| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | Xen36_9 | 19 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+409) | –/salA | –/Iron‑sulfur cluster carrier protein | |||||
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
CGCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen36_28/1526‑1675 | cgcTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACt < 1:1600932/150‑1 (MQ=255) cTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTta > 1:1257814‑M1/1‑148 (MQ=255) tAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTtat < 1:3375412‑M1/150‑4 (MQ=255) aCATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTaatag < 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gCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTtatagttacgtttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcattaatgttcaatctcttttattgtacttcattaaattattgaagtcaataactttttgaacga > 1:207995‑M1/1‑30 (MQ=255) gCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTtatagttacgtttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcattaatgttcaatctcttttattgtacttcattaaattattgaagtcaataactttttgaacga > 1:1843196‑M1/1‑30 (MQ=255) gCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTtatagttacgtttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcattaatgttcaatctcttttattgtacttcattaaattattgaagtcaacaactttttgaacga > 1:207999‑M1/1‑30 (MQ=255) aTACTAAATAATGTTTGTAACTtatagttacgtttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcattaatgttcaatctcttttattgtacttcattaaattattgaagtcaataactttttgaacgattacttta > 1:408525‑M1/1‑22 (MQ=255) aTACTAAATAATGTTTGTAACTtatagttacgtttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcattaatgttcaatctcttttattgtacttcattaaattattgaagtcaataactttttgaacgattacttta > 1:2770992‑M1/1‑22 (MQ=255) 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cTAAATAGTGTTTGTAACTtatagttacgtttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcattaatgttcaatctcttttattgtacttcattaaattattgaagtcaataactttttgaacgattactttattt > 1:3167066‑M1/1‑19 (MQ=255) | CGCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen36_28/1526‑1675 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |