| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen36_28 | = 1675 | 0 (0.000) | 190 (0.470) | 94/262 | 0.2 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | Xen36_9 | 19 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+409) | –/salA | –/Iron‑sulfur cluster carrier protein | |||||
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
GCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen36_28/1527‑1675‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaataatgtttgtaactTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACATATTGTCATTCAGTTTTCAATGTTCATTAATGTTCAATCTCTTTTATTGTACTTCATTAAATTATTGAAGTCAATAACTTTTTGAACGATTACTTTATTT > Xen36_9/19‑149 GCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTT < 1:1473042/150‑1 CTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTA > 1:1257814/1‑150 TAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTAT < 1:3375412/150‑1 AACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATA < 1:659850/150‑1 ACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAG < 1:421420/150‑1 ACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTAATAG < 1:813164/150‑1 CATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGT > 1:3072896/1‑150 CATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGT > 1:1270166/1‑150 CATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGT > 1:1662661/1‑150 CATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGT > 1:2417172/1‑150 CATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGT > 1:3763647/1‑150 CATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGT > 1:3053524/1‑150 CATCAGAGAAGCAAGCTNCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGT > 1:3555502/1‑150 TCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTA < 1:380395/150‑1 TCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTA > 1:753654/1‑150 CAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTTGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTAC > 1:3706677/1‑150 CAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTAC < 1:2832245/150‑1 CAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTAC < 1:896234/150‑1 CAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTAATAGTTAC > 1:2735667/1‑150 CAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTAATAGTTAC > 1:541458/1‑150 CAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATATATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTAC > 1:448819/1‑150 AGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATACATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACG < 1:2225630/150‑1 AGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATACATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACG < 1:3174316/150‑1 AGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACG < 1:1002324/150‑1 GAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAATTTATAGTTACGT < 1:2515762/150‑1 GAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGT < 1:2159379/150‑1 GAAGTAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTT > 1:1495369/1‑150 GCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTG > 1:3411875/1‑150 GCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTG < 1:148441/150‑1 GCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTG < 1:2611974/150‑1 CTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATT > 1:3702811/1‑150 TCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAA > 1:3590739/1‑150 TCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAA > 1:1511217/1‑150 CTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAAC > 1:3557749/1‑150 TCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACG > 1:158075/1‑150 CGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGAC > 1:3491199/1‑150 GTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACA > 1:3476106/1‑150 CGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACATAT > 1:2147158/1‑150 CGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTAGAATTAACGTTGACATAT < 1:338565/150‑1 CGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTAC < 1:1525813/125‑1 GCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCCAACCCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACATATT > 1:2348987/1‑150 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AAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATATTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACATATTGTCATTCAGTTTTCAATGTTCATTAATGTTCAATCTCTTTTATTGTACTTCATTAAATTATTGAA > 1:2261602/1‑150 GTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGGATTAACGTTGACATATTGTCATTCAGTTTTCAATGTTCATTAATGTTCAATCTCTTTTATTGTACTTCATTAAATTATTGAAGTCAATAACTT < 1:211702/150‑1 GCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACATATTGTCATTCAGTTTTCAATGTTCATTAATGTTCAATCTCTTTTATTGTACTTCATTAAATTATTGAAGTCAATAACTTTTTGAACGA > 1:207995/1‑150 GCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACATATTGTCATTCAGTTTTCAATGTTCATTAATGTTCAATCTCTTTTATTGTACTTCATTAAATTATTGAAGTCAACAACTTTTTGAACGA > 1:207999/1‑150 CTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACATATTGTCATTCAGTTTTCAATGTTCATTAATGTTCAATCTCTTTTATTGTACTTCATTAAATTATTGAAGTCAATAACTTTTTGAACGAT > 1:3761073/1‑150 CATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACATATTGTCATTCAGTTTTCAATGTTCATTAATGTTCAATCTCTTTTATTGTACTTCATTAAATTATTGAAGTCAATAACTTTTTGAACGATTA > 1:1857355/1‑150 ATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACATATTGTCATTCAGTTTTCAATGTTCATTAATGTTCAATCTCTTTTATTGTACTTCATTAAATTATTGAAGTCAATAACTTTTTGAACGATTAC > 1:3672365/1‑150 ATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACATATTGTCATTCAGTTTTCAATGTTCATTAATGTTCAATCTCTTTTATTGTACTTCATTAAATTATTGAAGTCAATAACTTTTTGAACGATTACTTTA > 1:1441116/1‑150 ATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACATATTGTCATTCAGTTTTCAATGTTCATTAATGTTCAATCTCTTTTATTGTACTTCATTAAATTATTGAAGTCAATAACTTTTTGAACGATTACTTTA > 1:699639/1‑150 ATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACATATTGTCATTCAGTTTTCAATGTTCATTAATGTTCAATCTCTTTTATTGTACTTCATTAAATTATTGAAGTCAATAACTTTTTGAACGATTACTTTA > 1:408525/1‑150 ATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACATATTGTCATTCAGTTTTCAATGTTCATTAATGTTCAATCTCTTTTATTGTACTTCATTAAATTATTGAAGTCAATAACTTTTTGAACGATTACTTTA > 1:2770992/1‑150 ATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACATATTGTCATTCAGTTTTCAATGTTCATTAATGTTCAATCTCTTTTATTGTACTTCATTAAATTATTGAAGTCAATAACTTTTTGAACGATTACTTTA > 1:2693480/1‑150 ACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACATATTGTCATTCAGTTTTCAATGTTCATTAATGTTCAATCTCTTTTATTGTACTTCATTAAATTATTGAAGTCAATAACTTTTTGAACGATTACTTTATT > 1:3277717/1‑150 CTAAATAGTGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACATATTGTCATTCAGTTTTCAATGTTCATTAATGTTCAATCTCTTTTATTGTACTTCATTAAATTATTGAAGTCAATAACTTTTTGAACGATTACTTTATTT > 1:3167066/1‑150 CTAAATAGTGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACATATTGTCATTCAGTTTTCAATGTTCATTAATGTTCAATCTCTTTTATTGTACTTCATTAAATTATTGAAGTCAATAACTTTTTGAACGATTACTTTATTT > 1:1129613/1‑150 GCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen36_28/1527‑1675‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaataatgtttgtaactTATAGTTACGTTTTTGGAATTAACGTTGACATATTGTCATTCAGTTTTCAATGTTCATTAATGTTCAATCTCTTTTATTGTACTTCATTAAATTATTGAAGTCAATAACTTTTTGAACGATTACTTTATTT > Xen36_9/19‑149 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |