCCGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCa > 1:1808530/1‑150 (MQ=255) tCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCat < 2:1561808/150‑1 (MQ=255) cAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCattt < 2:1328315/150‑1 (MQ=255) aaGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCattta < 1:3410170/150‑1 (MQ=255) aaGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCattta < 1:1361559/150‑1 (MQ=255) aaGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCattta > 2:479480/1‑150 (MQ=255) tGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCatttattt < 1:2925489/150‑1 (MQ=255) gAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCAtttatttta > 1:1511374/1‑150 (MQ=255) aaaTACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTACCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCAtttattttat < 2:3329310/150‑1 (MQ=255) 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gCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATGAACAATTTCTGTTTGTCTTTGGTAAAc > 2:100390/1‑150 (MQ=255) tGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATGAACAATTTCTGTTTGTCTTTGGTAAACTAttt < 1:3028377/150‑1 (MQ=255) tGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATGAACAATTTCTGTTTGTCTTTGGTAAACTAttt > 1:491274/1‑150 (MQ=255) ccTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATGAACAATTTCTGTTTGTCTTTGGTAAACTATTTCa > 1:3086666/1‑150 (MQ=255) cTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTCTTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAACATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATGAACAATTTCTGTTTGTCCTTGGTAAACTCTTTCAt > 1:3588417/1‑150 (MQ=255) cTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATGAACAATTTCTGTTTGTCTTTGGTAAACTATTTCAt > 1:2768641/1‑150 (MQ=255) tttttttttCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATGAACAATTTCTGTTTGTCTTTGGTAAACTATTTCATTAg > 2:510192/2‑150 (MQ=255) tttttttttCCTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTCCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATGAACAATTTCTGTTTGTCTTTGGTAAACTATTTCATTAg < 1:2260103/149‑1 (MQ=255) aTTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATGAACAATTTCTGTTTGTCTTTGGTAAACTATTTCATTAg > 2:1105635/1‑150 (MQ=255) aTTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATGAACAATTTCTGTTTGTCTTTGGTAAACTATTTCATTAg < 2:2086424/150‑1 (MQ=255) tttttttCTTCTGGCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATGAACAATTTCTGTTTGTCTTTGGTAAACTATTTCATTAGCt < 1:697823/150‑1 (MQ=255) ttcttcTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATGAACAATTTCTGTTTGTCTTTGGTAAACTATTTCATTAGCTATTGc > 2:3292883/1‑150 (MQ=255) | CTATTAGAGAACTTGATAAAAATACTTTAATTGTTATGATTAAAAGAAATGATGTTGCTATGATTCCAAGTGGAAATACAACTCTATTAGAAAATGATATTTTGGTATTACTTGACAGATAAAAAAATAAGGCAATTGCCTTATTTTTTTTCTTCTGTCTGTGTATTATCAGTGTTTGCTGCTTCTTGTGGATATTCCTTATTTAAAATATCATTTATTTTATATTTTTCAGCCAAATCATCATAATATTTATGAACAATTTCTGTTTGTCTTTGGTAAACTATTTCATTAGCTATTGC > CP028101/82429‑82727 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |