| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | Xen36_30 | = 1165 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 428 total aligned reads displayed.
CAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen36_23/137‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caagaagttgacaatggtcaacaacaaaagttaaacgaagctaataatgagagACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGC < Xen36_30/1165‑1070 AGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATG > 1:2385089/1‑150 GTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGG > 1:3478333/1‑150 CTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAACGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAA > 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1:3233895/150‑1 TAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTT > 1:2656382/1‑150 AATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAANAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTA < 1:3571115/150‑1 ATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACGAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAA < 1:2151188/150‑1 TGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAA < 1:1034603/150‑1 TGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAA < 1:625269/150‑1 TGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAA > 1:1539000/1‑150 GAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAAC < 1:2602726/150‑1 GAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAAC < 1:2582120/150‑1 GAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAAC < 1:1821602/150‑1 AGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCA < 1:739201/133‑1 GACAAGAAGTTGATAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAG > 1:754219/1‑150 GACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAG > 1:2296279/1‑150 ACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATATTGAGAGGCAAGAAGTTGACAACGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGC < 1:3258141/150‑1 ACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGC > 1:3371278/1‑150 ACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGC < 1:2934148/150‑1 ACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGC < 1:2280609/150‑1 ACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGC < 1:2128362/150‑1 ACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGC > 1:1717724/1‑150 CAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGACAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen36_23/137‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caagaagttgacaatggtcaacaacaaaagttaaacgaagctaataatgagagACAAGAAGTTGACAATGGTCAGCAACAAAAGTTAAACGAAGCTAATAATGAGAGGCAAGAAGTTGACAATGGTCAACAACAAAAGTTAAACGAAGC < Xen36_30/1165‑1070 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |