| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP028101 | 1969119 = | 381 (0.800) | 5 (0.010) | 5/226 | 22.4 | 1.7% | intergenic (+16/‑118) | C7Y58_09535/C7Y58_09540 | cupin domain‑containing protein/methyltransferase |
| ? | CP028101 | 1969155 = | 298 (0.830) | intergenic (+52/‑82) | C7Y58_09535/C7Y58_09540 | cupin domain‑containing protein/methyltransferase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 393 total aligned reads displayed.
TAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGAAAATTTCTATTTTAATACTTTTGATGGAAATAAAATTTTTTATAGAATATGGAATTTCGAGAA > CP028101/1969006‑1969304 | aGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCttttt > 2:1661292/1‑150 (MQ=255) aaaaaGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAAt < 2:2958693/150‑1 (MQ=255) aGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAAttttt < 2:958071/150‑1 (MQ=255) ggTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTc < 1:1592179/150‑1 (MQ=255) ggTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTGTTc < 2:1923664/150‑1 (MQ=255) tGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTa < 2:819843/150‑1 (MQ=255) tGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTa < 2:2399665/150‑1 (MQ=255) tGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTa > 2:3250901/1‑150 (MQ=255) 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tGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGaat > 1:2374770/1‑150 (MQ=255) gCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGaata > 1:3383073/1‑150 (MQ=255) aaTATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAACTCTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGactcaaa > 2:3142282/1‑144 (MQ=255) tCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAAtt > 2:2296544/1‑150 (MQ=255) tCCTCAGGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAAGGATGTTAACAATTGTGAAAGAGGAAAATTGTTGGGGTAAAGAGTAAGAAAGGAAATTTTAGTTCTTGATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAAtt < 2:1681748/150‑1 (MQ=255) cTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTc > 1:2148320/1‑150 (MQ=255) cTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTc > 1:315604/1‑150 (MQ=255) cATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCtt > 1:1942249/1‑150 (MQ=255) tGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCtttt > 2:3463202/1‑150 (MQ=255) gCCGTTGAAGCAGTAGAAAGCTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTa < 2:2345183/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |