| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | Xen36_28 | = 1675 | 0 (0.000) | 190 (0.470) | 94/262 | 0.2 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | Xen36_9 | 19 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+409) | –/salA | –/Iron‑sulfur cluster carrier protein | |||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACATATTGTCATTCAGTTTTCAATGTTCATTAATGTTCAATCTCTTTTATTGTACTTCATTAAATTATTGAAGTCAATAACTTTTTGAACGATTACTTTATTTATTTTATATTGTTTTTATA > Xen36_9/1‑168 | taacatcagagaagcaagcttctcgtccgttcgctcgacttgcatgtattaggcacgccgccagcgttcatcctgagccaggatcaaactctccataaaaattatgatgtttgattagctcataaatactaaataatgtttgtaacttat < 1:3375412‑M2/3‑1 (MQ=255) acatcagagaagcaagcttctcgtccgttcgctcgacttgcatgtattaggcacgccgccagcgttcatcctgagccaggatcaaactctccataaaaattatgatgtttgattagctcataaatactaaataatgtttgtaactTATAg < 1:421420‑M2/5‑1 (MQ=255) acatcagagaagcaagcttctcgtccgttcgctcgacttgcatgtattaggcacgccgccagcgttcatcctgagccaggatcaaactctccataaaaattatgatgtttgattagctcataaatactaaataatgtttgtaactAATAg < 1:813164‑M2/5‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |