| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP028101 | 1969119 = | 381 (0.800) | 5 (0.010) | 5/226 | 22.4 | 1.7% | intergenic (+16/‑118) | C7Y58_09535/C7Y58_09540 | cupin domain‑containing protein/methyltransferase |
| ? | CP028101 | 1969155 = | 298 (0.830) | intergenic (+52/‑82) | C7Y58_09535/C7Y58_09540 | cupin domain‑containing protein/methyltransferase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 383 total aligned reads displayed.
GGGAAGGCAAATACATTGTTGATGGAAAAACTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGAAAATTTCTATTTTAATACTTTTGATGG > CP028101/1968970‑1969268 | gggAAGGCAAATACATTGTTGATGGAAAAACTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTa > 2:1130685/1‑150 (MQ=255) gAAGGCAAATACATTGTTGATGGAAAAACTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTaaa > 2:1106573/1‑150 (MQ=255) aaGGCAAATACATTGTTGATGGAAAAACTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTNATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAg < 2:2735739/150‑1 (MQ=255) cAAATACATTGTTGATGGAAAAACTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGTACTTGTAAAATAGCAAAACTGTTATATTAAAAATTa > 2:2618304/1‑150 (MQ=255) cAAATACATTGTTGATGGAAAAACTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTa < 1:763982/150‑1 (MQ=255) cAAATACATTGTTGATGGAAAAACTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTa > 2:3369887/1‑150 (MQ=255) cAAATACATTGTTGATGGAAAAACTTTTACAGTCAAAAAAGATGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTa > 2:3560530/1‑150 (MQ=255) aTACATTGTTGATGGAAAAACTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGa > 1:1054525/1‑150 (MQ=255) aTACATTGTTGATGGAAAAACTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGa < 1:3341095/150‑1 (MQ=255) cATTGTTGATGGAAAAACTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAAt > 1:1843782/1‑150 (MQ=255) cATTGTTGATGGAAAAACTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAAt > 1:2749563/1‑150 (MQ=255) gATGGAAAAACTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAAttt > 2:3036358/1‑150 (MQ=255) tGGAAAAACTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTa > 1:1988825/1‑150 (MQ=255) ggAAAAACTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTAt > 1:2805435/1‑150 (MQ=255) gAAAAACTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTAtt > 1:2975365/1‑150 (MQ=255) gAAAAACTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTAtt > 2:1740745/1‑150 (MQ=255) gAAAAACTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCAGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTGTATTAAAGATTAAAAAATAAAATCTTAtt > 1:2176585/1‑150 (MQ=255) aaaaaCTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTAttt > 1:2940984/1‑150 (MQ=255) aaaaCTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTc > 2:836580/1‑150 (MQ=255) aaaCTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCt > 1:993441/1‑150 (MQ=255) aaaCTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCt > 2:2311386/1‑150 (MQ=255) aaCTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCtt > 1:2238064/1‑150 (MQ=255) aaCTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCtt > 2:517688/1‑150 (MQ=255) aaCTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCtt > 1:2090015/1‑150 (MQ=255) cTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTaa > 2:1344415/1‑150 (MQ=255) taGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATCTTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAAtttttt > 2:2204434/1‑150 (MQ=255) taGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCtttt < 1:2651883/150‑1 (MQ=255) tAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCttttttt < 1:2723768/150‑1 (MQ=255) aaaaaaaGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTa > 2:596776/1‑150 (MQ=255) aaaaaGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAAt < 2:1675270/150‑1 (MQ=255) aaaaGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAAtt < 2:1417626/150‑1 (MQ=255) aGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTCGCAAACTTTAAAATGATGTTCGCACTTGTAAACTAGCAAAATTGTTATATTAAAGCTTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAAttttt > 2:2974944/1‑150 (MQ=255) aGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAAttttt < 2:958071/150‑1 (MQ=255) ggTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTc < 1:1592177/150‑1 (MQ=255) tGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTa < 2:819843/150‑1 (MQ=255) tGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTa < 2:2399665/150‑1 (MQ=255) tGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTa < 1:58558/150‑1 (MQ=255) aaaGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATg > 2:2528494/1‑150 (MQ=255) aaGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGa < 1:197441/150‑1 (MQ=255) aGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGat < 2:635336/150‑1 (MQ=255) gTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGata > 1:3509809/1‑150 (MQ=255) gTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGata > 1:710699/1‑150 (MQ=255) gTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATataata > 2:815548/1‑150 (MQ=255) gTTTTACCTGCTAATATTCCCCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATataata < 2:3284848/150‑1 (MQ=255) tttACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATaaa > 1:324519/1‑150 (MQ=255) ttACCTGCTAATATTCCTCATGTCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAAt > 2:2312471/1‑150 (MQ=255) tACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAAtt < 2:677661/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTg < 1:2055066/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTg < 2:3232825/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTg < 2:1600/150‑1 (MQ=255) ccTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGa < 1:505201/150‑1 (MQ=255) ccTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGa < 2:1011528/150‑1 (MQ=255) ccTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGa > 1:1171775/1‑150 (MQ=255) tGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGaat > 1:2597452/1‑150 (MQ=255) tGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGaat > 1:2597445/1‑150 (MQ=255) tGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGaat > 2:383505/1‑150 (MQ=255) gCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGaata > 1:3383073/1‑150 (MQ=255) cTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGaataa > 1:191333/1‑150 (MQ=255) tAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGaataaa > 2:3532587/1‑150 (MQ=255) atTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGaataaaataa > 2:2467386/1‑150 (MQ=255) cTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTc > 1:315604/1‑150 (MQ=255) cATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCtt > 1:1208802/1‑150 (MQ=255) cATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCtt > 1:3299379/1‑150 (MQ=255) tGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCtttt > 2:3463202/1‑150 (MQ=255) tGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCtttt > 1:3472255/1‑150 (MQ=255) gCCGTTGAAGCAGTAGAAAGCTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTa < 2:2345183/150‑1 (MQ=255) aaGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCaa > 2:414666/1‑150 (MQ=255) aaGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCaa > 1:2867568/1‑150 (MQ=255) aGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAAt < 1:1062525/150‑1 (MQ=255) tAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAAtaaatt < 1:2484253/150‑1 (MQ=255) aGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAAtaaattt > 1:1020326/1‑150 (MQ=255) gAAAACTTTAAAATGACGTTAGCACTTGTAAAAGAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAAtaaatttt < 2:1869375/150‑1 (MQ=255) aaaCTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAAtaaattttta < 2:2318266/150‑1 (MQ=255) cTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAAtaaatttttaaat > 1:2394047/1‑150 (MQ=255) cTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAAtaaatttttaaat > 1:3109872/1‑150 (MQ=255) tttAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAAtaaatttttaaatt > 2:287691/1‑150 (MQ=255) tAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAAtaagtttttaaatttt < 2:2938751/150‑1 (MQ=255) aaaaTGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTg < 2:884776/150‑1 (MQ=255) aaaTGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTgg < 2:2013650/150‑1 (MQ=255) aaaTGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTgg < 1:134736/150‑1 (MQ=255) atgTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGggagg < 1:2164968/150‑1 (MQ=255) tAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAat < 2:3261964/150‑1 (MQ=255) tAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAat < 2:1979799/150‑1 (MQ=255) cTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGa > 1:232035/1‑150 (MQ=255) ttGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGaa > 1:3584715/1‑150 (MQ=255) tGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGaaa < 2:2256184/150‑1 (MQ=255) aaaaTAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGAAAAtt > 1:3325157/1‑150 (MQ=255) aaaTAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGAAAAttt < 1:360269/150‑1 (MQ=255) aGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGAAAATTTCTAt < 2:1220005/150‑1 (MQ=255) gCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGAAAATTTCTAtt > 1:1456582/1‑150 (MQ=255) gCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCCTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGAAAATTTCTAtt < 2:2415054/150‑1 (MQ=255) cAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGAAAATTTCTAttt > 2:546595/1‑150 (MQ=255) cAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGAAAATTTCTAttt > 1:668493/1‑150 (MQ=255) aaaaTTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGAAAATTTCTAtttt < 2:1569146/150‑1 (MQ=255) tataTTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGAAAATTTCTATTTTAATACttt > 1:878136/1‑150 (MQ=255) atTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGAAAATTTCTATTTTAATACTTTTGa > 1:2533896/1‑150 (MQ=255) ttAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGAAAATTTCTATTTTAATACTTTTGAt > 1:2160541/1‑150 (MQ=255) tAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGAAAATTTCTATTTTAATACTTTTGATg > 1:1687997/1‑150 (MQ=255) tAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGAAAATTTCTATTTTAATACTTTTGATg < 2:279264/150‑1 (MQ=255) tAAAGATTAAAAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGAAAATTTCTATTTTAATACTTTTGATg < 2:2671402/150‑1 (MQ=255) | GGGAAGGCAAATACATTGTTGATGGAAAAACTTTTATAGTAAAAAAAGGTGAAAGTACAGTTTTACCTGCTAATATTCCTCATGCCGTTGAAGCAGTAGAAAACTTTAAAATGATGTTAGCACTTGTAAAATAGCAAAATTGTTATATTAAAGATTAAGAAATAAAATTTTATTTCTTAATCTTTTTTTAATTTTTCTATGATATAATAAATTGAATAAAATAATTTCTTTTATTTTCAATAAATTTTTAAATTTTGGGGAGGAAATATGGAAAATTTCTATTTTAATACTTTTGATGG > CP028101/1968970‑1969268 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |