| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen36_23 | 1 = | 0 (0.000) | 428 (0.730) | 106/192 | 0.9 | 100% | intergenic (–/+1574) | –/Xen36_02602 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen36_30 | = 1165 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 1073 total aligned reads displayed.
ATTTTTTTTAACAACTCTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen36_30/1016‑1218 | gcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcatTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGt < 1:2192545‑M2/101‑1 (MQ=255) ttttAACAACTCTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGtctctc < 1:1200860/150‑1 (MQ=255) ttttAACAACTCTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACCTCTTGtctctc > 1:1262018/1‑150 (MQ=255) gtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcatTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGtctctc > 1:3167426‑M2/45‑150 (MQ=255) ttAACAACTCTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCat < 1:1914074/150‑1 (MQ=255) ttAACAACTCTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCCCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCat < 1:2236837/150‑1 (MQ=255) aacaacTCTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGt < 1:407964/141‑1 (MQ=255) aacaacTCTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCatta > 1:533933/1‑150 (MQ=255) acaacTCTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGtc < 1:1100656/141‑1 (MQ=255) cttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcatTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCattatt > 1:1128703‑M2/39‑150 (MQ=255) cttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcatTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCattatt > 1:82763‑M2/39‑150 (MQ=255) cttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcatTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCattatt < 1:1450308‑M2/112‑1 (MQ=255) caacTCTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAAATTCTTGTCTCTCattatt > 1:1968216/1‑150 (MQ=255) ttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcatTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGCCCATTGTAAACTTCTTGTCTCtcattatca > 1:1940324‑M2/38‑148 (MQ=255) ttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcatTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGtctc > 1:2569311‑M2/38‑141 (MQ=255) ttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcatTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCAttatta > 1:2093299‑M2/38‑150 (MQ=255) ttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcatTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCAttatta > 1:1573827‑M2/38‑150 (MQ=255) ttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcatTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTATTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCAttatta > 1:3283452‑M2/38‑150 (MQ=255) tttgttgctgACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCCCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAg > 1:162560/9‑150 (MQ=11) gatgttgACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCtt < 1:662919/148‑1 (MQ=255) gttgACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTctt > 1:936077/1‑148 (MQ=255) gctgACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGt < 1:89506/148‑1 (MQ=255) ttgACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGtt < 1:1355045/150‑1 (MQ=255) ctgACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGtt < 1:1001416/149‑1 (MQ=255) tgACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGttt < 1:2596079/150‑1 (MQ=255) tgACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGttt < 1:2059541/150‑1 (MQ=255) tgACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGttt > 1:2988627/1‑150 (MQ=255) ccATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTacc > 1:806107/1‑148 (MQ=255) ccATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAAc > 1:2905815/1‑150 (MQ=255) cATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACt < 1:3528613/150‑1 (MQ=255) cATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACt < 1:3393031/150‑1 (MQ=255) ttGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTGGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACttt > 1:63354/1‑150 (MQ=255) ttGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACttt > 1:3143146/1‑150 (MQ=255) ttGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACttt > 1:1479284/1‑150 (MQ=255) gTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTttg < 1:2961079/150‑1 (MQ=255) gTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTttg < 1:842695/150‑1 (MQ=255) gTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACGTttg < 1:3782870/150‑1 (MQ=255) gTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTttg < 1:1724876/150‑1 (MQ=255) gTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTttg > 1:1506749/1‑150 (MQ=255) gTCAACTTCTTGCCTCTCATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATCATTGGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTttg > 1:725806/1‑150 (MQ=255) tCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTttgt < 1:870678/150‑1 (MQ=255) tCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTttgt < 1:1595366/150‑1 (MQ=255) tCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTttgt < 1:1988893/150‑1 (MQ=12) aaCTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTttgttg > 1:3727774/1‑150 (MQ=38) aaCTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTttgttg > 1:2155016/1‑150 (MQ=38) aCTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTttgttgt > 1:1156981/1‑150 (MQ=255) aCTTCTTGCCTCTCATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTttgttgt > 1:1613380/1‑150 (MQ=255) ttcttGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTttgttgttg > 1:267163/1‑150 (MQ=25) ttcttGCCTCTCATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTttgttgttg < 1:2275230/150‑1 (MQ=255) ttcttGCCTCGCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTttgttgttg < 1:786695/150‑1 (MQ=255) cttGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGAc < 1:1432931/150‑1 (MQ=37) ttgtctctCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGAcc > 1:1338879/5‑150 (MQ=25) ttGCCTCTCATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGAcc > 1:3642306/1‑150 (MQ=255) tgtctctCCTTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCa > 1:1799877/4‑150 (MQ=255) tGCCTCTCATTATCAGCTTCGGTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCa < 1:1854402/150‑1 (MQ=255) gtctctCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTGTTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCAt < 1:466305/148‑1 (MQ=25) ccTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCAtc > 1:1532633/1‑149 (MQ=11) tctcATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGt < 1:107637/150‑1 (MQ=25) tcATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCa > 1:2653635/1‑150 (MQ=25) tcATTATCAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCa > 1:248772/1‑150 (MQ=25) cattatcggttttgTTTAATTTTTGTGGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCaa < 1:921381/137‑1 (MQ=11) ttatcaGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAAct > 1:966961/1‑150 (MQ=25) tattaGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATNGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAActt < 1:3571081/150‑1 (MQ=25) atcaGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAActtc < 1:1761969/147‑1 (MQ=25) atcaGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTCAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAActtc < 1:1899884/147‑1 (MQ=255) taGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAActagat > 1:3023187/1‑146 (MQ=25) taGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAActagat > 1:484813/1‑146 (MQ=25) aGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGGCCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTg < 1:2834640/150‑1 (MQ=25) cGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctct > 1:2347963‑M2/1‑92 (MQ=255) gTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctc < 1:122596‑M2/150‑60 (MQ=255) gTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctc < 1:1821602‑M2/150‑60 (MQ=255) cTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattatt < 1:2136407‑M2/150‑66 (MQ=255) ttttGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattatta < 1:2759941‑M2/150‑67 (MQ=255) ttgttgttgACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagc > 1:1050871‑M2/1‑82 (MQ=255) gACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTATCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgttta > 1:581566‑M2/1‑74 (MQ=255) ccATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttcacttttgttgttgaccattgtcaacttcttttctctcattattagcttcgtttcac < 1:2025387‑M2/150‑79 (MQ=255) ccATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaac > 1:238809‑M2/1‑72 (MQ=255) ccATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtatctcattattagcttcgtttaac < 1:3325583‑M2/150‑79 (MQ=255) ccATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCa > 1:344405/1‑117 (MQ=38) ttGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttt < 1:709461‑M2/150‑82 (MQ=255) gTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttttg < 1:1661329‑M2/150‑84 (MQ=255) tCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttttgt > 1:3608787‑M2/1‑66 (MQ=255) tCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCCTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttttgt > 1:1419978‑M2/1‑66 (MQ=255) cAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttttgtt < 1:1305341‑M2/150‑86 (MQ=255) aCTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttttgttgt > 1:1387855‑M2/1‑63 (MQ=255) tcttGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttga < 1:241538‑M2/150‑91 (MQ=255) tcttGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttga > 1:562868‑M2/1‑60 (MQ=255) tcttGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttga < 1:368654‑M2/150‑91 (MQ=255) ccTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccatt > 1:2714864‑M2/1‑55 (MQ=255) ctctCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattg > 1:3231989‑M2/1‑54 (MQ=255) ctctCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattg < 1:2290921‑M2/150‑97 (MQ=255) tctcATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtc < 1:3253314‑M2/108‑56 (MQ=255) ctcATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtc < 1:3087936‑M2/150‑99 (MQ=255) tcATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtca > 1:753551‑M2/1‑51 (MQ=255) tcATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtca > 1:1285651‑M2/1‑51 (MQ=255) attattAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAATTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaac > 1:1030331‑M2/1‑49 (MQ=255) ttaGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttct > 1:437419‑M2/1‑45 (MQ=255) tttAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctaattactagcctcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaactt < 1:1701642‑M2/139‑104 (MQ=255) ttttGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtc > 1:1176495‑M2/1‑30 (MQ=255) ccATTGTCAACTTCTTGTctctcattattagcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaac > 1:3478333‑M2/1‑18 (MQ=255) | ATTTTTTTTAACAACTCTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGCCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGCTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen36_30/1016‑1218 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |